194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1150 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1150  hypothetical protein  100 
 
 		 847 aa  1613    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0698  hypothetical protein  50.3 
 
 		 833 aa  640    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0124  hypothetical protein  50 
 
 		 831 aa  637    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0544905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1394  hypothetical protein  39.75 
 
 		 858 aa  490  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.472262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4056  protein of unknown function DUF214  36.76 
 
 		 847 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  35.9 
 
 		 856 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0199  hypothetical protein  36.97 
 
 		 851 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0099  hypothetical protein  36.15 
 
 		 849 aa  463  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0087  ABC transporter, permease protein  36.79 
 
 		 849 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3733  protein of unknown function DUF214  36.86 
 
 		 847 aa  459  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5469  hypothetical protein  37.97 
 
 		 862 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18562  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4181  hypothetical protein  36.61 
 
 		 848 aa  450  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.821525  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0530  hypothetical protein  35.75 
 
 		 864 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1016  hypothetical protein  38.9 
 
 		 858 aa  450  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331004  normal  0.145704 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0085  ABC transporter, permease protein  36.9 
 
 		 849 aa  444  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0286  hypothetical protein  35.63 
 
 		 860 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463422  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0387  putative ABC transporter, permease protein  35.89 
 
 		 856 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3352  hypothetical protein  37.44 
 
 		 869 aa  436  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0550  hypothetical protein  37.2 
 
 		 858 aa  432  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3075  hypothetical protein  37.72 
 
 		 863 aa  432  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1778  protein of unknown function DUF214  37.04 
 
 		 863 aa  425  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1757  hypothetical protein  38.41 
 
 		 851 aa  426  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0414  hypothetical protein  37.34 
 
 		 851 aa  421  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.336355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1671  protein of unknown function DUF214  34.9 
 
 		 844 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0107522  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2226  protein of unknown function DUF214  36.69 
 
 		 862 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0961704 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0829  hypothetical protein  34.85 
 
 		 871 aa  400  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270904  normal  0.305315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2544  protein of unknown function DUF214  35.99 
 
 		 860 aa  396  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519388  normal  0.0357395 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3653  hypothetical protein  38.7 
 
 		 847 aa  396  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2269  hypothetical protein  35.87 
 
 		 892 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2679  putative ABC transporter permease  34.03 
 
 		 842 aa  376  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0339343  normal  0.926867 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2222  protein of unknown function DUF214  31.17 
 
 		 935 aa  365  2e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2271  hypothetical protein  35.5 
 
 		 842 aa  363  1e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276468  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3957  hypothetical protein  34 
 
 		 835 aa  351  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1913  protein of unknown function DUF214  34.33 
 
 		 882 aa  349  1e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.549699 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3288  hypothetical protein  33.96 
 
 		 835 aa  346  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3603  eflux ABC transporter inner membrane protein  33.84 
 
 		 835 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.217562  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1929  protein of unknown function DUF214  34.3 
 
 		 864 aa  323  8e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316143  normal  0.35107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1276  hypothetical protein  35.16 
 
 		 838 aa  322  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53995  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0411  hypothetical protein  30.44 
 
 		 852 aa  312  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.773219  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  27.62 
 
 		 829 aa  246  9e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  29.89 
 
 		 835 aa  240  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6498  protein of unknown function DUF214  27.56 
 
 		 835 aa  237  6e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  30.81 
 
 		 838 aa  228  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  28 
 
 		 841 aa  227  6e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  29.55 
 
 		 838 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1597  protein of unknown function DUF214  26.08 
 
 		 861 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0542  protein of unknown function DUF214  29.88 
 
 		 843 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  25.89 
 
 		 835 aa  213  9e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1399  ABC transporter, permease protein  29.27 
 
 		 830 aa  213  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  30.13 
 
 		 840 aa  209  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2618  hypothetical protein  29.53 
 
 		 842 aa  207  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.855589  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2110  protein of unknown function DUF214  26.33 
 
 		 833 aa  204  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1273  efflux ABC transporter permease  28.07 
 
 		 809 aa  203  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.924579 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  29.44 
 
 		 831 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  27.57 
 
 		 861 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0287  predicted permease  25.59 
 
 		 815 aa  202  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2957  hypothetical protein  25.91 
 
 		 810 aa  202  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133946  normal  0.10767 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3019  efflux ABC transporter, permease protein  27.71 
 
 		 809 aa  202  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00602267  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3157  hypothetical protein  27.59 
 
 		 809 aa  199  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.513308  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2015  hypothetical protein  28.03 
 
 		 844 aa  197  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2108  protein of unknown function DUF214  25.89 
 
 		 832 aa  196  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  28.37 
 
 		 826 aa  195  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1046  hypothetical protein  27.66 
 
 		 828 aa  195  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2785  protein of unknown function DUF214  28.18 
 
 		 857 aa  194  7e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.482364  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  26.26 
 
 		 832 aa  194  7e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  26.72 
 
 		 870 aa  194  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  25.72 
 
 		 804 aa  194  8e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3255  hypothetical protein  28.59 
 
 		 839 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0335123  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4056  protein of unknown function DUF214  28.86 
 
 		 838 aa  191  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2414  hypothetical protein  26.87 
 
 		 832 aa  191  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459172  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  27.2 
 
 		 860 aa  190  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  28.22 
 
 		 858 aa  190  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  26.33 
 
 		 827 aa  189  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3458  hypothetical protein  27.94 
 
 		 857 aa  188  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.840481  normal  0.470717 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1602  hypothetical protein  30 
 
 		 874 aa  187  9e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000566259 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0810  putative transmembrane protein  28.95 
 
 		 856 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0722  hypothetical protein  26.04 
 
 		 815 aa  186  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000480127  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00447  predicted inner membrane protein  25.8 
 
 		 804 aa  185  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00452  hypothetical protein  25.8 
 
 		 804 aa  185  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1029  hypothetical protein  29.64 
 
 		 869 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3120  hypothetical protein  25.8 
 
 		 804 aa  185  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749019 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1159  hypothetical protein  26.9 
 
 		 810 aa  184  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184343 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0572  efflux ABC transporter permease  27.21 
 
 		 804 aa  183  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.868504 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3824  hypothetical protein  29.19 
 
 		 843 aa  183  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936763  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3114  protein of unknown function DUF214  25.68 
 
 		 804 aa  182  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  25.84 
 
 		 836 aa  182  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0600  efflux ABC transporter, permease protein  25.36 
 
 		 804 aa  182  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.77559 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0555  efflux ABC transporter, permease protein  26.96 
 
 		 804 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0575  efflux ABC transporter, permease protein  25.68 
 
 		 804 aa  182  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0545  efflux ABC transporter, permease protein  25.58 
 
 		 804 aa  182  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  28.55 
 
 		 844 aa  182  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0535  efflux ABC transporter, permease protein  25.68 
 
 		 804 aa  182  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0557  efflux ABC transporter permease  27.09 
 
 		 804 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0616  efflux ABC transporter permease  26.6 
 
 		 804 aa  180  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  28.15 
 
 		 843 aa  180  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  28 
 
 		 840 aa  179  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0562  efflux ABC transporter permease protein  27.21 
 
 		 804 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1056  protein of unknown function DUF214  26.54 
 
 		 810 aa  178  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0431  efflux ABC transporter, permease protein  24.94 
 
 		 805 aa  177  7e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3191  protein of unknown function DUF214  26.52 
 
 		 809 aa  174  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0495543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>