291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2108 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2110  protein of unknown function DUF214  92.68 
 
 		 833 aa  1488    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2414  hypothetical protein  56.42 
 
 		 832 aa  869    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459172  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2108  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 832 aa  1663    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0073  hypothetical protein  28.07 
 
 		 884 aa  328  3e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2436  hypothetical protein  28.03 
 
 		 870 aa  298  3e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2115  ABC efflux transporter, fused inner membrane subunits  27.6 
 
 		 882 aa  296  1e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.675122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  27.25 
 
 		 844 aa  259  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  29.43 
 
 		 870 aa  259  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  27.35 
 
 		 841 aa  255  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  28.9 
 
 		 861 aa  252  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  29.3 
 
 		 860 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6498  protein of unknown function DUF214  26.52 
 
 		 835 aa  249  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  27.13 
 
 		 829 aa  247  4.9999999999999997e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  26.78 
 
 		 832 aa  246  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0387  putative ABC transporter, permease protein  25.94 
 
 		 856 aa  246  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1671  protein of unknown function DUF214  27.44 
 
 		 844 aa  243  9e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0107522  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  26.59 
 
 		 843 aa  242  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3653  hypothetical protein  28.86 
 
 		 847 aa  241  5e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2303  hypothetical protein  28.39 
 
 		 871 aa  241  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  27.06 
 
 		 844 aa  240  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1394  hypothetical protein  25.92 
 
 		 858 aa  238  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.472262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1668  hypothetical protein  28.01 
 
 		 871 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2280  hypothetical protein  28.01 
 
 		 871 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1597  protein of unknown function DUF214  25.18 
 
 		 861 aa  234  5e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  28.24 
 
 		 863 aa  232  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2318  hypothetical protein  27.51 
 
 		 871 aa  231  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2196  hypothetical protein  27.38 
 
 		 834 aa  230  8e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0286  hypothetical protein  25.59 
 
 		 860 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463422  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1778  protein of unknown function DUF214  26.03 
 
 		 863 aa  226  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5607  hypothetical protein  28.03 
 
 		 871 aa  225  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5469  hypothetical protein  25.65 
 
 		 862 aa  224  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18562  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0829  hypothetical protein  24.56 
 
 		 871 aa  224  6e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270904  normal  0.305315 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  24.62 
 
 		 856 aa  223  8e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0087  ABC transporter, permease protein  25.52 
 
 		 849 aa  223  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1016  hypothetical protein  24.85 
 
 		 858 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331004  normal  0.145704 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  25.8 
 
 		 840 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4056  protein of unknown function DUF214  25.38 
 
 		 847 aa  221  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0530  hypothetical protein  25.56 
 
 		 864 aa  220  7e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  28.34 
 
 		 831 aa  220  7.999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0199  hypothetical protein  25.46 
 
 		 851 aa  220  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0411  hypothetical protein  24.82 
 
 		 852 aa  219  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.773219  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3733  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 847 aa  217  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2271  hypothetical protein  26.59 
 
 		 842 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276468  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  25.86 
 
 		 858 aa  216  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2785  protein of unknown function DUF214  26.66 
 
 		 857 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.482364  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0099  hypothetical protein  25.09 
 
 		 849 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2679  putative ABC transporter permease  26.01 
 
 		 842 aa  214  7e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0339343  normal  0.926867 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  27.23 
 
 		 869 aa  213  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3824  hypothetical protein  26.4 
 
 		 843 aa  213  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0542  protein of unknown function DUF214  27.59 
 
 		 843 aa  213  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  26.39 
 
 		 835 aa  213  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0085  ABC transporter, permease protein  25.52 
 
 		 849 aa  213  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  27.05 
 
 		 840 aa  211  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0810  putative transmembrane protein  26.95 
 
 		 856 aa  211  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  26.03 
 
 		 835 aa  211  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3458  hypothetical protein  26.41 
 
 		 857 aa  211  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.840481  normal  0.470717 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0287  predicted permease  25.99 
 
 		 815 aa  210  7e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1029  hypothetical protein  27.57 
 
 		 869 aa  209  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4056  protein of unknown function DUF214  24.68 
 
 		 838 aa  207  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3352  hypothetical protein  26.17 
 
 		 869 aa  206  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1399  ABC transporter, permease protein  24.72 
 
 		 830 aa  206  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1251  efflux ABC transporter, permease protein  28.03 
 
 		 883 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1259  efflux ABC transporter, permease protein  28.13 
 
 		 880 aa  206  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356208  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2222  protein of unknown function DUF214  24.73 
 
 		 935 aa  205  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3957  hypothetical protein  26.56 
 
 		 835 aa  205  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1602  hypothetical protein  27.4 
 
 		 874 aa  204  8e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000566259 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4181  hypothetical protein  24.88 
 
 		 848 aa  203  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.821525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2015  hypothetical protein  25.12 
 
 		 844 aa  202  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1400  putative permease  28.35 
 
 		 1108 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0898  hypothetical protein  26.34 
 
 		 851 aa  201  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  26.32 
 
 		 838 aa  200  9e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1757  hypothetical protein  26.03 
 
 		 851 aa  198  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3019  efflux ABC transporter, permease protein  25.39 
 
 		 809 aa  197  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00602267  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3446  ABC transporter, permease protein, putative  25.65 
 
 		 828 aa  197  5.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000339618  hitchhiker  0.000208184 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  25.91 
 
 		 838 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1918  hypothetical protein  25.38 
 
 		 835 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695603  hitchhiker  0.000000000000882803 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3157  hypothetical protein  25.39 
 
 		 809 aa  196  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.513308  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3075  hypothetical protein  24.09 
 
 		 863 aa  196  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1273  efflux ABC transporter permease  25.26 
 
 		 809 aa  195  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.924579 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23050  hypothetical protein  26.73 
 
 		 833 aa  193  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.636342  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3603  eflux ABC transporter inner membrane protein  26.64 
 
 		 835 aa  193  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.217562  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3288  hypothetical protein  26.41 
 
 		 835 aa  193  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  25.1 
 
 		 826 aa  193  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3255  hypothetical protein  25.43 
 
 		 839 aa  192  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0335123  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2544  protein of unknown function DUF214  25.27 
 
 		 860 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519388  normal  0.0357395 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0414  hypothetical protein  24.01 
 
 		 851 aa  192  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.336355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2269  hypothetical protein  25.38 
 
 		 892 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2209  hypothetical protein  23.56 
 
 		 819 aa  191  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.795386  normal  0.224518 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2618  hypothetical protein  26.4 
 
 		 842 aa  191  5e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.855589  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0550  hypothetical protein  24.88 
 
 		 858 aa  189  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2957  hypothetical protein  25.89 
 
 		 810 aa  188  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133946  normal  0.10767 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  23.85 
 
 		 836 aa  187  8e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1159  hypothetical protein  26.17 
 
 		 810 aa  186  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184343 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  23.68 
 
 		 842 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4016  hypothetical protein  25.81 
 
 		 834 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401086  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2316  hypothetical protein  24.74 
 
 		 832 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000697167 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0533  hypothetical protein  25.03 
 
 		 840 aa  184  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  24.73 
 
 		 804 aa  184  5.0000000000000004e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2226  protein of unknown function DUF214  24.56 
 
 		 862 aa  184  6e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0961704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3453  hypothetical protein  24.71 
 
 		 832 aa  183  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000113684 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>