195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3957 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3603  eflux ABC transporter inner membrane protein  91.26 
 
 		 835 aa  1309    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.217562  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3687  hypothetical protein  62.43 
 
 		 840 aa  855    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2271  hypothetical protein  62.34 
 
 		 842 aa  898    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276468  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2679  putative ABC transporter permease  69.93 
 
 		 842 aa  1035    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0339343  normal  0.926867 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3288  hypothetical protein  91.5 
 
 		 835 aa  1314    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3957  hypothetical protein  100 
 
 		 835 aa  1589    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1394  hypothetical protein  43.68 
 
 		 858 aa  573  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.472262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  40.86 
 
 		 856 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0087  ABC transporter, permease protein  41.18 
 
 		 849 aa  535  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4181  hypothetical protein  42.15 
 
 		 848 aa  533  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.821525  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0530  hypothetical protein  39.67 
 
 		 864 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3075  hypothetical protein  42.26 
 
 		 863 aa  528  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0099  hypothetical protein  39.88 
 
 		 849 aa  522  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0387  putative ABC transporter, permease protein  40.02 
 
 		 856 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0829  hypothetical protein  42.1 
 
 		 871 aa  515  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270904  normal  0.305315 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4056  protein of unknown function DUF214  40.36 
 
 		 847 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3733  protein of unknown function DUF214  41.07 
 
 		 847 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0199  hypothetical protein  40.87 
 
 		 851 aa  512  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3352  hypothetical protein  42.38 
 
 		 869 aa  507  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0085  ABC transporter, permease protein  41.07 
 
 		 849 aa  508  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0286  hypothetical protein  39.91 
 
 		 860 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463422  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5469  hypothetical protein  41.14 
 
 		 862 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18562  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0550  hypothetical protein  40.21 
 
 		 858 aa  495  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1016  hypothetical protein  40.2 
 
 		 858 aa  492  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331004  normal  0.145704 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0414  hypothetical protein  40.66 
 
 		 851 aa  489  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.336355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1778  protein of unknown function DUF214  41.19 
 
 		 863 aa  488  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1757  hypothetical protein  42.52 
 
 		 851 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2269  hypothetical protein  40.54 
 
 		 892 aa  450  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3653  hypothetical protein  40.84 
 
 		 847 aa  450  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2226  protein of unknown function DUF214  40.59 
 
 		 862 aa  452  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0961704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2544  protein of unknown function DUF214  40.54 
 
 		 860 aa  451  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519388  normal  0.0357395 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0411  hypothetical protein  36.93 
 
 		 852 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.773219  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1671  protein of unknown function DUF214  36.41 
 
 		 844 aa  444  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0107522  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2222  protein of unknown function DUF214  34.16 
 
 		 935 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0698  hypothetical protein  36.08 
 
 		 833 aa  410  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1913  protein of unknown function DUF214  39.1 
 
 		 882 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.549699 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0124  hypothetical protein  37.94 
 
 		 831 aa  403  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0544905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1276  hypothetical protein  39.03 
 
 		 838 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53995  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1929  protein of unknown function DUF214  35.07 
 
 		 864 aa  366  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316143  normal  0.35107 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1150  hypothetical protein  34.11 
 
 		 847 aa  310  9e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  29.63 
 
 		 835 aa  246  9e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  29.38 
 
 		 832 aa  239  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2414  hypothetical protein  29.91 
 
 		 832 aa  234  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459172  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2108  protein of unknown function DUF214  27.19 
 
 		 832 aa  233  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  29.02 
 
 		 841 aa  229  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2110  protein of unknown function DUF214  27.34 
 
 		 833 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  27.8 
 
 		 829 aa  219  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6498  protein of unknown function DUF214  27.32 
 
 		 835 aa  218  5e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  30.84 
 
 		 870 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  27.61 
 
 		 835 aa  206  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  32.45 
 
 		 861 aa  206  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  29.82 
 
 		 844 aa  203  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  25.39 
 
 		 842 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  32.69 
 
 		 860 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2896  hypothetical protein  26.35 
 
 		 821 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431502 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  29.5 
 
 		 843 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  29.74 
 
 		 826 aa  190  8e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  29.17 
 
 		 844 aa  189  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1046  hypothetical protein  28.52 
 
 		 828 aa  188  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  26.57 
 
 		 840 aa  187  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1029  hypothetical protein  32.69 
 
 		 869 aa  187  9e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3446  ABC transporter, permease protein, putative  25.53 
 
 		 828 aa  185  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000339618  hitchhiker  0.000208184 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  28.1 
 
 		 827 aa  182  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  30.7 
 
 		 863 aa  182  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2618  hypothetical protein  28.52 
 
 		 842 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.855589  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1602  hypothetical protein  29.44 
 
 		 874 aa  182  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000566259 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0810  putative transmembrane protein  30.39 
 
 		 856 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  30.18 
 
 		 869 aa  181  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  28.08 
 
 		 858 aa  181  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1545  hypothetical protein  25.98 
 
 		 833 aa  179  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1251  efflux ABC transporter, permease protein  32.11 
 
 		 883 aa  179  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  27.5 
 
 		 840 aa  178  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1259  efflux ABC transporter, permease protein  32.11 
 
 		 880 aa  178  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356208  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1480  hypothetical protein  25.85 
 
 		 833 aa  177  8e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1399  ABC transporter, permease protein  27.79 
 
 		 830 aa  177  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1400  putative permease  32.11 
 
 		 1108 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1539  hypothetical protein  25.72 
 
 		 833 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274903 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1597  protein of unknown function DUF214  23.41 
 
 		 861 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0898  hypothetical protein  29.35 
 
 		 851 aa  174  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5607  hypothetical protein  31.21 
 
 		 871 aa  173  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616708  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  23.38 
 
 		 836 aa  172  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2115  ABC efflux transporter, fused inner membrane subunits  24.19 
 
 		 882 aa  171  5e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.675122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2015  hypothetical protein  29.22 
 
 		 844 aa  171  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2303  hypothetical protein  31.1 
 
 		 871 aa  171  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1668  hypothetical protein  31.1 
 
 		 871 aa  171  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2280  hypothetical protein  31.1 
 
 		 871 aa  171  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1698  hypothetical protein  25.15 
 
 		 823 aa  169  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.405062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4056  protein of unknown function DUF214  28.75 
 
 		 838 aa  169  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0722  hypothetical protein  24.41 
 
 		 815 aa  169  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000480127  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2436  hypothetical protein  24.19 
 
 		 870 aa  167  5e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3191  protein of unknown function DUF214  25.7 
 
 		 809 aa  168  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0495543  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0600  efflux ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 804 aa  167  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.77559 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2318  hypothetical protein  30.92 
 
 		 871 aa  167  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2196  hypothetical protein  31.21 
 
 		 834 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0572  efflux ABC transporter permease  26.99 
 
 		 804 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.868504 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0557  efflux ABC transporter permease  26.99 
 
 		 804 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1124  hypothetical protein  25.33 
 
 		 809 aa  165  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.101154  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0562  efflux ABC transporter permease protein  26.99 
 
 		 804 aa  165  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  27.58 
 
 		 831 aa  165  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  25.27 
 
 		 804 aa  164  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>