More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1597 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1597  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 861 aa  1743    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6498  protein of unknown function DUF214  52.14 
 
 		 835 aa  833    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0542  protein of unknown function DUF214  41.92 
 
 		 843 aa  581  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  40.19 
 
 		 841 aa  571  1e-161  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  27.17 
 
 		 860 aa  257  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  26.48 
 
 		 835 aa  253  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1918  hypothetical protein  26.58 
 
 		 835 aa  251  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695603  hitchhiker  0.000000000000882803 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  26.45 
 
 		 861 aa  251  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1394  hypothetical protein  26.94 
 
 		 858 aa  250  8e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.472262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4016  hypothetical protein  27.97 
 
 		 834 aa  250  9e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401086  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  25.3 
 
 		 843 aa  249  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  26.2 
 
 		 870 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  27.62 
 
 		 838 aa  245  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  25.39 
 
 		 844 aa  245  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2303  hypothetical protein  25.63 
 
 		 871 aa  244  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  26.46 
 
 		 844 aa  243  9e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  26.48 
 
 		 829 aa  243  9e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2414  hypothetical protein  25.44 
 
 		 832 aa  243  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459172  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5469  hypothetical protein  25.09 
 
 		 862 aa  242  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18562  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0124  hypothetical protein  27.42 
 
 		 831 aa  241  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0544905  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  27.67 
 
 		 838 aa  240  8e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  26.05 
 
 		 835 aa  239  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1668  hypothetical protein  25.35 
 
 		 871 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2280  hypothetical protein  25.35 
 
 		 871 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  25.1 
 
 		 863 aa  239  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2110  protein of unknown function DUF214  26.14 
 
 		 833 aa  239  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2108  protein of unknown function DUF214  25.18 
 
 		 832 aa  239  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4056  protein of unknown function DUF214  26.22 
 
 		 847 aa  238  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5607  hypothetical protein  25.78 
 
 		 871 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2318  hypothetical protein  25.25 
 
 		 871 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  24.83 
 
 		 856 aa  234  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  26.62 
 
 		 840 aa  234  8.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2316  hypothetical protein  26.64 
 
 		 832 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000697167 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  26.44 
 
 		 840 aa  231  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1399  ABC transporter, permease protein  25.58 
 
 		 830 aa  231  5e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2196  hypothetical protein  24.87 
 
 		 834 aa  231  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0829  hypothetical protein  25.92 
 
 		 871 aa  231  6e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270904  normal  0.305315 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27140  hypothetical protein  27.42 
 
 		 830 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3453  hypothetical protein  26.56 
 
 		 832 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000113684 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3075  hypothetical protein  26.21 
 
 		 863 aa  223  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2015  hypothetical protein  24.88 
 
 		 844 aa  223  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0087  ABC transporter, permease protein  24.83 
 
 		 849 aa  222  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1602  hypothetical protein  25.63 
 
 		 874 aa  221  5e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000566259 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0099  hypothetical protein  25.03 
 
 		 849 aa  219  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1671  protein of unknown function DUF214  24.05 
 
 		 844 aa  219  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0107522  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  24.82 
 
 		 869 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0810  putative transmembrane protein  25.55 
 
 		 856 aa  218  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3733  protein of unknown function DUF214  26.16 
 
 		 847 aa  218  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1016  hypothetical protein  25.27 
 
 		 858 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331004  normal  0.145704 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23050  hypothetical protein  25.99 
 
 		 833 aa  216  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.636342  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  26.36 
 
 		 826 aa  216  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2560  hypothetical protein  26.33 
 
 		 834 aa  212  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00315514  hitchhiker  0.00000000000119307 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  25.15 
 
 		 840 aa  211  4e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  25.25 
 
 		 842 aa  211  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2222  protein of unknown function DUF214  24.82 
 
 		 935 aa  211  5e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2785  protein of unknown function DUF214  25.18 
 
 		 857 aa  210  8e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.482364  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0530  hypothetical protein  24.13 
 
 		 864 aa  210  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1758  hypothetical protein  26.78 
 
 		 835 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293557  hitchhiker  0.00000000277599 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  24.08 
 
 		 832 aa  209  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3157  hypothetical protein  27.71 
 
 		 809 aa  209  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.513308  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1259  efflux ABC transporter, permease protein  24.94 
 
 		 880 aa  208  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356208  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1251  efflux ABC transporter, permease protein  25.1 
 
 		 883 aa  207  7e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1273  efflux ABC transporter permease  27.14 
 
 		 809 aa  206  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.924579 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0085  ABC transporter, permease protein  24.48 
 
 		 849 aa  206  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1029  hypothetical protein  25.03 
 
 		 869 aa  206  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3255  hypothetical protein  25.21 
 
 		 839 aa  206  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0335123  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3019  efflux ABC transporter, permease protein  27.59 
 
 		 809 aa  207  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00602267  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1400  putative permease  24.87 
 
 		 1108 aa  205  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0286  hypothetical protein  24.01 
 
 		 860 aa  205  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463422  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3458  hypothetical protein  24.94 
 
 		 857 aa  205  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.840481  normal  0.470717 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3352  hypothetical protein  25.94 
 
 		 869 aa  204  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0387  putative ABC transporter, permease protein  22.74 
 
 		 856 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2226  protein of unknown function DUF214  23.69 
 
 		 862 aa  202  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0961704 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3446  ABC transporter, permease protein, putative  24.61 
 
 		 828 aa  202  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000339618  hitchhiker  0.000208184 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0199  hypothetical protein  23.22 
 
 		 851 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4181  hypothetical protein  25.17 
 
 		 848 aa  201  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.821525  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  25.96 
 
 		 827 aa  201  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  26.41 
 
 		 831 aa  201  5e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  25.67 
 
 		 804 aa  200  7.999999999999999e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0411  hypothetical protein  25.37 
 
 		 852 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.773219  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2209  hypothetical protein  24.71 
 
 		 819 aa  198  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.795386  normal  0.224518 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0545  efflux ABC transporter, permease protein  25.75 
 
 		 804 aa  198  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0898  hypothetical protein  24.55 
 
 		 851 aa  197  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0600  efflux ABC transporter, permease protein  25.75 
 
 		 804 aa  197  9e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.77559 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3114  protein of unknown function DUF214  25.5 
 
 		 804 aa  196  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0535  efflux ABC transporter, permease protein  25.5 
 
 		 804 aa  195  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0575  efflux ABC transporter, permease protein  25.37 
 
 		 804 aa  195  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3120  hypothetical protein  25.25 
 
 		 804 aa  193  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749019 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2618  hypothetical protein  25 
 
 		 842 aa  192  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.855589  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00447  predicted inner membrane protein  25.34 
 
 		 804 aa  192  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0944  hypothetical protein  24.17 
 
 		 853 aa  192  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.69332 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00452  hypothetical protein  25.34 
 
 		 804 aa  192  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0431  efflux ABC transporter, permease protein  25.37 
 
 		 805 aa  191  5e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4056  protein of unknown function DUF214  23.76 
 
 		 838 aa  190  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2271  hypothetical protein  24.23 
 
 		 842 aa  189  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276468  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2957  hypothetical protein  23.63 
 
 		 810 aa  189  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133946  normal  0.10767 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0616  efflux ABC transporter permease  26 
 
 		 804 aa  187  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0562  efflux ABC transporter permease protein  25.26 
 
 		 804 aa  187  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0008  protein of unknown function DUF214  26.08 
 
 		 836 aa  187  7e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0572  efflux ABC transporter permease  25.73 
 
 		 804 aa  187  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.868504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>