More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6498 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6498  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 835 aa  1654    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1597  protein of unknown function DUF214  52.08 
 
 		 861 aa  833    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  45.07 
 
 		 841 aa  645    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0542  protein of unknown function DUF214  46.14 
 
 		 843 aa  610  1e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1394  hypothetical protein  27.13 
 
 		 858 aa  273  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.472262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2414  hypothetical protein  28.25 
 
 		 832 aa  270  7e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459172  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0829  hypothetical protein  28.48 
 
 		 871 aa  261  3e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270904  normal  0.305315 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  26.21 
 
 		 844 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  27.98 
 
 		 835 aa  258  3e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  28.06 
 
 		 840 aa  258  4e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1016  hypothetical protein  27.44 
 
 		 858 aa  258  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331004  normal  0.145704 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  30.04 
 
 		 838 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4056  protein of unknown function DUF214  27.68 
 
 		 847 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2108  protein of unknown function DUF214  27 
 
 		 832 aa  254  5.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  27.42 
 
 		 842 aa  252  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  28.27 
 
 		 870 aa  251  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0124  hypothetical protein  29.1 
 
 		 831 aa  251  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0544905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3019  efflux ABC transporter, permease protein  29.6 
 
 		 809 aa  251  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00602267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2110  protein of unknown function DUF214  27.34 
 
 		 833 aa  250  6e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3157  hypothetical protein  29.39 
 
 		 809 aa  250  9e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.513308  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1778  protein of unknown function DUF214  27.02 
 
 		 863 aa  249  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  30.16 
 
 		 838 aa  248  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  26.47 
 
 		 856 aa  248  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3075  hypothetical protein  27.52 
 
 		 863 aa  248  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5469  hypothetical protein  26.77 
 
 		 862 aa  248  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18562  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  26.21 
 
 		 844 aa  247  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0530  hypothetical protein  26.4 
 
 		 864 aa  247  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1273  efflux ABC transporter permease  29.35 
 
 		 809 aa  244  7e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.924579 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0286  hypothetical protein  26.31 
 
 		 860 aa  243  9e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463422  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0099  hypothetical protein  26.64 
 
 		 849 aa  243  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  26.42 
 
 		 832 aa  240  5.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3733  protein of unknown function DUF214  27.56 
 
 		 847 aa  240  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454912  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  25.03 
 
 		 843 aa  238  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0387  putative ABC transporter, permease protein  25.68 
 
 		 856 aa  237  9e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2785  protein of unknown function DUF214  28.08 
 
 		 857 aa  236  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.482364  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0199  hypothetical protein  25.84 
 
 		 851 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2015  hypothetical protein  27.29 
 
 		 844 aa  234  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1124  hypothetical protein  28.35 
 
 		 809 aa  235  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.101154  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  26.45 
 
 		 829 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  27.19 
 
 		 863 aa  234  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2544  protein of unknown function DUF214  27.87 
 
 		 860 aa  234  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519388  normal  0.0357395 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4181  hypothetical protein  26.72 
 
 		 848 aa  234  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.821525  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  28.46 
 
 		 804 aa  234  7.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  26.24 
 
 		 835 aa  233  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  27.9 
 
 		 861 aa  232  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  25.89 
 
 		 869 aa  231  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3458  hypothetical protein  27.97 
 
 		 857 aa  231  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.840481  normal  0.470717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2269  hypothetical protein  27.71 
 
 		 892 aa  230  7e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3191  protein of unknown function DUF214  28.1 
 
 		 809 aa  230  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0495543  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4016  hypothetical protein  29.15 
 
 		 834 aa  229  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401086  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1671  protein of unknown function DUF214  25.45 
 
 		 844 aa  228  5.0000000000000005e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0107522  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2303  hypothetical protein  26.52 
 
 		 871 aa  228  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  27.91 
 
 		 860 aa  228  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1668  hypothetical protein  26.61 
 
 		 871 aa  225  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2280  hypothetical protein  26.61 
 
 		 871 aa  225  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0087  ABC transporter, permease protein  25.67 
 
 		 849 aa  224  4.9999999999999996e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2618  hypothetical protein  28.68 
 
 		 842 aa  224  7e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.855589  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3255  hypothetical protein  28.34 
 
 		 839 aa  223  9e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0335123  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0572  efflux ABC transporter permease  28.14 
 
 		 804 aa  223  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.868504 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2209  hypothetical protein  29.19 
 
 		 819 aa  222  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.795386  normal  0.224518 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5607  hypothetical protein  26.52 
 
 		 871 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0555  efflux ABC transporter, permease protein  28.01 
 
 		 804 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2226  protein of unknown function DUF214  27.46 
 
 		 862 aa  221  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0961704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0616  efflux ABC transporter permease  27.89 
 
 		 804 aa  220  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0411  hypothetical protein  26.05 
 
 		 852 aa  220  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.773219  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0898  hypothetical protein  27.09 
 
 		 851 aa  220  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0557  efflux ABC transporter permease  27.89 
 
 		 804 aa  219  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0810  putative transmembrane protein  27.77 
 
 		 856 aa  219  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0550  hypothetical protein  25.39 
 
 		 858 aa  219  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1602  hypothetical protein  27.32 
 
 		 874 aa  218  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000566259 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0414  hypothetical protein  25.53 
 
 		 851 aa  218  5e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.336355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2196  hypothetical protein  25.6 
 
 		 834 aa  217  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0562  efflux ABC transporter permease protein  27.89 
 
 		 804 aa  217  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  26.89 
 
 		 840 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1056  protein of unknown function DUF214  28.41 
 
 		 810 aa  215  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2318  hypothetical protein  25.74 
 
 		 871 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1159  hypothetical protein  28.29 
 
 		 810 aa  214  4.9999999999999996e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27140  hypothetical protein  29.5 
 
 		 830 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0287  predicted permease  25.03 
 
 		 815 aa  213  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1259  efflux ABC transporter, permease protein  27.91 
 
 		 880 aa  213  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356208  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1251  efflux ABC transporter, permease protein  27.93 
 
 		 883 aa  213  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1913  protein of unknown function DUF214  26.04 
 
 		 882 aa  213  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.549699 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1029  hypothetical protein  27.65 
 
 		 869 aa  212  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  26.19 
 
 		 826 aa  212  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0545  efflux ABC transporter, permease protein  26.68 
 
 		 804 aa  211  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1400  putative permease  28.17 
 
 		 1108 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0600  efflux ABC transporter, permease protein  26.56 
 
 		 804 aa  209  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.77559 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1757  hypothetical protein  26.06 
 
 		 851 aa  209  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3114  protein of unknown function DUF214  26.56 
 
 		 804 aa  208  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0535  efflux ABC transporter, permease protein  26.56 
 
 		 804 aa  208  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0575  efflux ABC transporter, permease protein  26.56 
 
 		 804 aa  207  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2957  hypothetical protein  25.55 
 
 		 810 aa  207  5e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133946  normal  0.10767 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00447  predicted inner membrane protein  26.56 
 
 		 804 aa  207  6e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00452  hypothetical protein  26.56 
 
 		 804 aa  207  6e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0085  ABC transporter, permease protein  25.44 
 
 		 849 aa  207  6e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3120  hypothetical protein  26.44 
 
 		 804 aa  206  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749019 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3352  hypothetical protein  26.66 
 
 		 869 aa  204  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0431  efflux ABC transporter, permease protein  26.52 
 
 		 805 aa  203  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  24.51 
 
 		 840 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2271  hypothetical protein  26.03 
 
 		 842 aa  202  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276468  normal  0.445258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>