201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0898 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  65.84 
 
 		 843 aa  987    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  66.9 
 
 		 844 aa  1003    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  83.27 
 
 		 869 aa  1275    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2785  protein of unknown function DUF214  49.7 
 
 		 857 aa  636    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.482364  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1400  putative permease  53.9 
 
 		 1108 aa  701    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5607  hypothetical protein  54.35 
 
 		 871 aa  748    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1029  hypothetical protein  54.25 
 
 		 869 aa  719    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2015  hypothetical protein  48.7 
 
 		 844 aa  655    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3255  hypothetical protein  47.98 
 
 		 839 aa  657    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0335123  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0944  hypothetical protein  48.65 
 
 		 853 aa  654    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.69332 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  53.5 
 
 		 860 aa  774    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0898  hypothetical protein  100 
 
 		 851 aa  1678    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1668  hypothetical protein  53.87 
 
 		 871 aa  744    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2318  hypothetical protein  53.75 
 
 		 871 aa  724    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2280  hypothetical protein  53.87 
 
 		 871 aa  744    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  47.89 
 
 		 858 aa  659    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0810  putative transmembrane protein  51 
 
 		 856 aa  671    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2196  hypothetical protein  53.48 
 
 		 834 aa  716    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1251  efflux ABC transporter, permease protein  53.71 
 
 		 883 aa  700    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1259  efflux ABC transporter, permease protein  53.9 
 
 		 880 aa  702    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356208  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  44.97 
 
 		 832 aa  651    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  53.28 
 
 		 863 aa  733    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  65.96 
 
 		 844 aa  1011    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  53.64 
 
 		 861 aa  768    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2303  hypothetical protein  54.35 
 
 		 871 aa  759    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  53.4 
 
 		 870 aa  787    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3458  hypothetical protein  49.58 
 
 		 857 aa  632  1e-180  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.840481  normal  0.470717 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1602  hypothetical protein  48.78 
 
 		 874 aa  630  1e-179  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000566259 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  45.45 
 
 		 840 aa  630  1e-179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  43.5 
 
 		 835 aa  627  1e-178  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3824  hypothetical protein  48.15 
 
 		 843 aa  617  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4056  protein of unknown function DUF214  46.03 
 
 		 838 aa  612  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0533  hypothetical protein  47.54 
 
 		 840 aa  594  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  43.79 
 
 		 827 aa  589  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  38.24 
 
 		 829 aa  526  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  42.23 
 
 		 831 aa  523  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  39.46 
 
 		 835 aa  521  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  40.02 
 
 		 840 aa  511  1e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  40.17 
 
 		 826 aa  500  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1918  hypothetical protein  38.17 
 
 		 835 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695603  hitchhiker  0.000000000000882803 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  37.56 
 
 		 838 aa  487  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27140  hypothetical protein  39.57 
 
 		 830 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  37.15 
 
 		 838 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2316  hypothetical protein  38.57 
 
 		 832 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000697167 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1093  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  54.69 
 
 		 569 aa  475  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0774  hypothetical protein  54.69 
 
 		 569 aa  475  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3453  hypothetical protein  38.63 
 
 		 832 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000113684 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1399  ABC transporter, permease protein  36.86 
 
 		 830 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2296  hypothetical protein  39.22 
 
 		 833 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4016  hypothetical protein  38.44 
 
 		 834 aa  450  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401086  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2560  hypothetical protein  39.18 
 
 		 834 aa  443  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00315514  hitchhiker  0.00000000000119307 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23050  hypothetical protein  38.62 
 
 		 833 aa  439  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.636342  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1758  hypothetical protein  37.98 
 
 		 835 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293557  hitchhiker  0.00000000277599 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2618  hypothetical protein  38.25 
 
 		 842 aa  427  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.855589  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  34.56 
 
 		 840 aa  421  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  31.92 
 
 		 842 aa  412  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  31.05 
 
 		 836 aa  395  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2209  hypothetical protein  31.86 
 
 		 819 aa  394  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.795386  normal  0.224518 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0008  protein of unknown function DUF214  37.48 
 
 		 836 aa  391  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3446  ABC transporter, permease protein, putative  31.1 
 
 		 828 aa  375  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000339618  hitchhiker  0.000208184 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  33.5 
 
 		 804 aa  372  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0649  protein of unknown function DUF214  37.88 
 
 		 838 aa  365  2e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04662  oxidoreductase  38.05 
 
 		 824 aa  359  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0684  hypothetical protein  35.21 
 
 		 829 aa  356  1e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.852275  normal  0.517784 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1046  hypothetical protein  33.96 
 
 		 828 aa  352  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2066  hypothetical protein  36.79 
 
 		 835 aa  350  6e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0616  efflux ABC transporter permease  33.49 
 
 		 804 aa  350  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0535  efflux ABC transporter, permease protein  33.29 
 
 		 804 aa  347  4e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0545  efflux ABC transporter, permease protein  33.17 
 
 		 804 aa  347  6e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0575  efflux ABC transporter, permease protein  33.17 
 
 		 804 aa  346  8.999999999999999e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00447  predicted inner membrane protein  33.17 
 
 		 804 aa  345  1e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3114  protein of unknown function DUF214  33.17 
 
 		 804 aa  346  1e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0555  efflux ABC transporter, permease protein  33.49 
 
 		 804 aa  346  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00452  hypothetical protein  33.17 
 
 		 804 aa  345  1e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0572  efflux ABC transporter permease  33.49 
 
 		 804 aa  346  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.868504 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0557  efflux ABC transporter permease  33.37 
 
 		 804 aa  345  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3120  hypothetical protein  33.17 
 
 		 804 aa  345  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749019 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0600  efflux ABC transporter, permease protein  33.17 
 
 		 804 aa  345  2e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.77559 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0431  efflux ABC transporter, permease protein  33.09 
 
 		 805 aa  344  4e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2896  hypothetical protein  30.7 
 
 		 821 aa  344  5e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431502 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0562  efflux ABC transporter permease protein  33.37 
 
 		 804 aa  343  7e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0551  hypothetical protein  30.58 
 
 		 823 aa  336  1e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.454209  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1698  hypothetical protein  30.55 
 
 		 823 aa  335  2e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.405062 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1273  efflux ABC transporter permease  32.94 
 
 		 809 aa  332  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.924579 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3157  hypothetical protein  32.82 
 
 		 809 aa  331  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.513308  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1124  hypothetical protein  31.22 
 
 		 809 aa  330  9e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.101154  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3019  efflux ABC transporter, permease protein  32.82 
 
 		 809 aa  329  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00602267  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3191  protein of unknown function DUF214  31.1 
 
 		 809 aa  327  8.000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0495543  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1487  ABC transporter, permease, putative  31.36 
 
 		 818 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1539  hypothetical protein  31.3 
 
 		 833 aa  317  9e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274903 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1480  hypothetical protein  31.18 
 
 		 833 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1545  hypothetical protein  31.07 
 
 		 833 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1056  protein of unknown function DUF214  33.21 
 
 		 810 aa  308  4.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2401  hypothetical protein  31.52 
 
 		 816 aa  298  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.678425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1159  hypothetical protein  32.66 
 
 		 810 aa  298  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184343 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3003  protein of unknown function DUF214  33.01 
 
 		 810 aa  297  4e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.558274  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2566  hypothetical protein  31.35 
 
 		 827 aa  297  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0287  predicted permease  28.54 
 
 		 815 aa  297  7e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2707  hypothetical protein  30.43 
 
 		 836 aa  295  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2783  hypothetical protein  30.28 
 
 		 837 aa  291  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.667381  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>