217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5469 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0387  putative ABC transporter, permease protein  53.09 
 
 		 856 aa  792    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0087  ABC transporter, permease protein  51.18 
 
 		 849 aa  773    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5469  hypothetical protein  100 
 
 		 862 aa  1641    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18562  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3075  hypothetical protein  51.06 
 
 		 863 aa  702    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2269  hypothetical protein  69.64 
 
 		 892 aa  991    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0414  hypothetical protein  57.79 
 
 		 851 aa  850    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.336355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3733  protein of unknown function DUF214  51.24 
 
 		 847 aa  728    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1394  hypothetical protein  49.82 
 
 		 858 aa  711    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.472262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0286  hypothetical protein  56.61 
 
 		 860 aa  818    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463422  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0199  hypothetical protein  57.03 
 
 		 851 aa  870    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0530  hypothetical protein  56.11 
 
 		 864 aa  832    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0550  hypothetical protein  56.99 
 
 		 858 aa  837    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3352  hypothetical protein  50.64 
 
 		 869 aa  710    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2226  protein of unknown function DUF214  69.49 
 
 		 862 aa  988    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0961704 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0829  hypothetical protein  55.03 
 
 		 871 aa  787    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270904  normal  0.305315 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  55.88 
 
 		 856 aa  860    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4056  protein of unknown function DUF214  51.35 
 
 		 847 aa  746    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1913  protein of unknown function DUF214  53.83 
 
 		 882 aa  704    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.549699 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1016  hypothetical protein  69.91 
 
 		 858 aa  1065    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331004  normal  0.145704 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1757  hypothetical protein  53.67 
 
 		 851 aa  729    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1778  protein of unknown function DUF214  88.53 
 
 		 863 aa  1358    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4181  hypothetical protein  51.01 
 
 		 848 aa  738    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.821525  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2544  protein of unknown function DUF214  70.1 
 
 		 860 aa  1001    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519388  normal  0.0357395 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0099  hypothetical protein  50.83 
 
 		 849 aa  771    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0085  ABC transporter, permease protein  51.07 
 
 		 849 aa  741    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3653  hypothetical protein  44.04 
 
 		 847 aa  519  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1671  protein of unknown function DUF214  39.17 
 
 		 844 aa  509  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0107522  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2679  putative ABC transporter permease  40.07 
 
 		 842 aa  479  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0339343  normal  0.926867 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0124  hypothetical protein  41.05 
 
 		 831 aa  462  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0544905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0698  hypothetical protein  39.67 
 
 		 833 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3603  eflux ABC transporter inner membrane protein  41 
 
 		 835 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.217562  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2271  hypothetical protein  37.97 
 
 		 842 aa  452  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276468  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3288  hypothetical protein  40.88 
 
 		 835 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3957  hypothetical protein  40.4 
 
 		 835 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2222  protein of unknown function DUF214  35.04 
 
 		 935 aa  443  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0411  hypothetical protein  37.19 
 
 		 852 aa  435  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.773219  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1150  hypothetical protein  38.01 
 
 		 847 aa  411  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3687  hypothetical protein  38.25 
 
 		 840 aa  393  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1276  hypothetical protein  38.6 
 
 		 838 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53995  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1929  protein of unknown function DUF214  36.17 
 
 		 864 aa  340  9.999999999999999e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316143  normal  0.35107 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  29.09 
 
 		 835 aa  267  5.999999999999999e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  28.88 
 
 		 841 aa  246  9e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1597  protein of unknown function DUF214  24.83 
 
 		 861 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2108  protein of unknown function DUF214  25.68 
 
 		 832 aa  239  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6498  protein of unknown function DUF214  26.72 
 
 		 835 aa  239  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  30.23 
 
 		 840 aa  225  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2110  protein of unknown function DUF214  26.15 
 
 		 833 aa  225  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  28.38 
 
 		 829 aa  223  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  28.95 
 
 		 835 aa  219  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2414  hypothetical protein  26.72 
 
 		 832 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459172  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  28.37 
 
 		 838 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  28.37 
 
 		 838 aa  210  9e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0542  protein of unknown function DUF214  29.11 
 
 		 843 aa  208  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4016  hypothetical protein  29.32 
 
 		 834 aa  207  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401086  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1399  ABC transporter, permease protein  26.58 
 
 		 830 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27140  hypothetical protein  29.62 
 
 		 830 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  28.19 
 
 		 826 aa  197  6e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  27.83 
 
 		 844 aa  195  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1046  hypothetical protein  27.08 
 
 		 828 aa  194  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  26.57 
 
 		 827 aa  192  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  25.87 
 
 		 832 aa  191  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  24.56 
 
 		 842 aa  190  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  27.89 
 
 		 843 aa  188  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05800  hypothetical protein  26.47 
 
 		 818 aa  187  9e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  28.31 
 
 		 840 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  26.47 
 
 		 870 aa  185  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  23.24 
 
 		 836 aa  184  7e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  27.69 
 
 		 858 aa  182  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3824  hypothetical protein  30.83 
 
 		 843 aa  181  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1668  hypothetical protein  28.59 
 
 		 871 aa  180  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2280  hypothetical protein  28.59 
 
 		 871 aa  180  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2303  hypothetical protein  28.1 
 
 		 871 aa  180  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2785  protein of unknown function DUF214  28.94 
 
 		 857 aa  180  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.482364  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0287  predicted permease  23.77 
 
 		 815 aa  179  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2196  hypothetical protein  29.55 
 
 		 834 aa  179  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5607  hypothetical protein  28.57 
 
 		 871 aa  177  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2115  ABC efflux transporter, fused inner membrane subunits  24.72 
 
 		 882 aa  177  8e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.675122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3458  hypothetical protein  28.91 
 
 		 857 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.840481  normal  0.470717 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000166  predicted ABC-type transport system permease component  23.93 
 
 		 818 aa  176  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  27.89 
 
 		 844 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2318  hypothetical protein  28.95 
 
 		 871 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1029  hypothetical protein  28.96 
 
 		 869 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0600  efflux ABC transporter, permease protein  26.35 
 
 		 804 aa  175  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.77559 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  26.41 
 
 		 804 aa  175  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0545  efflux ABC transporter, permease protein  25.86 
 
 		 804 aa  174  5.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  28.65 
 
 		 869 aa  174  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  27.08 
 
 		 861 aa  174  9e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3446  ABC transporter, permease protein, putative  24.14 
 
 		 828 aa  172  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000339618  hitchhiker  0.000208184 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  27.41 
 
 		 860 aa  172  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  28.31 
 
 		 831 aa  172  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  24.88 
 
 		 840 aa  171  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  28.64 
 
 		 863 aa  172  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0535  efflux ABC transporter, permease protein  26.35 
 
 		 804 aa  171  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3120  hypothetical protein  26.13 
 
 		 804 aa  171  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749019 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00447  predicted inner membrane protein  26.22 
 
 		 804 aa  171  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3114  protein of unknown function DUF214  26.34 
 
 		 804 aa  171  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0575  efflux ABC transporter, permease protein  26.34 
 
 		 804 aa  171  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0616  efflux ABC transporter permease  27.08 
 
 		 804 aa  171  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00452  hypothetical protein  26.22 
 
 		 804 aa  171  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23050  hypothetical protein  29.03 
 
 		 833 aa  170  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.636342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>