184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3824 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  49.11 
 
 
844 aa  679    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  50.3 
 
 
843 aa  681    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  49.58 
 
 
844 aa  660    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  47.57 
 
 
869 aa  638    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3255  hypothetical protein  71.57 
 
 
839 aa  1011    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0335123  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0944  hypothetical protein  69.96 
 
 
853 aa  1055    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.69332 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4056  protein of unknown function DUF214  75.36 
 
 
838 aa  1124    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3824  hypothetical protein  100 
 
 
843 aa  1621    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936763  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  69.52 
 
 
858 aa  1071    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3458  hypothetical protein  79.83 
 
 
857 aa  1146    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.840481  normal  0.470717 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2785  protein of unknown function DUF214  80.07 
 
 
857 aa  1152    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.482364  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0533  hypothetical protein  75.87 
 
 
840 aa  1090    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0810  putative transmembrane protein  69.93 
 
 
856 aa  999    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2015  hypothetical protein  76.58 
 
 
844 aa  1119    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1602  hypothetical protein  63.9 
 
 
874 aa  897    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000566259 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0898  hypothetical protein  48.15 
 
 
851 aa  623  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5607  hypothetical protein  47.29 
 
 
871 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616708  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2303  hypothetical protein  46.93 
 
 
871 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1668  hypothetical protein  46.7 
 
 
871 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2280  hypothetical protein  46.7 
 
 
871 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  44.05 
 
 
870 aa  597  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2318  hypothetical protein  47.11 
 
 
871 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2196  hypothetical protein  47.26 
 
 
834 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  46.21 
 
 
863 aa  587  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  44.05 
 
 
861 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  43.93 
 
 
860 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1029  hypothetical protein  47.36 
 
 
869 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  39.43 
 
 
832 aa  558  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  41.82 
 
 
835 aa  555  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1259  efflux ABC transporter, permease protein  46.47 
 
 
880 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356208  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1400  putative permease  46.47 
 
 
1108 aa  548  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1251  efflux ABC transporter, permease protein  46.19 
 
 
883 aa  548  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  42.79 
 
 
840 aa  538  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  40.68 
 
 
827 aa  519  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  38.01 
 
 
829 aa  482  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  40.5 
 
 
840 aa  481  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  37.76 
 
 
835 aa  476  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  39.24 
 
 
831 aa  459  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  38.99 
 
 
826 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1918  hypothetical protein  37.71 
 
 
835 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695603  hitchhiker  0.000000000000882803 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2316  hypothetical protein  37.26 
 
 
832 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000697167 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1399  ABC transporter, permease protein  33.66 
 
 
830 aa  427  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3453  hypothetical protein  37.11 
 
 
832 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000113684 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  35.46 
 
 
838 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  34.95 
 
 
838 aa  422  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2296  hypothetical protein  38.66 
 
 
833 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27140  hypothetical protein  38.42 
 
 
830 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4016  hypothetical protein  34.84 
 
 
834 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401086  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1758  hypothetical protein  36.56 
 
 
835 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293557  hitchhiker  0.00000000277599 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23050  hypothetical protein  36.78 
 
 
833 aa  393  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.636342  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2560  hypothetical protein  37.67 
 
 
834 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00315514  hitchhiker  0.00000000000119307 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  30.82 
 
 
840 aa  381  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2618  hypothetical protein  37.26 
 
 
842 aa  375  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.855589  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  33.94 
 
 
804 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  30.21 
 
 
842 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0008  protein of unknown function DUF214  35.64 
 
 
836 aa  367  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1093  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  45.97 
 
 
569 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0774  hypothetical protein  45.97 
 
 
569 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2209  hypothetical protein  29.64 
 
 
819 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.795386  normal  0.224518 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  29.31 
 
 
836 aa  362  2e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3157  hypothetical protein  34.54 
 
 
809 aa  360  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.513308  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3019  efflux ABC transporter, permease protein  34.54 
 
 
809 aa  360  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00602267  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1273  efflux ABC transporter permease  34.78 
 
 
809 aa  360  7e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.924579 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0616  efflux ABC transporter permease  33.41 
 
 
804 aa  354  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0555  efflux ABC transporter, permease protein  33.41 
 
 
804 aa  353  8e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0545  efflux ABC transporter, permease protein  33.62 
 
 
804 aa  352  1e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0572  efflux ABC transporter permease  33.29 
 
 
804 aa  351  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.868504 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0557  efflux ABC transporter permease  33.29 
 
 
804 aa  350  6e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2066  hypothetical protein  37.13 
 
 
835 aa  350  7e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3114  protein of unknown function DUF214  33.5 
 
 
804 aa  349  1e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0600  efflux ABC transporter, permease protein  32.97 
 
 
804 aa  349  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.77559 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0535  efflux ABC transporter, permease protein  32.97 
 
 
804 aa  348  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0575  efflux ABC transporter, permease protein  33.5 
 
 
804 aa  348  2e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00447  predicted inner membrane protein  33.5 
 
 
804 aa  348  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3120  hypothetical protein  32.97 
 
 
804 aa  348  3e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000749019 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00452  hypothetical protein  33.5 
 
 
804 aa  348  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0562  efflux ABC transporter permease protein  33.17 
 
 
804 aa  346  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336553  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1124  hypothetical protein  32.13 
 
 
809 aa  344  5e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.101154  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0431  efflux ABC transporter, permease protein  32.78 
 
 
805 aa  344  5e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0649  protein of unknown function DUF214  37.02 
 
 
838 aa  342  2e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3191  protein of unknown function DUF214  32 
 
 
809 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0495543  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2896  hypothetical protein  30.05 
 
 
821 aa  336  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000431502 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1056  protein of unknown function DUF214  34.52 
 
 
810 aa  332  1e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1159  hypothetical protein  33.63 
 
 
810 aa  330  5.0000000000000004e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184343 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1698  hypothetical protein  29.69 
 
 
823 aa  327  6e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.405062 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1545  hypothetical protein  31.43 
 
 
833 aa  327  7e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1539  hypothetical protein  31.43 
 
 
833 aa  326  9e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274903 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1480  hypothetical protein  31.31 
 
 
833 aa  326  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2401  hypothetical protein  31.37 
 
 
816 aa  324  4e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.678425  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3446  ABC transporter, permease protein, putative  30.68 
 
 
828 aa  320  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000339618  hitchhiker  0.000208184 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2707  hypothetical protein  30.78 
 
 
836 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0684  hypothetical protein  32.59 
 
 
829 aa  310  5.9999999999999995e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.852275  normal  0.517784 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1487  ABC transporter, permease, putative  30.42 
 
 
818 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3003  protein of unknown function DUF214  32.77 
 
 
810 aa  309  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.558274  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2686  hypothetical protein  30.14 
 
 
842 aa  308  3e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1680  protein of unknown function DUF214  30.72 
 
 
842 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.432743  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2783  hypothetical protein  30.31 
 
 
837 aa  307  6e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.667381  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2926  ABC transporter, permease, putative  30.99 
 
 
835 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2566  hypothetical protein  30.28 
 
 
827 aa  299  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2366  hypothetical protein  29.36 
 
 
827 aa  295  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.197088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>