173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1487 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2926  ABC transporter, permease, putative  65.74 
 
 		 835 aa  984    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2783  hypothetical protein  65.58 
 
 		 837 aa  1006    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.667381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2366  hypothetical protein  65.33 
 
 		 827 aa  975    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.197088  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1662  hypothetical protein  66.46 
 
 		 817 aa  981    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000552359  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1480  hypothetical protein  65.9 
 
 		 833 aa  1004    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1545  hypothetical protein  66.14 
 
 		 833 aa  1007    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2566  hypothetical protein  66.99 
 
 		 827 aa  996    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1539  hypothetical protein  65.9 
 
 		 833 aa  1006    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274903 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1487  ABC transporter, permease, putative  100 
 
 		 818 aa  1613    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2686  hypothetical protein  64.95 
 
 		 842 aa  1002    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2401  hypothetical protein  66.75 
 
 		 816 aa  1034    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.678425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2390  hypothetical protein  66.42 
 
 		 831 aa  981    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.652609  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1680  protein of unknown function DUF214  64.72 
 
 		 842 aa  1002    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.432743  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2707  hypothetical protein  65.54 
 
 		 836 aa  1006    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2896  hypothetical protein  67.07 
 
 		 821 aa  1032    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431502 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1698  hypothetical protein  66.26 
 
 		 823 aa  1022    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.405062 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  39.86 
 
 		 840 aa  602  1.0000000000000001e-171  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  39.74 
 
 		 842 aa  590  1e-167  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  38.37 
 
 		 836 aa  557  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1124  hypothetical protein  36.08 
 
 		 809 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.101154  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  36.9 
 
 		 804 aa  454  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3120  hypothetical protein  36.83 
 
 		 804 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749019 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3191  protein of unknown function DUF214  35.96 
 
 		 809 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0495543  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00447  predicted inner membrane protein  36.7 
 
 		 804 aa  443  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0545  efflux ABC transporter, permease protein  36.7 
 
 		 804 aa  445  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00452  hypothetical protein  36.7 
 
 		 804 aa  443  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0600  efflux ABC transporter, permease protein  36.58 
 
 		 804 aa  442  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.77559 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0575  efflux ABC transporter, permease protein  36.7 
 
 		 804 aa  446  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3114  protein of unknown function DUF214  36.58 
 
 		 804 aa  442  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3019  efflux ABC transporter, permease protein  38.4 
 
 		 809 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00602267  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0535  efflux ABC transporter, permease protein  36.58 
 
 		 804 aa  442  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0555  efflux ABC transporter, permease protein  36.09 
 
 		 804 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3157  hypothetical protein  38.27 
 
 		 809 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.513308  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0572  efflux ABC transporter permease  36.09 
 
 		 804 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.868504 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0431  efflux ABC transporter, permease protein  36.74 
 
 		 805 aa  436  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0557  efflux ABC transporter permease  35.97 
 
 		 804 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0562  efflux ABC transporter permease protein  35.97 
 
 		 804 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0616  efflux ABC transporter permease  35.85 
 
 		 804 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1273  efflux ABC transporter permease  38.02 
 
 		 809 aa  432  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.924579 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  34.77 
 
 		 838 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  34.05 
 
 		 838 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3446  ABC transporter, permease protein, putative  34.34 
 
 		 828 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000339618  hitchhiker  0.000208184 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4016  hypothetical protein  35.14 
 
 		 834 aa  405  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401086  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1056  protein of unknown function DUF214  37.77 
 
 		 810 aa  405  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2209  hypothetical protein  32.69 
 
 		 819 aa  403  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.795386  normal  0.224518 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3003  protein of unknown function DUF214  36.47 
 
 		 810 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.558274  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1918  hypothetical protein  35.14 
 
 		 835 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695603  hitchhiker  0.000000000000882803 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27140  hypothetical protein  35.77 
 
 		 830 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2316  hypothetical protein  34.78 
 
 		 832 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000697167 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1399  ABC transporter, permease protein  32.65 
 
 		 830 aa  389  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2957  hypothetical protein  31.84 
 
 		 810 aa  386  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133946  normal  0.10767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3453  hypothetical protein  34.78 
 
 		 832 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000113684 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2296  hypothetical protein  36.01 
 
 		 833 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1159  hypothetical protein  36.71 
 
 		 810 aa  386  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184343 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1046  hypothetical protein  35.59 
 
 		 828 aa  385  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0287  predicted permease  32.3 
 
 		 815 aa  379  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23050  hypothetical protein  37.28 
 
 		 833 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.636342  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  32.5 
 
 		 835 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0684  hypothetical protein  34.47 
 
 		 829 aa  356  1e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.852275  normal  0.517784 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  31.31 
 
 		 844 aa  353  8.999999999999999e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1758  hypothetical protein  34.5 
 
 		 835 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293557  hitchhiker  0.00000000277599 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0722  hypothetical protein  31.9 
 
 		 815 aa  351  3e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000480127  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000166  predicted ABC-type transport system permease component  30.73 
 
 		 818 aa  350  6e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  32.54 
 
 		 843 aa  347  4e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2618  hypothetical protein  33.29 
 
 		 842 aa  347  6e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.855589  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2560  hypothetical protein  35.86 
 
 		 834 aa  346  8e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00315514  hitchhiker  0.00000000000119307 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  33.09 
 
 		 829 aa  343  7e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  31.7 
 
 		 844 aa  343  1e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  33.61 
 
 		 826 aa  341  4e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05800  hypothetical protein  30.26 
 
 		 818 aa  338  2.9999999999999997e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  30.79 
 
 		 835 aa  336  7.999999999999999e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  33.05 
 
 		 840 aa  336  1e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  32.85 
 
 		 831 aa  331  4e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  31.96 
 
 		 827 aa  329  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  32.7 
 
 		 869 aa  324  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  30.43 
 
 		 870 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2015  hypothetical protein  32.47 
 
 		 844 aa  321  3.9999999999999996e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  30.73 
 
 		 840 aa  317  7e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0944  hypothetical protein  31.12 
 
 		 853 aa  314  3.9999999999999997e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.69332 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  30.06 
 
 		 858 aa  313  5.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  31.67 
 
 		 861 aa  313  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  31.7 
 
 		 860 aa  311  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  29.17 
 
 		 832 aa  310  5e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0898  hypothetical protein  31.67 
 
 		 851 aa  310  8e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1602  hypothetical protein  32.62 
 
 		 874 aa  308  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000566259 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2785  protein of unknown function DUF214  30.92 
 
 		 857 aa  308  3e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.482364  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4056  protein of unknown function DUF214  30.99 
 
 		 838 aa  305  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3458  hypothetical protein  30.92 
 
 		 857 aa  304  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.840481  normal  0.470717 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1029  hypothetical protein  30.95 
 
 		 869 aa  302  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3255  hypothetical protein  30.76 
 
 		 839 aa  300  5e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0335123  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0533  hypothetical protein  31.62 
 
 		 840 aa  293  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1668  hypothetical protein  31.89 
 
 		 871 aa  291  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2280  hypothetical protein  31.89 
 
 		 871 aa  291  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1259  efflux ABC transporter, permease protein  31.7 
 
 		 880 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356208  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3824  hypothetical protein  30.41 
 
 		 843 aa  290  7e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2303  hypothetical protein  31.93 
 
 		 871 aa  290  8e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1251  efflux ABC transporter, permease protein  31.24 
 
 		 883 aa  290  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1400  putative permease  31.74 
 
 		 1108 aa  287  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0810  putative transmembrane protein  32.08 
 
 		 856 aa  282  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  31.36 
 
 		 863 aa  282  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>