179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0698 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0698  hypothetical protein  100 
 
 		 833 aa  1598    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0124  hypothetical protein  54.45 
 
 		 831 aa  714    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0544905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1150  hypothetical protein  50.3 
 
 		 847 aa  626  1e-178  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1394  hypothetical protein  45.02 
 
 		 858 aa  608  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.472262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  39.74 
 
 		 856 aa  555  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0099  hypothetical protein  39.13 
 
 		 849 aa  543  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0087  ABC transporter, permease protein  39.38 
 
 		 849 aa  533  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.320612  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0550  hypothetical protein  40.43 
 
 		 858 aa  533  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0199  hypothetical protein  38.4 
 
 		 851 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0530  hypothetical protein  38.93 
 
 		 864 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0387  putative ABC transporter, permease protein  41.09 
 
 		 856 aa  528  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1016  hypothetical protein  40.97 
 
 		 858 aa  523  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331004  normal  0.145704 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0286  hypothetical protein  39.49 
 
 		 860 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463422  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0414  hypothetical protein  39.34 
 
 		 851 aa  513  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.336355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3352  hypothetical protein  40.71 
 
 		 869 aa  514  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0085  ABC transporter, permease protein  39.5 
 
 		 849 aa  510  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4181  hypothetical protein  38.72 
 
 		 848 aa  507  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.821525  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4056  protein of unknown function DUF214  38.42 
 
 		 847 aa  505  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5469  hypothetical protein  38.93 
 
 		 862 aa  500  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18562  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3733  protein of unknown function DUF214  38.67 
 
 		 847 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3075  hypothetical protein  40.78 
 
 		 863 aa  495  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1778  protein of unknown function DUF214  39.58 
 
 		 863 aa  490  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1671  protein of unknown function DUF214  35.92 
 
 		 844 aa  478  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0107522  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1757  hypothetical protein  39.1 
 
 		 851 aa  476  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0829  hypothetical protein  38 
 
 		 871 aa  469  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270904  normal  0.305315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2544  protein of unknown function DUF214  40.14 
 
 		 860 aa  464  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519388  normal  0.0357395 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2269  hypothetical protein  40.02 
 
 		 892 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2226  protein of unknown function DUF214  40.5 
 
 		 862 aa  459  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0961704 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2679  putative ABC transporter permease  37.99 
 
 		 842 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0339343  normal  0.926867 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2271  hypothetical protein  36.54 
 
 		 842 aa  424  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276468  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3653  hypothetical protein  37.19 
 
 		 847 aa  422  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1913  protein of unknown function DUF214  36.64 
 
 		 882 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.549699 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2222  protein of unknown function DUF214  32.15 
 
 		 935 aa  415  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0411  hypothetical protein  33.57 
 
 		 852 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.773219  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3603  eflux ABC transporter inner membrane protein  35.32 
 
 		 835 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.217562  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3957  hypothetical protein  35.84 
 
 		 835 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3288  hypothetical protein  35.2 
 
 		 835 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1276  hypothetical protein  36.77 
 
 		 838 aa  378  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.53995  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1929  protein of unknown function DUF214  33.05 
 
 		 864 aa  323  9.999999999999999e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316143  normal  0.35107 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  27.15 
 
 		 829 aa  278  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  27.46 
 
 		 835 aa  256  8e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  29.28 
 
 		 838 aa  244  6e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  30 
 
 		 838 aa  243  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  26.92 
 
 		 835 aa  238  4e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1399  ABC transporter, permease protein  29.18 
 
 		 830 aa  238  5.0000000000000005e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27140  hypothetical protein  30.65 
 
 		 830 aa  235  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1597  protein of unknown function DUF214  25.84 
 
 		 861 aa  227  7e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6498  protein of unknown function DUF214  27.05 
 
 		 835 aa  225  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3687  hypothetical protein  34.3 
 
 		 840 aa  224  6e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  28.82 
 
 		 844 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  26.27 
 
 		 832 aa  216  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23050  hypothetical protein  29.36 
 
 		 833 aa  216  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.636342  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2108  protein of unknown function DUF214  24.31 
 
 		 832 aa  215  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2110  protein of unknown function DUF214  24.88 
 
 		 833 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  26.47 
 
 		 861 aa  213  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  26.96 
 
 		 827 aa  210  7e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2618  hypothetical protein  29.07 
 
 		 842 aa  208  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.855589  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  28.7 
 
 		 841 aa  207  8e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3446  ABC transporter, permease protein, putative  25 
 
 		 828 aa  205  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000339618  hitchhiker  0.000208184 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  26.47 
 
 		 860 aa  205  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  28.52 
 
 		 844 aa  205  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  28.17 
 
 		 826 aa  203  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  27.76 
 
 		 843 aa  202  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0722  hypothetical protein  27.45 
 
 		 815 aa  202  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000480127  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0287  predicted permease  26.37 
 
 		 815 aa  201  5e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  27.16 
 
 		 870 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2414  hypothetical protein  25.86 
 
 		 832 aa  198  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459172  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  28.38 
 
 		 869 aa  198  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  28.75 
 
 		 840 aa  197  7e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1029  hypothetical protein  27.58 
 
 		 869 aa  197  7e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  29.36 
 
 		 863 aa  195  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1273  efflux ABC transporter permease  26.54 
 
 		 809 aa  195  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.924579 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  28.93 
 
 		 831 aa  194  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2303  hypothetical protein  29.68 
 
 		 871 aa  194  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  25.78 
 
 		 836 aa  192  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1668  hypothetical protein  29.67 
 
 		 871 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2280  hypothetical protein  29.67 
 
 		 871 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2196  hypothetical protein  28.81 
 
 		 834 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0542  protein of unknown function DUF214  28.29 
 
 		 843 aa  191  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2318  hypothetical protein  28.67 
 
 		 871 aa  190  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  27.64 
 
 		 858 aa  190  9e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3019  efflux ABC transporter, permease protein  26.42 
 
 		 809 aa  189  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00602267  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5607  hypothetical protein  28.5 
 
 		 871 aa  188  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  26.89 
 
 		 840 aa  189  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3157  hypothetical protein  25.92 
 
 		 809 aa  188  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.513308  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2209  hypothetical protein  25.79 
 
 		 819 aa  188  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.795386  normal  0.224518 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0616  efflux ABC transporter permease  25.28 
 
 		 804 aa  187  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0898  hypothetical protein  28.29 
 
 		 851 aa  187  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1259  efflux ABC transporter, permease protein  28.52 
 
 		 880 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356208  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0557  efflux ABC transporter permease  25.37 
 
 		 804 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0555  efflux ABC transporter, permease protein  25.31 
 
 		 804 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0572  efflux ABC transporter permease  25.25 
 
 		 804 aa  185  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.868504 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0562  efflux ABC transporter permease protein  25.31 
 
 		 804 aa  185  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1251  efflux ABC transporter, permease protein  28.93 
 
 		 883 aa  185  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  24.13 
 
 		 840 aa  185  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1400  putative permease  28.37 
 
 		 1108 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0810  putative transmembrane protein  30.01 
 
 		 856 aa  183  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3824  hypothetical protein  29.46 
 
 		 843 aa  179  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4056  protein of unknown function DUF214  28.75 
 
 		 838 aa  179  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1159  hypothetical protein  27.06 
 
 		 810 aa  178  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184343 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>