More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4412 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  100 
 
 		 863 aa  1672    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  46.36 
 
 		 852 aa  590  1e-167  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  43.42 
 
 		 822 aa  482  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  35.04 
 
 		 854 aa  419  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  32.94 
 
 		 855 aa  389  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  36.78 
 
 		 807 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  37.01 
 
 		 822 aa  333  8e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  35.51 
 
 		 874 aa  329  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  35.31 
 
 		 838 aa  320  6e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  34.27 
 
 		 828 aa  302  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0269  hypothetical protein  32.58 
 
 		 823 aa  256  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4806  protein of unknown function DUF214  33.37 
 
 		 867 aa  218  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3508  protein of unknown function DUF214  31.27 
 
 		 838 aa  207  8e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  30.16 
 
 		 841 aa  191  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4404  protein of unknown function DUF214  33.93 
 
 		 822 aa  187  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2720  protein of unknown function DUF214  33.22 
 
 		 648 aa  184  8.000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  29.06 
 
 		 834 aa  177  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  28.55 
 
 		 852 aa  169  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  28.05 
 
 		 845 aa  167  6.9999999999999995e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  26.74 
 
 		 843 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  28.49 
 
 		 847 aa  163  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  29.7 
 
 		 848 aa  159  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  27.82 
 
 		 856 aa  151  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  27.03 
 
 		 873 aa  146  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  27.45 
 
 		 853 aa  142  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  34.22 
 
 		 640 aa  138  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.983976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  28.42 
 
 		 855 aa  134  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  25.34 
 
 		 842 aa  132  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  27.17 
 
 		 861 aa  131  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4607  protein of unknown function DUF214  30.46 
 
 		 852 aa  129  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.764847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  27.67 
 
 		 838 aa  129  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2456  protein of unknown function DUF214  36.21 
 
 		 627 aa  128  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0496014  hitchhiker  0.00000468222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  26.66 
 
 		 836 aa  127  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  27.35 
 
 		 806 aa  120  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  28.36 
 
 		 841 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  25.52 
 
 		 825 aa  119  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  26.08 
 
 		 821 aa  111  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  27.16 
 
 		 859 aa  107  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  26.98 
 
 		 866 aa  106  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  31.23 
 
 		 861 aa  105  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  27.47 
 
 		 849 aa  100  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  24.7 
 
 		 853 aa  100  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  24.36 
 
 		 880 aa  99  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  30.06 
 
 		 857 aa  95.9  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  26.53 
 
 		 858 aa  93.6  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  28.12 
 
 		 854 aa  92.8  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  26.02 
 
 		 855 aa  92.4  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  26.82 
 
 		 849 aa  92  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  23.07 
 
 		 857 aa  90.9  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  27.14 
 
 		 839 aa  88.6  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  25.22 
 
 		 853 aa  88.6  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  26.86 
 
 		 371 aa  87.8  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  25.19 
 
 		 897 aa  87.4  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  29.49 
 
 		 871 aa  87.4  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  29.7 
 
 		 873 aa  86.3  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  24.76 
 
 		 851 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  27.84 
 
 		 930 aa  84.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  22.22 
 
 		 858 aa  82  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  25.32 
 
 		 878 aa  77.4  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  24.92 
 
 		 393 aa  76.6  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1964  protein of unknown function DUF214  28.6 
 
 		 643 aa  76.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  25.09 
 
 		 413 aa  76.6  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0349  protein of unknown function DUF214  23.95 
 
 		 400 aa  75.9  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  29.01 
 
 		 859 aa  71.6  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  25.83 
 
 		 855 aa  71.6  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  23.31 
 
 		 850 aa  71.2  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  25.87 
 
 		 389 aa  70.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  26.87 
 
 		 849 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  29.11 
 
 		 801 aa  70.1  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.36 
 
 		 648 aa  68.9  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.55 
 
 		 835 aa  68.9  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  23.46 
 
 		 662 aa  68.6  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2438  hypothetical protein  24.92 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  23.67 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  23.7 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  23.7 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  19.69 
 
 		 856 aa  67.8  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  25.07 
 
 		 648 aa  67  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  25.07 
 
 		 648 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.07 
 
 		 648 aa  67  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  21.5 
 
 		 430 aa  67.4  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.07 
 
 		 648 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  25.07 
 
 		 648 aa  67  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  27.39 
 
 		 866 aa  67.4  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.07 
 
 		 648 aa  67  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  26.57 
 
 		 422 aa  66.2  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  27.44 
 
 		 422 aa  66.2  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.07 
 
 		 648 aa  66.2  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0906  hypothetical protein  22.25 
 
 		 362 aa  66.2  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.831415  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  25.27 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  27.65 
 
 		 828 aa  66.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.61 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  27 
 
 		 849 aa  65.5  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  26.84 
 
 		 870 aa  65.1  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  23.32 
 
 		 791 aa  64.3  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0767  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  26.79 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.016013  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  23.47 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  31.58 
 
 		 846 aa  64.3  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2669  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.9 
 
 		 415 aa  63.9  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23260  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  27.04 
 
 		 419 aa  63.5  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>