More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3058 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  54.43 
 
 
857 aa  735    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  47.89 
 
 
873 aa  650    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
853 aa  1618    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  50.29 
 
 
861 aa  671    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  48.75 
 
 
866 aa  582  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  45.67 
 
 
873 aa  534  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  39.08 
 
 
848 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  37.76 
 
 
834 aa  419  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  35.95 
 
 
843 aa  395  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  36.65 
 
 
847 aa  393  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  36.29 
 
 
859 aa  384  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  34.42 
 
 
842 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  35.8 
 
 
856 aa  372  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  37.41 
 
 
845 aa  361  4e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  35.79 
 
 
849 aa  342  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  34.97 
 
 
849 aa  340  7e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  33.37 
 
 
852 aa  332  1e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  32.62 
 
 
855 aa  292  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  32.56 
 
 
838 aa  276  9e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  30.53 
 
 
854 aa  276  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  33.49 
 
 
806 aa  270  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  34.5 
 
 
853 aa  257  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  31.49 
 
 
836 aa  253  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  32.54 
 
 
821 aa  249  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  29.74 
 
 
861 aa  245  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  31.8 
 
 
825 aa  225  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  35.19 
 
 
855 aa  213  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  30.57 
 
 
841 aa  209  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  33.22 
 
 
828 aa  205  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  32.15 
 
 
846 aa  199  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  28.71 
 
 
855 aa  194  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  32.08 
 
 
859 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  33.71 
 
 
871 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  31.4 
 
 
839 aa  179  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  31.3 
 
 
835 aa  168  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  27.34 
 
 
880 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  30.04 
 
 
930 aa  164  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  27.8 
 
 
897 aa  137  9e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  27.73 
 
 
852 aa  134  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  25.93 
 
 
854 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  37.91 
 
 
878 aa  128  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  26.58 
 
 
858 aa  128  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  21.03 
 
 
858 aa  126  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  39.27 
 
 
853 aa  126  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  26.13 
 
 
863 aa  125  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  25.9 
 
 
870 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  27.6 
 
 
866 aa  121  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  21.2 
 
 
857 aa  121  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  33.63 
 
 
801 aa  117  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  22.89 
 
 
849 aa  117  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  19.8 
 
 
856 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  27.72 
 
 
828 aa  114  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  25.29 
 
 
851 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  26.54 
 
 
850 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  24.97 
 
 
855 aa  108  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  24.12 
 
 
855 aa  107  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  23.02 
 
 
850 aa  107  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  24.11 
 
 
855 aa  104  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  26.65 
 
 
839 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  25.61 
 
 
846 aa  102  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  32.09 
 
 
846 aa  101  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  27.48 
 
 
841 aa  100  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  26.96 
 
 
838 aa  99  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  25.15 
 
 
857 aa  98.2  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  26.38 
 
 
884 aa  97.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  26.53 
 
 
822 aa  97.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  24.46 
 
 
858 aa  96.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  27.68 
 
 
874 aa  90.9  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  27.06 
 
 
413 aa  88.6  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0334  protein of unknown function DUF214  23.54 
 
 
941 aa  88.2  6e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.530518  hitchhiker  0.0000549339 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.01 
 
 
419 aa  83.6  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  26.37 
 
 
822 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  36.63 
 
 
443 aa  82  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  26.84 
 
 
849 aa  81.6  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  24.14 
 
 
847 aa  81.3  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2238  protein of unknown function DUF214  27.74 
 
 
822 aa  80.5  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249339  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7809  protein of unknown function DUF214  30.19 
 
 
775 aa  80.1  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  24.65 
 
 
857 aa  79.7  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  32.14 
 
 
414 aa  78.2  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  36.91 
 
 
452 aa  77.8  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  29.65 
 
 
842 aa  77.4  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  32.14 
 
 
414 aa  77.4  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  30.71 
 
 
415 aa  76.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  26.61 
 
 
807 aa  77  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4065  protein of unknown function DUF214  30.35 
 
 
488 aa  75.9  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  30.72 
 
 
404 aa  75.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  22.9 
 
 
413 aa  75.9  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  34.44 
 
 
896 aa  75.1  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  29.07 
 
 
842 aa  74.7  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  32.68 
 
 
397 aa  72.8  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  29.72 
 
 
845 aa  73.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  32.68 
 
 
397 aa  72.8  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  28.86 
 
 
842 aa  73.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  28.81 
 
 
414 aa  72.8  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  25.79 
 
 
849 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  27.27 
 
 
443 aa  71.6  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21950  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  40.11 
 
 
738 aa  71.2  0.00000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0269  hypothetical protein  27.92 
 
 
414 aa  71.2  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831572  hitchhiker  0.00091516 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2440  protein of unknown function DUF214  27.46 
 
 
416 aa  70.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.652514  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2927  protein of unknown function DUF214  27.4 
 
 
409 aa  70.5  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.58384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>