215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1714 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  100 
 
 
791 aa  1604    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  48.36 
 
 
792 aa  783    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  31.82 
 
 
792 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  34.25 
 
 
792 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  30.48 
 
 
797 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  31.7 
 
 
787 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4368  protein of unknown function DUF214  30.68 
 
 
789 aa  362  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493357  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4500  protein of unknown function DUF214  30.68 
 
 
789 aa  362  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.140926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5376  hypothetical protein  30.97 
 
 
788 aa  361  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.687555  normal  0.158933 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  31.37 
 
 
787 aa  357  6.999999999999999e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1280  protein of unknown function DUF214  31.38 
 
 
787 aa  353  7e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.134975  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1701  hypothetical protein  29.91 
 
 
787 aa  352  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  30.21 
 
 
787 aa  351  3e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1508  hypothetical protein  31.2 
 
 
787 aa  350  7e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  31.28 
 
 
788 aa  347  4e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2063  protein of unknown function DUF214  31.42 
 
 
786 aa  343  9e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.059319  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  29.74 
 
 
789 aa  343  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  29.06 
 
 
790 aa  342  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3437  hypothetical protein  29.57 
 
 
800 aa  340  5e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.248867 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  30.59 
 
 
787 aa  335  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  30.26 
 
 
787 aa  333  7.000000000000001e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  30.3 
 
 
787 aa  330  8e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2303  hypothetical protein  31.59 
 
 
788 aa  327  5e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.951648  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0063  permease domain-containing protein  29.66 
 
 
789 aa  325  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2842  protein of unknown function DUF214  30.5 
 
 
786 aa  324  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  27.49 
 
 
788 aa  321  3e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2205  hypothetical protein  28.05 
 
 
787 aa  320  3.9999999999999996e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal  0.0125099 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2657  ABC transporter, inner membrane subunit  30.25 
 
 
786 aa  320  7e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186828  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1012  hypothetical protein  29.17 
 
 
791 aa  318  3e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  29.86 
 
 
793 aa  317  5e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0301  hypothetical protein  29.37 
 
 
787 aa  315  2.9999999999999996e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1582  hypothetical protein  28.79 
 
 
793 aa  313  5.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.143489  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3584  hypothetical protein  30.49 
 
 
787 aa  312  2e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2748  protein of unknown function DUF214  30.2 
 
 
786 aa  312  2e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.076782  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  29.62 
 
 
789 aa  311  4e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2960  hypothetical protein  31.85 
 
 
786 aa  310  5e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2282  hypothetical protein  29.12 
 
 
787 aa  303  8.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312022  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1055  protein of unknown function DUF214  27.64 
 
 
787 aa  298  3e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295189  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4212  hypothetical protein  28.27 
 
 
789 aa  292  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406892  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0077  hypothetical protein  28.89 
 
 
787 aa  292  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5172  hypothetical protein  27.67 
 
 
788 aa  290  6e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841676  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1124  hypothetical protein  27.09 
 
 
793 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.527688 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2068  hypothetical protein  29.6 
 
 
790 aa  287  5e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.847092 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2239  protein of unknown function DUF214  25.91 
 
 
774 aa  207  8e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  23.2 
 
 
773 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  24.71 
 
 
1132 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  25.43 
 
 
1090 aa  181  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  24.54 
 
 
1132 aa  180  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  25.18 
 
 
947 aa  175  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  25.59 
 
 
1177 aa  161  5e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1694  protein of unknown function DUF214  22.17 
 
 
749 aa  159  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1113  protein of unknown function DUF214  26.91 
 
 
1110 aa  159  3e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  23.13 
 
 
737 aa  157  8e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  23.06 
 
 
876 aa  155  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0110  protein of unknown function DUF214  23.65 
 
 
759 aa  152  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590348  normal  0.0712299 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1582  protein of unknown function DUF214  21.15 
 
 
743 aa  151  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  23.92 
 
 
1143 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  22.76 
 
 
859 aa  145  4e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  23.32 
 
 
1016 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  24.29 
 
 
868 aa  140  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0748  protein of unknown function DUF214  23.67 
 
 
1068 aa  137  9.999999999999999e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0133  efflux ABC transporter, permease protein  24.18 
 
 
917 aa  131  5.0000000000000004e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  24.68 
 
 
1232 aa  124  6e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  23.61 
 
 
1211 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0969  hypothetical protein  23.22 
 
 
806 aa  79.7  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208929  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4337  hypothetical protein  21.87 
 
 
876 aa  69.3  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412663  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  29.84 
 
 
414 aa  65.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  23.09 
 
 
830 aa  65.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  23.32 
 
 
863 aa  64.3  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  21.58 
 
 
861 aa  62.4  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1073  hypothetical protein  22.68 
 
 
384 aa  62  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.418174 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  22.8 
 
 
838 aa  60.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  23.6 
 
 
852 aa  60.1  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01820  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  22.03 
 
 
811 aa  59.3  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0906  hypothetical protein  26.43 
 
 
362 aa  58.2  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.831415  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  25.68 
 
 
397 aa  57  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  21.87 
 
 
855 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0200  protein of unknown function DUF214  29.6 
 
 
400 aa  55.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1440  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.59 
 
 
415 aa  55.8  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141439  normal  0.211841 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3197  hypothetical protein  25.65 
 
 
427 aa  56.2  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  26.92 
 
 
386 aa  55.5  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  26.62 
 
 
408 aa  55.5  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  27.75 
 
 
845 aa  55.1  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  23.22 
 
 
853 aa  54.7  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  21.73 
 
 
402 aa  54.3  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1075  hypothetical protein  23.18 
 
 
828 aa  54.3  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.278561  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1840  protein of unknown function DUF214  26.42 
 
 
408 aa  53.9  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  22.51 
 
 
843 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0856  protein of unknown function DUF214  25.27 
 
 
417 aa  52.4  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0205588  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1654  hypothetical protein  23.12 
 
 
399 aa  52.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.498405  normal  0.951827 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  29.41 
 
 
452 aa  52.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  26.72 
 
 
400 aa  52  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.7 
 
 
386 aa  52  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  28.17 
 
 
443 aa  51.6  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  27.51 
 
 
397 aa  51.6  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  22.31 
 
 
399 aa  51.6  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1691  protein of unknown function DUF214  25.63 
 
 
295 aa  51.2  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.132145  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  27.23 
 
 
850 aa  51.2  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  26.85 
 
 
849 aa  51.2  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  22.82 
 
 
806 aa  51.2  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>