More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1888 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 861 aa  1681    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  40.38 
 
 		 855 aa  535  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  39.7 
 
 		 836 aa  469  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  38.95 
 
 		 825 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  36.02 
 
 		 838 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  37.53 
 
 		 839 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  35.71 
 
 		 841 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  30.98 
 
 		 843 aa  314  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  34.13 
 
 		 848 aa  312  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  33.41 
 
 		 847 aa  309  2.0000000000000002e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  31.26 
 
 		 842 aa  296  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  33.07 
 
 		 834 aa  293  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  36.04 
 
 		 828 aa  291  5.0000000000000004e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  32.96 
 
 		 845 aa  281  3e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  30.39 
 
 		 852 aa  279  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  33.78 
 
 		 859 aa  254  4.0000000000000004e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  30.93 
 
 		 856 aa  246  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  32.16 
 
 		 849 aa  241  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  32.29 
 
 		 849 aa  239  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  27.86 
 
 		 854 aa  238  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  34.17 
 
 		 846 aa  230  9e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  31.98 
 
 		 806 aa  228  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  35.05 
 
 		 930 aa  226  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  31.33 
 
 		 853 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  29.37 
 
 		 873 aa  219  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  34.97 
 
 		 871 aa  216  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  30.19 
 
 		 878 aa  213  1e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  29.81 
 
 		 861 aa  207  7e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  30.49 
 
 		 853 aa  203  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  36.13 
 
 		 855 aa  197  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  36.23 
 
 		 859 aa  196  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  27 
 
 		 880 aa  190  9e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  29.6 
 
 		 835 aa  187  9e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  28.44 
 
 		 821 aa  184  9.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  30.33 
 
 		 866 aa  181  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  30.41 
 
 		 897 aa  179  2e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  30.11 
 
 		 855 aa  137  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  31.85 
 
 		 853 aa  137  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  27.6 
 
 		 863 aa  133  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  33.83 
 
 		 846 aa  127  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  26.16 
 
 		 851 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  25.48 
 
 		 850 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  30.34 
 
 		 857 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  20.77 
 
 		 856 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  27.54 
 
 		 849 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  25.37 
 
 		 850 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  32.09 
 
 		 857 aa  114  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  22.34 
 
 		 857 aa  105  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  26.06 
 
 		 854 aa  103  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  25.79 
 
 		 870 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  31.33 
 
 		 873 aa  102  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  24.86 
 
 		 847 aa  101  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  21.83 
 
 		 858 aa  100  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  29.03 
 
 		 843 aa  95.9  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  26.53 
 
 		 866 aa  94.4  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  24.7 
 
 		 855 aa  94  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  26.05 
 
 		 855 aa  93.2  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2238  protein of unknown function DUF214  26.26 
 
 		 822 aa  92.8  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249339  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  26.22 
 
 		 822 aa  90.1  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  24.52 
 
 		 847 aa  89.7  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  25.2 
 
 		 852 aa  89.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  26.95 
 
 		 828 aa  89.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  29.23 
 
 		 801 aa  88.2  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  24.7 
 
 		 841 aa  85.9  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  22.92 
 
 		 849 aa  85.5  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  27.8 
 
 		 822 aa  85.5  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  27.08 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  24.31 
 
 		 858 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2922  protein of unknown function DUF214  34.2 
 
 		 826 aa  79  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179873  normal  0.823523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  26.39 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  26.62 
 
 		 839 aa  77  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  26.43 
 
 		 874 aa  75.9  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  30.26 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  25.4 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21950  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  60.81 
 
 		 738 aa  75.1  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  25.52 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  25.17 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  26.32 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  25.83 
 
 		 397 aa  74.3  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2040  hypothetical protein  24.91 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11269  normal  0.213161 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  31.75 
 
 		 393 aa  73.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  29.33 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0755  hypothetical protein  23.78 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.951595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  27.61 
 
 		 837 aa  71.2  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  27.2 
 
 		 841 aa  71.2  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0540  hypothetical protein  31.68 
 
 		 868 aa  71.2  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34537  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  32.48 
 
 		 833 aa  71.2  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  24.01 
 
 		 870 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  31.13 
 
 		 390 aa  70.5  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  32.99 
 
 		 849 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4607  protein of unknown function DUF214  29.27 
 
 		 852 aa  70.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.764847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  27.5 
 
 		 896 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1517  hypothetical protein  23 
 
 		 829 aa  68.6  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.416257  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  31.34 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  27.53 
 
 		 414 aa  67.4  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  32.26 
 
 		 399 aa  67  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  27.56 
 
 		 397 aa  67  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  27.46 
 
 		 443 aa  66.2  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  29.83 
 
 		 397 aa  66.6  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2440  protein of unknown function DUF214  34.93 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.652514  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>