More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2636 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  100 
 
 		 843 aa  1630    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  72.06 
 
 		 842 aa  1160    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  47.11 
 
 		 834 aa  621  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  45.49 
 
 		 848 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  43.01 
 
 		 847 aa  568  1e-160  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  42.32 
 
 		 845 aa  523  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  39.51 
 
 		 849 aa  459  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  37.91 
 
 		 852 aa  456  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  39.72 
 
 		 849 aa  443  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  37.1 
 
 		 853 aa  418  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  37.98 
 
 		 806 aa  410  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  36.6 
 
 		 856 aa  393  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  35.77 
 
 		 859 aa  395  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  34.61 
 
 		 836 aa  376  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  34.73 
 
 		 855 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  36.93 
 
 		 853 aa  371  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 873 aa  365  1e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  34.02 
 
 		 854 aa  360  6e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  35.01 
 
 		 861 aa  352  1e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  36.18 
 
 		 857 aa  338  2.9999999999999997e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  35.71 
 
 		 853 aa  331  4e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  36.08 
 
 		 873 aa  330  5.0000000000000004e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  34.02 
 
 		 838 aa  317  6e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  34.42 
 
 		 839 aa  296  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  30.98 
 
 		 861 aa  296  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  36.04 
 
 		 866 aa  291  3e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  32.99 
 
 		 841 aa  289  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  32.27 
 
 		 855 aa  287  5.999999999999999e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  32.3 
 
 		 825 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  33.75 
 
 		 828 aa  254  6e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  30.57 
 
 		 821 aa  235  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  29.61 
 
 		 871 aa  223  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  32.17 
 
 		 846 aa  210  7e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  26.8 
 
 		 880 aa  206  2e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  31.76 
 
 		 859 aa  191  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  26.24 
 
 		 897 aa  186  2.0000000000000003e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  32.24 
 
 		 855 aa  182  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  25.82 
 
 		 851 aa  181  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  31.7 
 
 		 930 aa  178  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  26.17 
 
 		 850 aa  170  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  29.74 
 
 		 835 aa  169  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  26.46 
 
 		 849 aa  163  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  27.06 
 
 		 854 aa  163  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  26.74 
 
 		 863 aa  161  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  24.38 
 
 		 850 aa  150  9e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  26.6 
 
 		 855 aa  150  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  23.82 
 
 		 855 aa  142  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  25.07 
 
 		 849 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  27.28 
 
 		 807 aa  139  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  31.13 
 
 		 878 aa  136  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  28.18 
 
 		 822 aa  136  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  25.55 
 
 		 870 aa  136  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  26.42 
 
 		 822 aa  134  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 847 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  22.73 
 
 		 849 aa  132  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  24.91 
 
 		 847 aa  125  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  30.45 
 
 		 801 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  27.8 
 
 		 866 aa  123  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  22.16 
 
 		 856 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  27.06 
 
 		 852 aa  119  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  21.91 
 
 		 858 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  25.26 
 
 		 858 aa  117  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  28.49 
 
 		 828 aa  116  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 839 aa  114  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  26.54 
 
 		 844 aa  107  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  26.72 
 
 		 845 aa  103  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  26.2 
 
 		 841 aa  94  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  23.47 
 
 		 857 aa  93.2  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  25.71 
 
 		 874 aa  92.8  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  27.77 
 
 		 843 aa  90.9  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  33.44 
 
 		 846 aa  90.5  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  35.33 
 
 		 452 aa  89.4  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2238  protein of unknown function DUF214  26.38 
 
 		 822 aa  89  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249339  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  26.46 
 
 		 404 aa  88.6  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  24.88 
 
 		 884 aa  89  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  22.65 
 
 		 858 aa  87.4  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  25 
 
 		 855 aa  85.5  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  26.2 
 
 		 853 aa  85.1  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  34.04 
 
 		 443 aa  84.7  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  25.09 
 
 		 833 aa  84.3  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  23.34 
 
 		 857 aa  82  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  26.03 
 
 		 838 aa  81.6  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  27.7 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  25.67 
 
 		 821 aa  81.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3444  putative ABC transporter permease protein  38.35 
 
 		 389 aa  80.5  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0182994  normal  0.122472 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  23.64 
 
 		 857 aa  80.9  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21950  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  44.44 
 
 		 738 aa  79.7  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  31.32 
 
 		 400 aa  79.3  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  24.24 
 
 		 386 aa  79.3  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  27.65 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  19.49 
 
 		 829 aa  78.2  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  43.01 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3051  ABC transporter, permease  19.49 
 
 		 829 aa  77.8  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  26.72 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  34.29 
 
 		 857 aa  77.4  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7809  protein of unknown function DUF214  24.93 
 
 		 775 aa  77  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  22.49 
 
 		 371 aa  77.4  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2922  protein of unknown function DUF214  29.49 
 
 		 826 aa  77.4  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179873  normal  0.823523 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  23.06 
 
 		 413 aa  77  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  25.24 
 
 		 400 aa  77.4  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>