More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2209 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  58.32 
 
 		 839 aa  858    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  93.62 
 
 		 847 aa  1508    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  45.17 
 
 		 849 aa  687    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  44.58 
 
 		 850 aa  666    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 847 aa  1662    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  46.6 
 
 		 845 aa  618  1e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  45.09 
 
 		 870 aa  606  9.999999999999999e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  44.16 
 
 		 866 aa  596  1e-169  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  46.27 
 
 		 837 aa  551  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  39.34 
 
 		 855 aa  533  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  43.51 
 
 		 843 aa  501  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  44.21 
 
 		 843 aa  487  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  36.14 
 
 		 846 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  30.12 
 
 		 858 aa  308  4.0000000000000004e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  30.88 
 
 		 842 aa  236  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  30.63 
 
 		 842 aa  230  7e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  30.69 
 
 		 842 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  31.45 
 
 		 841 aa  226  9e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  27.35 
 
 		 851 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  28 
 
 		 819 aa  220  7.999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  25.82 
 
 		 817 aa  214  7e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  25.9 
 
 		 849 aa  213  9e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  26.32 
 
 		 817 aa  213  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  27.74 
 
 		 858 aa  213  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  26 
 
 		 849 aa  213  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  25.21 
 
 		 817 aa  202  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  26.48 
 
 		 889 aa  202  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  26.61 
 
 		 879 aa  200  9e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  26.97 
 
 		 889 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  26.41 
 
 		 884 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  26.05 
 
 		 850 aa  197  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  27.69 
 
 		 846 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  27.35 
 
 		 857 aa  190  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  27.01 
 
 		 887 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  26.9 
 
 		 855 aa  188  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  28.24 
 
 		 821 aa  188  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  26.17 
 
 		 845 aa  187  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  27.53 
 
 		 887 aa  187  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  25.57 
 
 		 865 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  27.97 
 
 		 821 aa  180  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  26.92 
 
 		 821 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  26.93 
 
 		 889 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  28.17 
 
 		 844 aa  172  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  25.96 
 
 		 878 aa  170  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  25.24 
 
 		 840 aa  169  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  26.62 
 
 		 850 aa  168  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  27.01 
 
 		 855 aa  167  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  26.06 
 
 		 897 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  26.42 
 
 		 857 aa  164  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  26.67 
 
 		 884 aa  154  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  24.65 
 
 		 867 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  23.52 
 
 		 803 aa  153  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  27.01 
 
 		 877 aa  153  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  27.34 
 
 		 877 aa  152  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  30.23 
 
 		 820 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  29.26 
 
 		 836 aa  146  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  25.09 
 
 		 800 aa  145  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  26.83 
 
 		 793 aa  142  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  27.67 
 
 		 802 aa  139  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  24.94 
 
 		 843 aa  135  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  28.09 
 
 		 825 aa  134  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  29.77 
 
 		 820 aa  134  6e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  26.52 
 
 		 852 aa  129  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  30.03 
 
 		 819 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  25.46 
 
 		 855 aa  125  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  30.06 
 
 		 408 aa  124  9e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  29.65 
 
 		 819 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  29.46 
 
 		 820 aa  119  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  29.65 
 
 		 804 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  29.91 
 
 		 800 aa  115  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  30.56 
 
 		 815 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  27.07 
 
 		 849 aa  110  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  24.25 
 
 		 847 aa  109  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  28.97 
 
 		 868 aa  107  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  25.07 
 
 		 836 aa  106  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  27.43 
 
 		 819 aa  105  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  24.09 
 
 		 836 aa  102  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  26.07 
 
 		 848 aa  101  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  24.88 
 
 		 841 aa  99  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  28.85 
 
 		 821 aa  98.2  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2155  protein of unknown function DUF214  31.87 
 
 		 445 aa  97.4  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.755011  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  29.41 
 
 		 826 aa  96.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  29.34 
 
 		 795 aa  95.9  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  24.73 
 
 		 854 aa  95.1  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  31.72 
 
 		 866 aa  93.2  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  26.41 
 
 		 821 aa  90.1  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  28.77 
 
 		 835 aa  89.7  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  28.77 
 
 		 835 aa  89.7  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  24.55 
 
 		 861 aa  88.6  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1541  ABC transporter inner membrane protein  28.49 
 
 		 795 aa  88.6  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  23.21 
 
 		 842 aa  88.6  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  25.96 
 
 		 836 aa  87.4  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  26.98 
 
 		 845 aa  87.4  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  23.3 
 
 		 859 aa  85.1  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  24.92 
 
 		 849 aa  84  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1579  ABC-type transporter protein  20.89 
 
 		 813 aa  83.6  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15291  normal  0.104036 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  29.43 
 
 		 853 aa  81.6  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0192  hypothetical protein  29.21 
 
 		 795 aa  81.6  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431471  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1961  protein of unknown function DUF214  23.13 
 
 		 845 aa  81.3  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  24.69 
 
 		 825 aa  79.7  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>