292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0894 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  100 
 
 
855 aa  1701    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  59.25 
 
 
857 aa  954    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  59.08 
 
 
846 aa  937    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  58.61 
 
 
858 aa  957    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  43.62 
 
 
884 aa  570  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  44.78 
 
 
868 aa  550  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  43.71 
 
 
857 aa  550  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  45.71 
 
 
844 aa  550  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  42.97 
 
 
867 aa  528  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  43.65 
 
 
877 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  43.2 
 
 
877 aa  499  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  43.07 
 
 
853 aa  475  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  40.74 
 
 
855 aa  474  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  40.99 
 
 
866 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  40.79 
 
 
835 aa  450  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  40.79 
 
 
835 aa  450  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  44.44 
 
 
408 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  27.55 
 
 
849 aa  249  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  27.93 
 
 
850 aa  233  9e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  26.4 
 
 
870 aa  227  6e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2155  protein of unknown function DUF214  40.59 
 
 
445 aa  223  8e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.755011  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  27.59 
 
 
855 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  28.98 
 
 
841 aa  218  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  28.06 
 
 
866 aa  210  8e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  29.07 
 
 
843 aa  198  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  26.45 
 
 
847 aa  197  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  26.69 
 
 
847 aa  190  8e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  25.24 
 
 
858 aa  170  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  22.97 
 
 
850 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  30.91 
 
 
845 aa  131  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  30.06 
 
 
837 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  33.23 
 
 
842 aa  120  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  24.03 
 
 
851 aa  119  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  27.89 
 
 
839 aa  118  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  24.26 
 
 
852 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  32.5 
 
 
843 aa  109  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  26.2 
 
 
846 aa  109  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  26.35 
 
 
848 aa  108  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  33.23 
 
 
842 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  32.59 
 
 
842 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  23.27 
 
 
849 aa  106  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  22.97 
 
 
843 aa  101  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  23.59 
 
 
842 aa  100  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  26.85 
 
 
871 aa  97.8  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  22.21 
 
 
884 aa  95.5  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  20.59 
 
 
817 aa  94.4  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  25.47 
 
 
855 aa  94.4  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  27.13 
 
 
839 aa  92  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  23.94 
 
 
855 aa  91.7  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  24.84 
 
 
836 aa  90.1  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  21.98 
 
 
889 aa  89.4  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  20.98 
 
 
878 aa  89  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  23.53 
 
 
836 aa  88.2  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  21.19 
 
 
817 aa  87  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  22.57 
 
 
819 aa  87  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  21.65 
 
 
879 aa  87  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  23.42 
 
 
836 aa  86.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  22.1 
 
 
820 aa  85.1  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  23.11 
 
 
859 aa  84.7  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  23.86 
 
 
880 aa  83.2  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  21.35 
 
 
817 aa  82  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  29.67 
 
 
849 aa  81.3  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  23.44 
 
 
849 aa  81.3  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  24.19 
 
 
855 aa  80.9  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  22.14 
 
 
889 aa  80.9  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  23.08 
 
 
849 aa  80.1  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  21.3 
 
 
845 aa  80.9  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  23.56 
 
 
861 aa  79  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  23.56 
 
 
856 aa  79.3  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  23.71 
 
 
821 aa  79  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  25.12 
 
 
806 aa  79  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  21.73 
 
 
840 aa  77  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  25.08 
 
 
825 aa  76.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  25.31 
 
 
853 aa  76.3  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  24.82 
 
 
845 aa  76.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  24.25 
 
 
854 aa  75.9  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  23.85 
 
 
793 aa  75.1  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  24.36 
 
 
841 aa  74.7  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  23.56 
 
 
836 aa  75.1  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  23.76 
 
 
803 aa  73.9  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  29.33 
 
 
835 aa  73.9  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  25.27 
 
 
819 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  20.85 
 
 
887 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  24.35 
 
 
815 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  26.67 
 
 
847 aa  73.2  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  24.35 
 
 
849 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  23.94 
 
 
802 aa  72.4  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  24.92 
 
 
827 aa  72.4  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4731  protein of unknown function DUF214  25.61 
 
 
842 aa  71.2  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  21.4 
 
 
873 aa  70.9  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  22.82 
 
 
850 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  24.73 
 
 
819 aa  68.2  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  23.24 
 
 
800 aa  68.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  24.85 
 
 
826 aa  67.8  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  21.48 
 
 
854 aa  67.4  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  24.07 
 
 
863 aa  67.4  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  26.59 
 
 
846 aa  65.9  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  20.48 
 
 
829 aa  63.9  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  31.47 
 
 
795 aa  62.4  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  24.79 
 
 
800 aa  62  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.381061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>