More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0672 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  43.65 
 
 
897 aa  654    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  100 
 
 
880 aa  1764    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  34.42 
 
 
878 aa  367  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  35.51 
 
 
859 aa  360  5e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  33.3 
 
 
855 aa  298  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  32.21 
 
 
857 aa  281  3e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  33.22 
 
 
871 aa  259  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  29.03 
 
 
836 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  30.56 
 
 
841 aa  228  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  29.03 
 
 
835 aa  221  3.9999999999999997e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  30.73 
 
 
846 aa  221  6e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  26.95 
 
 
843 aa  215  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  28.25 
 
 
848 aa  207  8e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  29.09 
 
 
838 aa  202  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  27.21 
 
 
842 aa  201  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  29.63 
 
 
839 aa  194  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  26.95 
 
 
825 aa  191  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  26.32 
 
 
856 aa  190  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  27 
 
 
861 aa  183  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  25.61 
 
 
852 aa  179  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  26.26 
 
 
845 aa  171  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  25.74 
 
 
854 aa  169  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  25.27 
 
 
849 aa  167  6.9999999999999995e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  25.43 
 
 
849 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  29.24 
 
 
846 aa  157  7e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  27.16 
 
 
855 aa  154  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  27.47 
 
 
821 aa  146  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  28.85 
 
 
930 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  25.08 
 
 
873 aa  137  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  27.18 
 
 
847 aa  135  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  28.11 
 
 
866 aa  134  7.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  24.74 
 
 
806 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  22.59 
 
 
794 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  22.47 
 
 
850 aa  122  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  27.67 
 
 
834 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  26.45 
 
 
853 aa  109  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2922  protein of unknown function DUF214  27.38 
 
 
826 aa  108  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179873  normal  0.823523 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  38.32 
 
 
859 aa  107  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21950  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  47.09 
 
 
738 aa  104  7e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  26.32 
 
 
853 aa  102  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  20.9 
 
 
856 aa  98.2  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  50 
 
 
828 aa  98.2  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  23.27 
 
 
851 aa  93.2  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  24.51 
 
 
855 aa  92  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  24.87 
 
 
863 aa  86.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  36.3 
 
 
861 aa  86.7  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  25.5 
 
 
858 aa  82  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  24.24 
 
 
857 aa  81.6  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  24.35 
 
 
852 aa  79  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  29.86 
 
 
833 aa  77  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  36.76 
 
 
873 aa  75.9  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  26.06 
 
 
443 aa  75.5  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  33.99 
 
 
406 aa  74.3  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  25.09 
 
 
397 aa  74.3  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  22.83 
 
 
855 aa  73.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  25.12 
 
 
396 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  38.64 
 
 
408 aa  72.4  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  41.94 
 
 
853 aa  72.8  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  27.84 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  27.84 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  26.23 
 
 
452 aa  72  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  27.84 
 
 
383 aa  72  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  27.25 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  19.23 
 
 
829 aa  71.6  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  37.06 
 
 
855 aa  71.6  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  27.84 
 
 
391 aa  71.2  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  27.84 
 
 
391 aa  71.2  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  27.84 
 
 
383 aa  71.6  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  27.84 
 
 
391 aa  71.2  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4065  protein of unknown function DUF214  31.27 
 
 
488 aa  71.6  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  25.71 
 
 
857 aa  71.2  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  27.84 
 
 
384 aa  71.2  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  39.52 
 
 
407 aa  71.2  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  31.62 
 
 
410 aa  70.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  27.27 
 
 
383 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3157  ABC transporter permease  18.79 
 
 
684 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.214324  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  23.56 
 
 
414 aa  69.7  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  27.27 
 
 
391 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  24.46 
 
 
408 aa  69.7  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3051  ABC transporter, permease  18.9 
 
 
829 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  23.95 
 
 
390 aa  69.3  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  25.7 
 
 
854 aa  68.9  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0086  hypothetical protein  40.32 
 
 
438 aa  68.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  33.33 
 
 
393 aa  68.6  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  31.65 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  23.97 
 
 
896 aa  67.4  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  30.61 
 
 
423 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  24.62 
 
 
387 aa  67  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  24.69 
 
 
393 aa  66.6  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  36.97 
 
 
410 aa  65.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001465  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  33.99 
 
 
411 aa  65.9  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0909  hypothetical protein  27.78 
 
 
813 aa  65.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  35.83 
 
 
400 aa  65.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  35.83 
 
 
400 aa  65.1  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  22.09 
 
 
371 aa  65.1  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  34.62 
 
 
411 aa  64.3  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25280  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  37.58 
 
 
397 aa  63.9  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.45906  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  31.21 
 
 
651 aa  63.9  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  36.15 
 
 
410 aa  64.3  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  27.84 
 
 
386 aa  63.5  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>