More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1272 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  47.59 
 
 		 839 aa  666    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  44.58 
 
 		 847 aa  645    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  46.44 
 
 		 849 aa  719    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  100 
 
 		 850 aa  1683    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  47.29 
 
 		 866 aa  654    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  43.7 
 
 		 847 aa  642    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  48.42 
 
 		 870 aa  680    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  46.31 
 
 		 845 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  39.01 
 
 		 855 aa  551  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  47.47 
 
 		 837 aa  551  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  42.94 
 
 		 843 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  43.13 
 
 		 843 aa  497  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  36.82 
 
 		 846 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  27.68 
 
 		 851 aa  270  7e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  28.15 
 
 		 858 aa  263  6.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  29.76 
 
 		 842 aa  253  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  29.83 
 
 		 842 aa  247  6e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  27.86 
 
 		 850 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  29.71 
 
 		 842 aa  242  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  26.93 
 
 		 849 aa  237  7e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  27.94 
 
 		 817 aa  237  8e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  29.51 
 
 		 841 aa  236  9e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  27.29 
 
 		 817 aa  236  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  28.25 
 
 		 858 aa  234  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  26.36 
 
 		 817 aa  231  3e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  27.16 
 
 		 849 aa  230  8e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  27.96 
 
 		 889 aa  227  8e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  28.07 
 
 		 879 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  29.47 
 
 		 855 aa  225  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  28.54 
 
 		 855 aa  224  4e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  29.18 
 
 		 857 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  29.3 
 
 		 857 aa  220  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  28.69 
 
 		 846 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  27.76 
 
 		 884 aa  217  9e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  27.63 
 
 		 889 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  26.85 
 
 		 878 aa  209  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  28.08 
 
 		 887 aa  205  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  28.1 
 
 		 868 aa  200  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  28.23 
 
 		 887 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  27.26 
 
 		 884 aa  198  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  26.8 
 
 		 820 aa  195  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  28.32 
 
 		 825 aa  194  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  28.27 
 
 		 867 aa  195  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  28.64 
 
 		 835 aa  193  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  28.64 
 
 		 835 aa  193  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  28.65 
 
 		 866 aa  193  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  27.67 
 
 		 889 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  26.91 
 
 		 897 aa  190  9e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  27.71 
 
 		 844 aa  190  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  28.51 
 
 		 877 aa  189  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  26.52 
 
 		 836 aa  189  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  26.12 
 
 		 819 aa  187  7e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  28.23 
 
 		 815 aa  184  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  26.97 
 
 		 850 aa  182  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  23.7 
 
 		 865 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  28.57 
 
 		 826 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  26.04 
 
 		 845 aa  174  7.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  26.4 
 
 		 840 aa  172  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  25.88 
 
 		 820 aa  171  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  26.23 
 
 		 821 aa  170  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  28.74 
 
 		 853 aa  167  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  26.89 
 
 		 849 aa  165  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  26.41 
 
 		 821 aa  162  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  25.59 
 
 		 821 aa  160  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  26.45 
 
 		 800 aa  160  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  24.86 
 
 		 843 aa  160  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  25.89 
 
 		 821 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  24.86 
 
 		 855 aa  144  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  33.96 
 
 		 408 aa  139  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  23.53 
 
 		 803 aa  137  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  24.19 
 
 		 842 aa  136  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  27.3 
 
 		 841 aa  135  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  30.57 
 
 		 877 aa  132  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  25.07 
 
 		 847 aa  130  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  26.97 
 
 		 848 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  24.62 
 
 		 861 aa  125  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  23.62 
 
 		 852 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  25.11 
 
 		 859 aa  122  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  25.46 
 
 		 856 aa  120  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  28.05 
 
 		 802 aa  120  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  26.01 
 
 		 793 aa  120  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  24 
 
 		 836 aa  118  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  27.89 
 
 		 820 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  23.63 
 
 		 834 aa  115  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  26.74 
 
 		 836 aa  114  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  27.07 
 
 		 836 aa  114  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  25.99 
 
 		 845 aa  111  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  25.28 
 
 		 821 aa  110  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2155  protein of unknown function DUF214  31.19 
 
 		 445 aa  107  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.755011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  23.56 
 
 		 853 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  29.15 
 
 		 804 aa  105  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  24.3 
 
 		 854 aa  104  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1961  protein of unknown function DUF214  23.24 
 
 		 845 aa  103  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  24.87 
 
 		 855 aa  102  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2956  putative ABC transport system permease protein  28.33 
 
 		 872 aa  100  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1579  ABC-type transporter protein  23.43 
 
 		 813 aa  99.4  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15291  normal  0.104036 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  24.18 
 
 		 825 aa  98.2  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  23.15 
 
 		 873 aa  97.4  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  23.94 
 
 		 849 aa  96.3  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  28.25 
 
 		 800 aa  95.5  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.381061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>