229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1282 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  100 
 
 		 853 aa  1601    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  54.57 
 
 		 867 aa  716    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  55.66 
 
 		 868 aa  720    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  55.85 
 
 		 877 aa  674    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  57.36 
 
 		 857 aa  756    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  55.74 
 
 		 877 aa  672    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  55.04 
 
 		 884 aa  720    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  63.69 
 
 		 844 aa  811    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  54.15 
 
 		 855 aa  634  1e-180  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  52.81 
 
 		 866 aa  624  1e-177  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  43.07 
 
 		 855 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  43.33 
 
 		 858 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  44.76 
 
 		 846 aa  528  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  43.89 
 
 		 857 aa  522  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  40.43 
 
 		 835 aa  381  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  40.43 
 
 		 835 aa  381  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  45.74 
 
 		 408 aa  259  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  29.43 
 
 		 849 aa  239  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  29.01 
 
 		 850 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2155  protein of unknown function DUF214  44.51 
 
 		 445 aa  196  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.755011  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  27.33 
 
 		 858 aa  195  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  28.92 
 
 		 870 aa  189  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  30.67 
 
 		 843 aa  188  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  28.56 
 
 		 847 aa  177  7e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  28.71 
 
 		 839 aa  170  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  26.44 
 
 		 851 aa  169  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  26.21 
 
 		 855 aa  169  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  26.24 
 
 		 850 aa  164  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  27.4 
 
 		 847 aa  161  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  33.23 
 
 		 846 aa  130  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  24 
 
 		 817 aa  128  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  31.01 
 
 		 866 aa  128  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  31.58 
 
 		 845 aa  127  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  27.56 
 
 		 843 aa  120  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  30.48 
 
 		 837 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  23.15 
 
 		 879 aa  107  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  28.04 
 
 		 821 aa  106  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  34.06 
 
 		 842 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  33.65 
 
 		 842 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  22.7 
 
 		 889 aa  105  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  27.13 
 
 		 800 aa  104  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  27.83 
 
 		 848 aa  103  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  22.28 
 
 		 817 aa  101  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  33.54 
 
 		 842 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  22.74 
 
 		 884 aa  99.4  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  22.43 
 
 		 817 aa  98.2  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  25.88 
 
 		 820 aa  96.7  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  22.5 
 
 		 889 aa  95.5  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  25.58 
 
 		 842 aa  94.7  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  26.71 
 
 		 819 aa  94.7  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  22.58 
 
 		 845 aa  91.7  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  22.24 
 
 		 865 aa  89.4  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  31.86 
 
 		 841 aa  88.2  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  23.89 
 
 		 887 aa  88.2  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  26 
 
 		 838 aa  88.2  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  26.29 
 
 		 855 aa  87.8  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  25.72 
 
 		 849 aa  85.5  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  25.54 
 
 		 793 aa  83.6  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  23.54 
 
 		 887 aa  84  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  23.61 
 
 		 897 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  26.46 
 
 		 802 aa  82.4  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  25.06 
 
 		 850 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  25.39 
 
 		 836 aa  82.4  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  26 
 
 		 855 aa  82  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  23.11 
 
 		 878 aa  81.6  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  24.42 
 
 		 847 aa  81.3  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  29.2 
 
 		 821 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  23.5 
 
 		 889 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  24.93 
 
 		 849 aa  77  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  23.12 
 
 		 840 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  26.01 
 
 		 804 aa  76.6  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  27.17 
 
 		 845 aa  75.1  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  28.26 
 
 		 827 aa  73.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  27.58 
 
 		 853 aa  71.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  27.64 
 
 		 852 aa  71.2  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  24.93 
 
 		 836 aa  70.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  21.42 
 
 		 803 aa  69.7  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  25 
 
 		 820 aa  69.7  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  24.57 
 
 		 815 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  22.15 
 
 		 854 aa  69.3  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  24.63 
 
 		 836 aa  68.9  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  27.27 
 
 		 859 aa  68.2  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  25.27 
 
 		 834 aa  67.8  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  27.6 
 
 		 858 aa  67.4  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  26.79 
 
 		 857 aa  67.4  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  26.76 
 
 		 825 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  24.83 
 
 		 930 aa  65.1  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  22.55 
 
 		 849 aa  63.9  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  26.59 
 
 		 826 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  23.77 
 
 		 856 aa  62.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  31.86 
 
 		 843 aa  62.4  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  27.35 
 
 		 839 aa  62  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  27.98 
 
 		 853 aa  61.6  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  29.27 
 
 		 855 aa  61.6  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  24.29 
 
 		 841 aa  60.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  29.26 
 
 		 849 aa  60.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  23.79 
 
 		 856 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  27.19 
 
 		 806 aa  60.1  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  24.26 
 
 		 399 aa  60.1  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  28.22 
 
 		 800 aa  58.9  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.381061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>