More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2119 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
873 aa  1694    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  49.89 
 
 
861 aa  692    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  44.77 
 
 
857 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  46.64 
 
 
853 aa  599  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  45.2 
 
 
866 aa  561  1e-158  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  43.43 
 
 
873 aa  525  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  37.07 
 
 
848 aa  411  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  33.33 
 
 
843 aa  393  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  35.27 
 
 
834 aa  395  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  34.54 
 
 
842 aa  395  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  35.55 
 
 
847 aa  378  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  35.55 
 
 
845 aa  368  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  33.07 
 
 
853 aa  358  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
856 aa  350  5e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  34.04 
 
 
859 aa  347  6e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  30.45 
 
 
852 aa  293  9e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  32.25 
 
 
836 aa  292  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  29.77 
 
 
854 aa  275  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  30.4 
 
 
849 aa  273  9e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  32.44 
 
 
838 aa  272  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  30.25 
 
 
855 aa  250  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  31.8 
 
 
825 aa  248  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  30.76 
 
 
841 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  29.78 
 
 
861 aa  234  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  30.52 
 
 
806 aa  231  6e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  28.73 
 
 
821 aa  230  9e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  31.76 
 
 
853 aa  228  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  29.57 
 
 
849 aa  226  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  31.5 
 
 
828 aa  208  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  29.08 
 
 
839 aa  196  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  26.67 
 
 
855 aa  196  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  25.85 
 
 
880 aa  190  9e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  29.06 
 
 
871 aa  190  9e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  33.95 
 
 
846 aa  177  6e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  29.24 
 
 
835 aa  176  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  29.04 
 
 
859 aa  174  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  31.26 
 
 
930 aa  174  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  25.15 
 
 
897 aa  159  2e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  27.47 
 
 
863 aa  157  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  29.23 
 
 
855 aa  153  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  28.92 
 
 
878 aa  147  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  24.3 
 
 
855 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  24.3 
 
 
850 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  24.11 
 
 
854 aa  127  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  27.67 
 
 
841 aa  126  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  27.03 
 
 
852 aa  120  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  32.31 
 
 
801 aa  118  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  23.26 
 
 
851 aa  115  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  22.18 
 
 
856 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  21.43 
 
 
857 aa  114  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  23.04 
 
 
849 aa  114  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  24.79 
 
 
870 aa  112  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  26.68 
 
 
822 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  22.61 
 
 
858 aa  103  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  22.82 
 
 
850 aa  101  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  27.01 
 
 
828 aa  97.8  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  22.88 
 
 
858 aa  89.7  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2238  protein of unknown function DUF214  25.15 
 
 
822 aa  88.6  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249339  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  21.46 
 
 
855 aa  88.6  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  31.03 
 
 
846 aa  88.2  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  28.21 
 
 
838 aa  85.1  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  20.59 
 
 
829 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3051  ABC transporter, permease  20.59 
 
 
829 aa  83.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  25.12 
 
 
413 aa  80.5  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  24.59 
 
 
866 aa  79.7  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  29.52 
 
 
404 aa  78.6  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  22.08 
 
 
858 aa  77.8  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  30.87 
 
 
413 aa  76.3  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  31.25 
 
 
443 aa  76.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1964  protein of unknown function DUF214  25.76 
 
 
643 aa  75.9  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  20.51 
 
 
896 aa  75.9  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  29.31 
 
 
397 aa  75.9  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  21.74 
 
 
855 aa  75.5  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  25.3 
 
 
849 aa  75.5  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4658  protein of unknown function DUF214  27 
 
 
638 aa  75.5  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  35.25 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  29.22 
 
 
386 aa  74.7  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  32.24 
 
 
414 aa  74.3  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  24.94 
 
 
807 aa  74.3  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  26.1 
 
 
389 aa  73.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  22.13 
 
 
846 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  33.33 
 
 
653 aa  73.9  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  26.22 
 
 
399 aa  73.2  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  22.53 
 
 
857 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2385  protein of unknown function DUF214  31.41 
 
 
466 aa  72  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  33.77 
 
 
715 aa  72.4  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  25.79 
 
 
408 aa  71.2  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  27.84 
 
 
847 aa  70.9  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3157  ABC transporter permease  21.7 
 
 
684 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.214324  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  28.46 
 
 
849 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  27.89 
 
 
443 aa  70.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  26.47 
 
 
390 aa  70.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  31.14 
 
 
404 aa  70.5  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  33.11 
 
 
452 aa  70.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  31.43 
 
 
414 aa  70.5  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  26.9 
 
 
379 aa  70.1  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  31.41 
 
 
401 aa  69.7  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  27.97 
 
 
847 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  44.12 
 
 
857 aa  69.7  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  28.81 
 
 
646 aa  69.7  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>