More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_32350 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  50 
 
 		 873 aa  729    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  53.64 
 
 		 857 aa  710    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  50.54 
 
 		 853 aa  650    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  100 
 
 		 861 aa  1629    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  49.2 
 
 		 866 aa  592  1e-167  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  47.34 
 
 		 873 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  38.91 
 
 		 848 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  35.4 
 
 		 843 aa  402  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  37.27 
 
 		 834 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  36.03 
 
 		 842 aa  388  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  36.24 
 
 		 845 aa  388  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  36.21 
 
 		 859 aa  378  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  35.73 
 
 		 847 aa  375  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  34.97 
 
 		 856 aa  363  8e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  34.81 
 
 		 849 aa  328  3e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  34.73 
 
 		 849 aa  323  6e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  32.2 
 
 		 852 aa  311  2.9999999999999997e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  32.47 
 
 		 855 aa  295  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  29.78 
 
 		 854 aa  286  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  33.17 
 
 		 825 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  32.29 
 
 		 836 aa  267  8e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  32.39 
 
 		 806 aa  260  7e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  30.6 
 
 		 861 aa  253  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  31.19 
 
 		 838 aa  247  8e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  33.13 
 
 		 853 aa  242  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  30.67 
 
 		 821 aa  234  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  34.17 
 
 		 853 aa  232  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  32.14 
 
 		 841 aa  221  6e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  34.2 
 
 		 828 aa  218  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  31.59 
 
 		 801 aa  214  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  31.29 
 
 		 839 aa  209  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  28.14 
 
 		 855 aa  197  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  33.19 
 
 		 846 aa  196  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  29.28 
 
 		 871 aa  187  9e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  32.52 
 
 		 855 aa  176  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 930 aa  172  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  29.57 
 
 		 835 aa  172  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  29.57 
 
 		 859 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  31.57 
 
 		 857 aa  153  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  27.49 
 
 		 863 aa  151  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  30.18 
 
 		 878 aa  149  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  28.35 
 
 		 852 aa  145  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  25.1 
 
 		 855 aa  134  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  24.7 
 
 		 854 aa  132  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  25.87 
 
 		 897 aa  130  9.000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  25.51 
 
 		 849 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  26.2 
 
 		 850 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  27.15 
 
 		 841 aa  117  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  26.87 
 
 		 822 aa  115  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  28.12 
 
 		 880 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  21.74 
 
 		 857 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  24.3 
 
 		 851 aa  110  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  31.97 
 
 		 838 aa  108  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  22.18 
 
 		 858 aa  107  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  25.44 
 
 		 855 aa  106  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  26.03 
 
 		 870 aa  105  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  25.19 
 
 		 849 aa  93.2  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  29.91 
 
 		 828 aa  93.2  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  38.21 
 
 		 846 aa  91.3  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  19.43 
 
 		 850 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  26.55 
 
 		 839 aa  87.8  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2238  protein of unknown function DUF214  28.32 
 
 		 822 aa  87.8  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  19.47 
 
 		 794 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1964  protein of unknown function DUF214  29.89 
 
 		 643 aa  86.3  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  26 
 
 		 866 aa  84.7  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  23.92 
 
 		 829 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3051  ABC transporter, permease  23.92 
 
 		 829 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  23.66 
 
 		 850 aa  83.6  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  25.11 
 
 		 858 aa  81.3  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3157  ABC transporter permease  21.84 
 
 		 684 aa  81.3  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.214324  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  24.97 
 
 		 847 aa  81.3  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  25.76 
 
 		 874 aa  79.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  24.6 
 
 		 896 aa  79  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  25.43 
 
 		 452 aa  78.2  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  35.62 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  22.59 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  30.51 
 
 		 404 aa  76.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2610  protein of unknown function DUF214  28.64 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  31.58 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  34.69 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  25.36 
 
 		 822 aa  74.7  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  32.89 
 
 		 443 aa  74.3  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  19.98 
 
 		 856 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  34.69 
 
 		 415 aa  73.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1676  hypothetical protein  25.23 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.503245  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  24.15 
 
 		 845 aa  72  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  31.51 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  24.18 
 
 		 847 aa  71.2  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  23.41 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  31.03 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  29.68 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0269  hypothetical protein  35.46 
 
 		 414 aa  69.7  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831572  hitchhiker  0.00091516 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3419  hypothetical protein  24.75 
 
 		 821 aa  70.1  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319511  normal  0.0789128 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  30 
 
 		 413 aa  70.1  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  31.13 
 
 		 397 aa  69.7  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  31.21 
 
 		 402 aa  69.7  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  34.29 
 
 		 394 aa  69.3  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4806  protein of unknown function DUF214  29.22 
 
 		 867 aa  69.3  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  27.67 
 
 		 427 aa  69.3  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  21.45 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>