More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4472 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 859 aa  1665    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  43.28 
 
 		 856 aa  573  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  35.77 
 
 		 843 aa  432  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  36.66 
 
 		 842 aa  429  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  37.95 
 
 		 834 aa  424  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  37 
 
 		 847 aa  413  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  37.47 
 
 		 848 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  37.26 
 
 		 857 aa  368  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  36.54 
 
 		 861 aa  365  2e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  34.15 
 
 		 873 aa  364  4e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  36.84 
 
 		 845 aa  361  4e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  33.52 
 
 		 853 aa  358  2.9999999999999997e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  36.23 
 
 		 853 aa  355  1e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  34.43 
 
 		 849 aa  336  1e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  32.15 
 
 		 855 aa  333  6e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 852 aa  331  3e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  34.74 
 
 		 849 aa  331  3e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  31.67 
 
 		 854 aa  329  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  35.04 
 
 		 866 aa  319  1e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  32.63 
 
 		 836 aa  296  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  34.89 
 
 		 838 aa  294  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  33.53 
 
 		 861 aa  287  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  34.77 
 
 		 853 aa  285  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  32 
 
 		 806 aa  271  5e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  31.72 
 
 		 825 aa  254  6e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  30.87 
 
 		 821 aa  252  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  31.4 
 
 		 839 aa  244  6e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  30.48 
 
 		 841 aa  237  6e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  30.67 
 
 		 855 aa  228  4e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  32.62 
 
 		 846 aa  218  5e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  31.07 
 
 		 828 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  33.03 
 
 		 855 aa  194  8e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  30.16 
 
 		 859 aa  189  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  28.42 
 
 		 871 aa  187  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  32.09 
 
 		 930 aa  179  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  28.59 
 
 		 835 aa  175  3.9999999999999995e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  29.09 
 
 		 801 aa  171  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  25.96 
 
 		 850 aa  160  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  25.9 
 
 		 851 aa  157  9e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  45.5 
 
 		 873 aa  156  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  30.22 
 
 		 878 aa  154  7e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  33.68 
 
 		 857 aa  153  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  27.86 
 
 		 852 aa  147  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  24.9 
 
 		 870 aa  145  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  24.61 
 
 		 850 aa  145  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  26.76 
 
 		 849 aa  144  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  27.84 
 
 		 849 aa  144  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  25.42 
 
 		 855 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  29.22 
 
 		 897 aa  134  7.999999999999999e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  27.3 
 
 		 863 aa  134  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  23.1 
 
 		 849 aa  132  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  26.87 
 
 		 841 aa  130  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  25.69 
 
 		 866 aa  127  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  25.37 
 
 		 854 aa  127  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  30.03 
 
 		 846 aa  122  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  26.24 
 
 		 880 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  22.31 
 
 		 857 aa  119  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  24.22 
 
 		 847 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  25.86 
 
 		 855 aa  114  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  24.92 
 
 		 839 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  22.04 
 
 		 856 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  21.53 
 
 		 858 aa  105  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  23.67 
 
 		 847 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21950  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  32.91 
 
 		 738 aa  102  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  23.84 
 
 		 858 aa  102  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0334  protein of unknown function DUF214  23.28 
 
 		 941 aa  102  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.530518  hitchhiker  0.0000549339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  26.34 
 
 		 874 aa  98.2  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  34.71 
 
 		 896 aa  94.7  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  27.37 
 
 		 822 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  25.3 
 
 		 822 aa  92.8  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  28.25 
 
 		 843 aa  90.9  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 		 828 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2238  protein of unknown function DUF214  27.3 
 
 		 822 aa  89.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249339  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  19.74 
 
 		 829 aa  87.8  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3051  ABC transporter, permease  19.74 
 
 		 829 aa  87.4  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3508  protein of unknown function DUF214  32.1 
 
 		 838 aa  84.3  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  25.69 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  23.97 
 
 		 844 aa  84.3  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0909  hypothetical protein  24.16 
 
 		 813 aa  82.4  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0230  protein of unknown function DUF214  25.41 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.78911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0540  hypothetical protein  22.85 
 
 		 868 aa  82  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34537  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  23.32 
 
 		 386 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3157  ABC transporter permease  19.07 
 
 		 684 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.214324  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  25.58 
 
 		 408 aa  80.1  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  33.11 
 
 		 452 aa  79.3  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  33.56 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  22.91 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04780  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  28.18 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  32.19 
 
 		 453 aa  78.2  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  33.61 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  31.52 
 
 		 656 aa  77.4  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2385  protein of unknown function DUF214  25.75 
 
 		 466 aa  76.6  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  25.18 
 
 		 386 aa  75.9  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  26.28 
 
 		 807 aa  75.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  29.94 
 
 		 657 aa  75.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  29.35 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  24.37 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  22.65 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  32.32 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  24.37 
 
 		 391 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>