More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3508 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3508  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 838 aa  1555    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  32.46 
 
 		 863 aa  233  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  29.86 
 
 		 854 aa  220  7e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  32.59 
 
 		 807 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  31.79 
 
 		 828 aa  196  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  30.15 
 
 		 852 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  27.2 
 
 		 855 aa  183  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  33.62 
 
 		 822 aa  178  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  30.73 
 
 		 848 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  29.15 
 
 		 845 aa  154  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  30.5 
 
 		 822 aa  151  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  28.39 
 
 		 834 aa  146  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  32.69 
 
 		 841 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  29.4 
 
 		 859 aa  129  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  26.63 
 
 		 852 aa  126  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  30.59 
 
 		 874 aa  123  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  25.52 
 
 		 861 aa  119  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  26.23 
 
 		 843 aa  117  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  27.98 
 
 		 838 aa  116  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  29.43 
 
 		 821 aa  111  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  25.81 
 
 		 849 aa  110  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  29.76 
 
 		 866 aa  110  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  26.13 
 
 		 842 aa  108  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  28.48 
 
 		 856 aa  107  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  27.43 
 
 		 825 aa  105  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  24.12 
 
 		 873 aa  102  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  27.58 
 
 		 847 aa  95.9  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  26.59 
 
 		 841 aa  94.4  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  27.24 
 
 		 853 aa  94  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  26.59 
 
 		 849 aa  94.4  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  26.24 
 
 		 838 aa  93.2  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  26.63 
 
 		 861 aa  88.6  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2720  protein of unknown function DUF214  27.73 
 
 		 648 aa  88.2  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  29.62 
 
 		 853 aa  82.4  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  26.03 
 
 		 806 aa  82.4  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  25.38 
 
 		 855 aa  82.8  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  24.44 
 
 		 851 aa  82  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  29.26 
 
 		 930 aa  76.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  25.51 
 
 		 853 aa  75.5  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  27.54 
 
 		 839 aa  75.1  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  24.71 
 
 		 854 aa  74.7  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  20.47 
 
 		 858 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  20.61 
 
 		 857 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  22.73 
 
 		 833 aa  71.2  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  25.2 
 
 		 836 aa  70.1  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4806  protein of unknown function DUF214  29.3 
 
 		 867 aa  68.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  24.96 
 
 		 850 aa  67.4  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  27.09 
 
 		 835 aa  67  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  28.01 
 
 		 828 aa  66.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0269  hypothetical protein  26.99 
 
 		 823 aa  67  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4607  protein of unknown function DUF214  27.53 
 
 		 852 aa  65.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.764847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  32.94 
 
 		 873 aa  65.5  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  28.79 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  28.4 
 
 		 855 aa  63.9  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7745  hypothetical protein  32.26 
 
 		 445 aa  63.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  28.54 
 
 		 846 aa  63.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  26.26 
 
 		 849 aa  62  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01532  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  31.54 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 878 aa  60.8  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3549  protein of unknown function DUF214  29.48 
 
 		 386 aa  60.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  26.05 
 
 		 849 aa  60.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0200  protein of unknown function DUF214  26.02 
 
 		 400 aa  59.7  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003990  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  30 
 
 		 414 aa  60.1  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  28.57 
 
 		 399 aa  59.7  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  25.7 
 
 		 880 aa  60.1  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2257  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  27.31 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  24.29 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  20.34 
 
 		 794 aa  58.5  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2657  ABC transporter, inner membrane subunit  29.44 
 
 		 786 aa  58.2  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186828  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  28.68 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1336  hypothetical protein  29.63 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.420659  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  30.53 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  25.94 
 
 		 841 aa  58.2  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  27.41 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0477  protein of unknown function DUF214  20.28 
 
 		 835 aa  57.8  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  23.11 
 
 		 389 aa  57  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  20 
 
 		 850 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1915  protein of unknown function DUF214  28.92 
 
 		 449 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1172  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.57 
 
 		 416 aa  56.6  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0830739  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  32.14 
 
 		 413 aa  56.6  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  29.5 
 
 		 408 aa  56.2  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  23.57 
 
 		 414 aa  56.2  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1632  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.74 
 
 		 410 aa  56.2  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000222973  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  32.28 
 
 		 443 aa  56.2  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2238  protein of unknown function DUF214  27.78 
 
 		 822 aa  55.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249339  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2993  protein of unknown function DUF214  28.14 
 
 		 375 aa  55.5  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  31.43 
 
 		 397 aa  55.1  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1075  hypothetical protein  29.84 
 
 		 828 aa  54.7  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.278561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  22.86 
 
 		 415 aa  55.1  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  22.56 
 
 		 387 aa  54.7  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3204  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.03 
 
 		 427 aa  54.7  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  26.83 
 
 		 430 aa  54.7  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  27.27 
 
 		 414 aa  54.7  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  22.3 
 
 		 429 aa  54.7  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2994  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  27.41 
 
 		 417 aa  54.7  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1964  protein of unknown function DUF214  36.5 
 
 		 643 aa  54.7  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1472  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  27.61 
 
 		 414 aa  54.7  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  26.83 
 
 		 855 aa  53.9  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1602  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  29.23 
 
 		 415 aa  53.9  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0219168  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  29.23 
 
 		 397 aa  54.3  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>