More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5674 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 838 aa  1621    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  38.92 
 
 		 836 aa  462  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  35.87 
 
 		 861 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  36.59 
 
 		 855 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  39.05 
 
 		 825 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  36.66 
 
 		 848 aa  384  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  36.25 
 
 		 842 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  39.16 
 
 		 839 aa  376  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  36.35 
 
 		 841 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  34.39 
 
 		 843 aa  362  2e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  34.18 
 
 		 834 aa  339  9.999999999999999e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 853 aa  321  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  34.1 
 
 		 845 aa  318  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  34.32 
 
 		 856 aa  314  3.9999999999999997e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  33.71 
 
 		 847 aa  309  1.0000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  30.6 
 
 		 854 aa  304  4.0000000000000003e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  34.97 
 
 		 849 aa  298  3e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  34.21 
 
 		 849 aa  289  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  34.73 
 
 		 859 aa  288  2.9999999999999996e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  32.59 
 
 		 873 aa  288  4e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  35.49 
 
 		 846 aa  281  4e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  38.89 
 
 		 930 aa  272  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  31.79 
 
 		 852 aa  265  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  34.55 
 
 		 828 aa  264  4e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  31.96 
 
 		 853 aa  264  4.999999999999999e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  33.07 
 
 		 871 aa  263  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  30 
 
 		 878 aa  262  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  31.92 
 
 		 859 aa  252  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  31.13 
 
 		 821 aa  246  9e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  33.02 
 
 		 806 aa  246  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  31.83 
 
 		 861 aa  241  4e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  29.19 
 
 		 880 aa  234  5e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  30.65 
 
 		 855 aa  234  7.000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  33.38 
 
 		 855 aa  231  4e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  34.94 
 
 		 846 aa  230  8e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  32.52 
 
 		 857 aa  219  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  27.75 
 
 		 897 aa  214  7e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  32.85 
 
 		 853 aa  206  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  30.31 
 
 		 835 aa  201  5e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  31.26 
 
 		 873 aa  199  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  31.45 
 
 		 866 aa  191  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  33.68 
 
 		 857 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  22.23 
 
 		 857 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  27.91 
 
 		 863 aa  147  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  22.13 
 
 		 858 aa  146  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2238  protein of unknown function DUF214  28.38 
 
 		 822 aa  125  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249339  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  25.56 
 
 		 858 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  19.23 
 
 		 856 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  24.52 
 
 		 849 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  24.96 
 
 		 851 aa  115  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  28.14 
 
 		 852 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  29.44 
 
 		 841 aa  112  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  25.59 
 
 		 855 aa  112  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  25 
 
 		 850 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  20.92 
 
 		 833 aa  110  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21950  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  34.45 
 
 		 738 aa  107  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  24.16 
 
 		 849 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  29.91 
 
 		 822 aa  105  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  27.7 
 
 		 870 aa  103  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4048  protein of unknown function DUF214  29.82 
 
 		 826 aa  101  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.078752  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  26.5 
 
 		 854 aa  100  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  24.13 
 
 		 855 aa  100  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  32.31 
 
 		 801 aa  97.4  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  24.33 
 
 		 850 aa  95.5  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  29.31 
 
 		 843 aa  92.4  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  26.8 
 
 		 847 aa  91.7  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  26.69 
 
 		 844 aa  89.7  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  29.21 
 
 		 874 aa  88.6  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  25.62 
 
 		 807 aa  87.4  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  27.05 
 
 		 866 aa  84.7  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  23.61 
 
 		 858 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  26.85 
 
 		 828 aa  80.9  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6689  hypothetical protein  34.54 
 
 		 465 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874754  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  20.03 
 
 		 829 aa  79.3  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3051  ABC transporter, permease  20.03 
 
 		 829 aa  79  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  36.89 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  26.68 
 
 		 839 aa  77.8  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  20.87 
 
 		 387 aa  77  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  23.13 
 
 		 393 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  25.84 
 
 		 408 aa  77  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  21.97 
 
 		 850 aa  77  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4607  protein of unknown function DUF214  31.38 
 
 		 852 aa  75.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.764847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0348  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 		 368 aa  75.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0334  protein of unknown function DUF214  25.99 
 
 		 941 aa  75.5  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.530518  hitchhiker  0.0000549339 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  32.85 
 
 		 896 aa  75.5  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  27.59 
 
 		 847 aa  75.5  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3419  hypothetical protein  23.68 
 
 		 821 aa  75.5  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319511  normal  0.0789128 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35 
 
 		 656 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  26.27 
 
 		 855 aa  74.7  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  21.82 
 
 		 794 aa  74.7  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  25.6 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  35 
 
 		 656 aa  74.7  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1472  putative permease  29.53 
 
 		 716 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2085  putative ABC transporter, permease protein  29.29 
 
 		 475 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01072  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  21.95 
 
 		 397 aa  73.6  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  28.05 
 
 		 394 aa  73.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  32.5 
 
 		 667 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3257  efflux ABC transporter, permease protein  29.59 
 
 		 475 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.289143  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3143  efflux ABC transporter, permease protein  30.1 
 
 		 475 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183035  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2376  efflux ABC transporter, permease protein  29.29 
 
 		 475 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>