76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0850 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
874 aa  1621    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0269  hypothetical protein  44.62 
 
 
823 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  42.16 
 
 
838 aa  467  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4404  protein of unknown function DUF214  45.08 
 
 
822 aa  368  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  35.51 
 
 
863 aa  353  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  31.79 
 
 
854 aa  299  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  38.26 
 
 
822 aa  267  7e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  30.38 
 
 
855 aa  261  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  33.69 
 
 
852 aa  257  8e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  33.7 
 
 
807 aa  236  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  31.5 
 
 
822 aa  194  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  30.59 
 
 
828 aa  175  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  26.61 
 
 
843 aa  119  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  29.64 
 
 
841 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2456  protein of unknown function DUF214  34.29 
 
 
627 aa  107  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0496014  hitchhiker  0.00000468222 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3508  protein of unknown function DUF214  30.72 
 
 
838 aa  107  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40387  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  28.06 
 
 
847 aa  105  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  27.71 
 
 
848 aa  105  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  26.79 
 
 
842 aa  104  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2720  protein of unknown function DUF214  29.79 
 
 
648 aa  104  8e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  26.56 
 
 
859 aa  102  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  27.56 
 
 
855 aa  100  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  26.4 
 
 
834 aa  99.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  35.76 
 
 
640 aa  100  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.983976  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4806  protein of unknown function DUF214  35.87 
 
 
867 aa  97.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  27.12 
 
 
861 aa  94.7  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  27.84 
 
 
825 aa  91.3  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  27.75 
 
 
836 aa  90.5  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  25.95 
 
 
845 aa  86.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  28.21 
 
 
838 aa  81.3  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  27.12 
 
 
853 aa  80.9  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  26.86 
 
 
853 aa  80.1  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  26.83 
 
 
852 aa  80.1  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  27.78 
 
 
853 aa  75.5  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  30.26 
 
 
841 aa  72.4  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  25.81 
 
 
849 aa  72  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  25.69 
 
 
856 aa  68.2  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  31.63 
 
 
866 aa  67  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  34.43 
 
 
801 aa  67.4  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  26.33 
 
 
849 aa  65.5  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  28.5 
 
 
821 aa  65.1  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  26.75 
 
 
873 aa  64.7  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  27.3 
 
 
861 aa  64.3  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  22.12 
 
 
857 aa  63.9  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  28.06 
 
 
835 aa  63.2  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  21.43 
 
 
858 aa  63.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  31.16 
 
 
806 aa  61.6  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  27.4 
 
 
839 aa  60.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  30.2 
 
 
857 aa  60.8  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  20.28 
 
 
833 aa  59.3  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1655  hypothetical protein  31.52 
 
 
809 aa  58.2  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.662381  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1517  hypothetical protein  22.73 
 
 
829 aa  57.4  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.416257  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  27.07 
 
 
930 aa  57.4  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  24.57 
 
 
880 aa  55.8  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7745  hypothetical protein  31.42 
 
 
445 aa  55.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161151  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  25.91 
 
 
854 aa  54.3  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  30.4 
 
 
850 aa  52.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0558  protein of unknown function DUF214  27.05 
 
 
831 aa  52  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  32.22 
 
 
849 aa  49.7  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0906  hypothetical protein  25.4 
 
 
362 aa  50.1  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.831415  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  30.21 
 
 
404 aa  50.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  32.77 
 
 
849 aa  49.7  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1915  protein of unknown function DUF214  30.65 
 
 
449 aa  49.7  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  30.97 
 
 
855 aa  48.1  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0540  hypothetical protein  29.1 
 
 
868 aa  48.1  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34537  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  25.89 
 
 
855 aa  46.6  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  23.25 
 
 
412 aa  46.2  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  28.39 
 
 
857 aa  46.2  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1171  hypothetical protein  27.01 
 
 
404 aa  45.4  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.267769  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0187  hypothetical protein  29.39 
 
 
364 aa  45.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.427109 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1413  hypothetical protein  30.3 
 
 
926 aa  45.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.232958  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  40.57 
 
 
859 aa  45.1  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0446  integral membrane protein-permease component  20.14 
 
 
373 aa  44.7  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  32 
 
 
851 aa  44.7  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  27.22 
 
 
846 aa  44.3  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  23.88 
 
 
896 aa  44.3  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>