121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0558 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0558  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 831 aa  1694    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2149  protein of unknown function DUF214  28.33 
 
 		 831 aa  297  5e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1517  hypothetical protein  22.94 
 
 		 829 aa  152  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.416257  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1244  hypothetical protein  24.31 
 
 		 772 aa  132  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  21.6 
 
 		 833 aa  127  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  25.17 
 
 		 896 aa  107  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0540  hypothetical protein  30.89 
 
 		 868 aa  81.6  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34537  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1535  protein of unknown function DUF214  29.13 
 
 		 967 aa  67.8  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.960064  normal  0.0795907 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1413  hypothetical protein  34.23 
 
 		 926 aa  64.7  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.232958  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5042  ABC transporter, permease protein, putative  25.98 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3734  hypothetical protein  25.97 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637974  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0744  protein of unknown function DUF214  22.97 
 
 		 811 aa  58.5  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0349  protein of unknown function DUF214  23.29 
 
 		 400 aa  56.2  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1825  hypothetical protein  40 
 
 		 424 aa  55.1  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  22.63 
 
 		 857 aa  55.5  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  25.2 
 
 		 397 aa  55.1  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  26.5 
 
 		 843 aa  54.7  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  24.61 
 
 		 871 aa  54.7  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7809  protein of unknown function DUF214  26.54 
 
 		 775 aa  54.3  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6567  protein of unknown function DUF214  40 
 
 		 1101 aa  54.3  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  22.93 
 
 		 825 aa  53.9  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1024  hypothetical protein  23.79 
 
 		 402 aa  53.5  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.210647  normal  0.67232 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  29.71 
 
 		 413 aa  53.9  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 773 aa  53.5  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  23.26 
 
 		 391 aa  52.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 		 874 aa  52.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  32.32 
 
 		 858 aa  51.6  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3394  hypothetical protein  36.71 
 
 		 421 aa  51.6  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453261  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  25.65 
 
 		 401 aa  51.6  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  31.11 
 
 		 389 aa  51.2  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0506  hypothetical protein  22.97 
 
 		 421 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0682613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  27.15 
 
 		 847 aa  50.4  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  20.65 
 
 		 821 aa  50.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  29.53 
 
 		 887 aa  50.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  24.09 
 
 		 853 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  25.41 
 
 		 393 aa  49.7  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  27.59 
 
 		 390 aa  49.7  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  28.37 
 
 		 662 aa  50.1  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  31.3 
 
 		 653 aa  49.7  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1563  protein of unknown function DUF214  28.35 
 
 		 420 aa  49.7  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  24.77 
 
 		 855 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  29.85 
 
 		 443 aa  49.3  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  24.58 
 
 		 419 aa  49.3  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  28.23 
 
 		 859 aa  49.3  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  24.57 
 
 		 410 aa  48.9  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  21.45 
 
 		 406 aa  49.3  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  28.17 
 
 		 645 aa  48.5  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1075  hypothetical protein  22.05 
 
 		 828 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.278561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  26.02 
 
 		 856 aa  48.9  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  25.4 
 
 		 386 aa  48.9  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  21.95 
 
 		 848 aa  48.9  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  23.47 
 
 		 880 aa  48.5  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0681  permease, putative  24.43 
 
 		 421 aa  48.5  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  28.42 
 
 		 399 aa  48.5  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04780  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  30.37 
 
 		 427 aa  48.5  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  29.51 
 
 		 850 aa  48.1  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0541  hypothetical protein  28.95 
 
 		 421 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0551  hypothetical protein  22.3 
 
 		 421 aa  47.8  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  26.01 
 
 		 430 aa  47.8  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  24.06 
 
 		 851 aa  47.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.79 
 
 		 419 aa  47.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3419  hypothetical protein  23.13 
 
 		 821 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319511  normal  0.0789128 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  32.06 
 
 		 443 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  25.84 
 
 		 386 aa  47  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  30.83 
 
 		 400 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  27.61 
 
 		 452 aa  47.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  22.95 
 
 		 425 aa  46.2  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1172  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.9 
 
 		 416 aa  46.2  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0830739  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.05 
 
 		 413 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  29.45 
 
 		 809 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  24.24 
 
 		 414 aa  46.6  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  30.83 
 
 		 400 aa  46.6  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1904  hypothetical protein  27.17 
 
 		 416 aa  45.8  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.745747  hitchhiker  0.00175073 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4471  hypothetical protein  23.46 
 
 		 421 aa  45.8  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  25.42 
 
 		 371 aa  45.8  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  25.99 
 
 		 387 aa  45.8  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2720  protein of unknown function DUF214  32.32 
 
 		 648 aa  45.8  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1971  putative ABC transport system permease protein  36.23 
 
 		 414 aa  45.8  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.61 
 
 		 816 aa  45.8  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  25 
 
 		 404 aa  45.8  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  37.97 
 
 		 846 aa  45.8  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0192  ABC transporter related  23.66 
 
 		 597 aa  45.8  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000020543  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0421  protein of unknown function DUF214  25.38 
 
 		 422 aa  45.8  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0490  protein of unknown function DUF214  30.53 
 
 		 443 aa  45.8  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  33 
 
 		 878 aa  45.8  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  41.07 
 
 		 838 aa  45.8  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.11 
 
 		 413 aa  45.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  27.4 
 
 		 400 aa  45.4  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3700  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.28 
 
 		 417 aa  45.4  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8164 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  28.1 
 
 		 413 aa  45.4  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  26.55 
 
 		 367 aa  45.4  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  24.19 
 
 		 836 aa  45.8  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  21.64 
 
 		 830 aa  45.4  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  25.38 
 
 		 849 aa  45.4  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  30.3 
 
 		 822 aa  45.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  20.92 
 
 		 806 aa  45.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  29.57 
 
 		 395 aa  45.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  24.65 
 
 		 412 aa  45.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0680  protein of unknown function DUF214  20.19 
 
 		 809 aa  45.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  27.42 
 
 		 413 aa  45.4  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>