More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7809 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7809  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
775 aa  1519    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1613  protein of unknown function DUF214  40.54 
 
 
779 aa  478  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.0478935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5641  hypothetical protein  37.92 
 
 
780 aa  401  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.735155  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0680  protein of unknown function DUF214  36.39 
 
 
809 aa  382  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6966  protein of unknown function DUF214  36.05 
 
 
805 aa  362  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1655  hypothetical protein  37.55 
 
 
809 aa  346  8e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.662381  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  24.82 
 
 
852 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1629  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  25.77 
 
 
759 aa  92.4  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.258013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  24.93 
 
 
843 aa  81.6  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0873  hypothetical protein  26.27 
 
 
756 aa  77.4  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.183088 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3419  hypothetical protein  24.47 
 
 
821 aa  75.1  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319511  normal  0.0789128 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2149  protein of unknown function DUF214  25.09 
 
 
831 aa  72.8  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  24.85 
 
 
851 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1075  hypothetical protein  24.49 
 
 
828 aa  72  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.278561  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  33.09 
 
 
419 aa  70.5  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  26.09 
 
 
853 aa  70.5  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  32.61 
 
 
453 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  30.48 
 
 
413 aa  69.3  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  26.9 
 
 
839 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  27.62 
 
 
866 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  31.68 
 
 
855 aa  65.1  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  28.29 
 
 
873 aa  64.3  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  25.62 
 
 
855 aa  64.3  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1147  hypothetical protein  35.19 
 
 
400 aa  63.5  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  29.17 
 
 
457 aa  63.5  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  34.01 
 
 
871 aa  63.2  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3974  protein of unknown function DUF214  25.89 
 
 
952 aa  63.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.146468  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  29.89 
 
 
842 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  26.29 
 
 
849 aa  62.4  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  31.33 
 
 
849 aa  62.4  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  29.5 
 
 
393 aa  62  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1679  hypothetical protein  34.86 
 
 
400 aa  62.4  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  26.96 
 
 
863 aa  61.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  27.98 
 
 
855 aa  61.6  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  25.19 
 
 
850 aa  61.2  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  27.08 
 
 
849 aa  60.8  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0770  hypothetical protein  21.67 
 
 
425 aa  60.5  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.534854  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0371  putative ABC transporter, integral membrane protein  26.07 
 
 
422 aa  60.5  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.258896  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2537  hypothetical protein  23.03 
 
 
793 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.22202  hitchhiker  0.0000000191831 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  27.81 
 
 
870 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  26.75 
 
 
849 aa  60.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  24.18 
 
 
397 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  32.56 
 
 
397 aa  59.7  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  32.85 
 
 
443 aa  59.7  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  32.12 
 
 
452 aa  59.7  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1073  hypothetical protein  24.6 
 
 
384 aa  59.3  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.418174 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  31.06 
 
 
404 aa  59.7  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0349  protein of unknown function DUF214  21.64 
 
 
400 aa  60.1  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  28.6 
 
 
846 aa  60.1  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3743  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.94 
 
 
410 aa  60.1  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14534  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3383  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  28.99 
 
 
409 aa  59.3  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  32.56 
 
 
397 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  32.5 
 
 
858 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3659  protein of unknown function DUF214  27.49 
 
 
462 aa  59.3  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.410687  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  30.66 
 
 
467 aa  59.3  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  34.29 
 
 
847 aa  58.9  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  22 
 
 
404 aa  58.5  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1210  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.32 
 
 
418 aa  58.5  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  25.65 
 
 
845 aa  58.5  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  25.19 
 
 
838 aa  58.2  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  24.53 
 
 
386 aa  58.2  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  26.41 
 
 
849 aa  57.8  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
830 aa  57.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  31.25 
 
 
827 aa  57  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  29.61 
 
 
387 aa  56.2  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  32.82 
 
 
657 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  24.23 
 
 
834 aa  56.2  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1172  hypothetical protein  25.2 
 
 
425 aa  56.2  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.811574  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  25.4 
 
 
419 aa  56.6  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  25.92 
 
 
861 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  34.88 
 
 
847 aa  56.2  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  26.76 
 
 
391 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  27.57 
 
 
839 aa  55.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  29.14 
 
 
379 aa  55.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  24.18 
 
 
414 aa  55.8  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  24.77 
 
 
400 aa  55.8  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  29.28 
 
 
843 aa  55.8  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02835  hypothetical protein  25.79 
 
 
427 aa  55.5  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  29.48 
 
 
397 aa  55.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1599  lipoprotein releasing system  29.01 
 
 
422 aa  55.5  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.526116 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  27.9 
 
 
859 aa  55.1  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0065  ABC transporter permease  19.93 
 
 
772 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.08 
 
 
408 aa  55.1  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  21.28 
 
 
1143 aa  55.1  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  27.07 
 
 
841 aa  54.7  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1763  putative ABC transporter, integral membrane protein  27.51 
 
 
422 aa  54.7  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.412712 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2105  protein of unknown function DUF214  29.23 
 
 
462 aa  54.7  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00482864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  26.66 
 
 
806 aa  54.7  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  24.86 
 
 
896 aa  54.7  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  34.68 
 
 
402 aa  54.7  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  34.68 
 
 
402 aa  54.7  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  26.47 
 
 
856 aa  54.7  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0540  hypothetical protein  37.18 
 
 
868 aa  55.1  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34537  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  32.54 
 
 
848 aa  54.7  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  26.54 
 
 
367 aa  54.7  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  31.2 
 
 
859 aa  54.7  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2233  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  27.17 
 
 
409 aa  54.7  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  23.74 
 
 
443 aa  54.7  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0348  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.93 
 
 
413 aa  54.3  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0384  lipoprotein releasing system transmembrane protein  25.93 
 
 
413 aa  54.3  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>