162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6966 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0680  protein of unknown function DUF214  68.34 
 
 		 809 aa  1038    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6966  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 805 aa  1592    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5641  hypothetical protein  40.73 
 
 		 780 aa  509  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.735155  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1655  hypothetical protein  40.22 
 
 		 809 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.662381  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7809  protein of unknown function DUF214  35.73 
 
 		 775 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1613  protein of unknown function DUF214  36.43 
 
 		 779 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.0478935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  29.5 
 
 		 849 aa  78.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  25.16 
 
 		 870 aa  71.2  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  27.45 
 
 		 866 aa  69.7  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1075  hypothetical protein  21.87 
 
 		 828 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.278561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1629  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  25.03 
 
 		 759 aa  65.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.258013 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3419  hypothetical protein  23.17 
 
 		 821 aa  64.7  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319511  normal  0.0789128 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2512  ABC transporter, permease protein  26.1 
 
 		 775 aa  61.2  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00525405  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  27.64 
 
 		 847 aa  61.2  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  25.1 
 
 		 845 aa  60.8  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  22.28 
 
 		 387 aa  59.7  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  21.67 
 
 		 397 aa  60.1  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  25.71 
 
 		 453 aa  59.3  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  27.46 
 
 		 858 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1440  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.79 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141439  normal  0.211841 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0943  protein of unknown function DUF214  22.1 
 
 		 802 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  28.24 
 
 		 837 aa  57.4  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  28.69 
 
 		 836 aa  57  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  30.39 
 
 		 842 aa  57.4  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  29.66 
 
 		 855 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2228  ABC transporter, permease  25.12 
 
 		 779 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.622849  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2577  ABC transporter, permease protein  26.1 
 
 		 779 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000406057  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1027  hypothetical protein  20.71 
 
 		 786 aa  56.6  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  23.29 
 
 		 851 aa  55.8  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.4 
 
 		 420 aa  55.8  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  27.24 
 
 		 855 aa  55.5  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  19.75 
 
 		 1132 aa  55.5  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  22.68 
 
 		 821 aa  54.7  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  27.34 
 
 		 863 aa  54.3  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2306  ABC transporter permease  25.48 
 
 		 779 aa  53.5  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2274  ABC transporter, permease  26 
 
 		 779 aa  53.5  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000117587  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1906  hypothetical protein  27.08 
 
 		 414 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000396781  hitchhiker  0.00508578 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2481  ABC transporter permease  25.48 
 
 		 779 aa  53.5  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00745912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2502  ABC transporter, permease protein  26 
 
 		 735 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  27.08 
 
 		 443 aa  54.3  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  21.05 
 
 		 393 aa  53.5  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0873  hypothetical protein  24.79 
 
 		 756 aa  53.5  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.183088 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  24.6 
 
 		 855 aa  53.5  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  24.74 
 
 		 397 aa  53.1  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  24.43 
 
 		 430 aa  52.8  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  29.61 
 
 		 861 aa  52.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3748  hypothetical protein  25.98 
 
 		 416 aa  52.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1904  hypothetical protein  24.13 
 
 		 416 aa  52  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.745747  hitchhiker  0.00175073 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2111  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  26.39 
 
 		 427 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.386264  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  24.17 
 
 		 830 aa  51.2  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0481  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  24.84 
 
 		 414 aa  51.2  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0641  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.84 
 
 		 414 aa  51.2  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.256103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1671  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.51 
 
 		 416 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.966628  normal  0.962664 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1577  protein of unknown function DUF214  23 
 
 		 401 aa  51.2  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.340093  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  27.8 
 
 		 852 aa  51.2  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  26.32 
 
 		 847 aa  51.2  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2669  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.65 
 
 		 415 aa  51.2  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0224  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.03 
 
 		 415 aa  50.8  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  25.07 
 
 		 930 aa  50.8  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2109  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  23.93 
 
 		 416 aa  50.8  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  25.1 
 
 		 847 aa  50.8  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  24.6 
 
 		 839 aa  50.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2154  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.59 
 
 		 416 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0219351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2149  protein of unknown function DUF214  22.24 
 
 		 831 aa  50.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  29.86 
 
 		 848 aa  50.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  28.28 
 
 		 408 aa  50.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1468  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.83 
 
 		 420 aa  50.8  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.39 
 
 		 424 aa  50.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3588  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.59 
 
 		 416 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.488659 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  23.27 
 
 		 1090 aa  50.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1695  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.16 
 
 		 416 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0851802 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  22.87 
 
 		 849 aa  50.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  23.77 
 
 		 858 aa  49.7  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3659  protein of unknown function DUF214  27.92 
 
 		 462 aa  50.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.410687  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  27.13 
 
 		 843 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  24.22 
 
 		 413 aa  49.7  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  20.32 
 
 		 737 aa  49.7  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 406 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3974  protein of unknown function DUF214  22.61 
 
 		 952 aa  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.146468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1280  protein of unknown function DUF214  25.6 
 
 		 787 aa  50.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.134975  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3232  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.25 
 
 		 418 aa  49.3  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215903  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  32.61 
 
 		 400 aa  48.9  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  25.68 
 
 		 397 aa  49.3  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0489  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.91 
 
 		 420 aa  49.3  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.83 
 
 		 420 aa  49.3  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2901  hypothetical protein  26.73 
 
 		 411 aa  48.9  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0934048 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  22.42 
 
 		 805 aa  48.5  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  22.34 
 
 		 430 aa  48.9  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  25.11 
 
 		 896 aa  48.5  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  27.86 
 
 		 838 aa  48.5  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  21.59 
 
 		 413 aa  48.5  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  24.24 
 
 		 825 aa  48.1  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  28.86 
 
 		 1130 aa  48.1  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5027  hypothetical protein  27.42 
 
 		 421 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7413  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.34 
 
 		 405 aa  48.1  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14690  Lipoprotein releasing system, hypothetical protein  24.37 
 
 		 416 aa  48.1  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319851  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  25.55 
 
 		 389 aa  47.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1041  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.07 
 
 		 427 aa  47.8  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0901467  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5469  hypothetical protein  31.25 
 
 		 862 aa  47.8  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18562  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3503  protein of unknown function DUF214  27.38 
 
 		 405 aa  48.1  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.570589  normal  0.23151 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>