More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0949 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  100 
 
 
825 aa  1582    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  52.98 
 
 
836 aa  764    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  47.32 
 
 
839 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  40.82 
 
 
841 aa  490  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  37.64 
 
 
855 aa  464  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  38.4 
 
 
861 aa  438  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  38.93 
 
 
838 aa  412  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  44.75 
 
 
930 aa  381  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  36.69 
 
 
848 aa  368  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  32.64 
 
 
847 aa  338  2.9999999999999997e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  32.76 
 
 
843 aa  332  2e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  33.06 
 
 
834 aa  330  7e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  32.47 
 
 
852 aa  320  6e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  32.67 
 
 
842 aa  317  5e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  34.44 
 
 
849 aa  302  2e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  33.72 
 
 
845 aa  293  7e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  37.18 
 
 
828 aa  288  4e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  34.52 
 
 
849 aa  287  7e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  29.95 
 
 
854 aa  286  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  32.56 
 
 
856 aa  282  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  34.38 
 
 
855 aa  273  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  32.24 
 
 
861 aa  272  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  29.78 
 
 
853 aa  272  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  31.28 
 
 
873 aa  269  1e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  34.15 
 
 
846 aa  270  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  32.07 
 
 
859 aa  266  8.999999999999999e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  31.17 
 
 
878 aa  260  9e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  32.89 
 
 
871 aa  258  4e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  33.15 
 
 
859 aa  244  6e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  34.13 
 
 
857 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  31.7 
 
 
821 aa  229  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  32.44 
 
 
853 aa  223  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  27.2 
 
 
880 aa  218  2e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  29.57 
 
 
855 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  31.59 
 
 
806 aa  218  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  31.8 
 
 
853 aa  216  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  33.55 
 
 
835 aa  206  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  26.47 
 
 
897 aa  194  5e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  31.19 
 
 
866 aa  190  8e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  32.86 
 
 
857 aa  178  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  29.69 
 
 
873 aa  175  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2238  protein of unknown function DUF214  30.14 
 
 
822 aa  155  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249339  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  24.11 
 
 
851 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  26.79 
 
 
870 aa  140  8.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  26.99 
 
 
854 aa  135  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  24.24 
 
 
849 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  26.37 
 
 
863 aa  133  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  24.17 
 
 
850 aa  125  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  23.99 
 
 
850 aa  120  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  25.4 
 
 
849 aa  120  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  26.13 
 
 
849 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  23.88 
 
 
855 aa  115  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  25.17 
 
 
855 aa  112  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  27.52 
 
 
841 aa  107  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3051  ABC transporter, permease  21.07 
 
 
829 aa  107  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  21.07 
 
 
829 aa  106  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  20.31 
 
 
858 aa  106  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  25.6 
 
 
807 aa  104  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  19.89 
 
 
856 aa  104  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  20.94 
 
 
857 aa  104  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2922  protein of unknown function DUF214  36.02 
 
 
826 aa  101  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179873  normal  0.823523 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  26.86 
 
 
839 aa  100  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4048  protein of unknown function DUF214  29.99 
 
 
826 aa  100  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.078752  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  27.86 
 
 
842 aa  100  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  28.03 
 
 
842 aa  100  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  26.25 
 
 
852 aa  99.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  26.78 
 
 
822 aa  98.6  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  23.71 
 
 
833 aa  98.2  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  31.95 
 
 
801 aa  97.4  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  28.12 
 
 
841 aa  94.7  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  28.19 
 
 
822 aa  92  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  33.13 
 
 
842 aa  92  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  23.05 
 
 
858 aa  90.9  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  51.06 
 
 
846 aa  90.5  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  27.96 
 
 
828 aa  88.2  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  35.17 
 
 
452 aa  87.4  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21950  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  44.3 
 
 
738 aa  86.7  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  24.43 
 
 
858 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  24.79 
 
 
846 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  24.7 
 
 
857 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  32.41 
 
 
443 aa  82.4  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  27.42 
 
 
874 aa  81.6  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  24.21 
 
 
866 aa  80.9  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  26.98 
 
 
837 aa  79.3  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3157  ABC transporter permease  19.05 
 
 
684 aa  79  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.214324  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1758  putative ABC transport system permease protein  25.61 
 
 
387 aa  78.6  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4065  protein of unknown function DUF214  32.58 
 
 
488 aa  78.2  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  24.87 
 
 
843 aa  77  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  26.39 
 
 
847 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  20.4 
 
 
850 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1765  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.54 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.157209  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  20.26 
 
 
794 aa  74.3  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0889  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.94 
 
 
411 aa  73.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  30.65 
 
 
413 aa  73.6  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  27.15 
 
 
408 aa  73.6  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1175  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.25 
 
 
416 aa  73.2  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.433535  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2729  protein of unknown function DUF214  23.04 
 
 
796 aa  73.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  27.43 
 
 
390 aa  72  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.48 
 
 
411 aa  71.6  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  23.47 
 
 
393 aa  71.6  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>