More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2187 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 839 aa  1616    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  49.35 
 
 		 845 aa  639    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  47.29 
 
 		 850 aa  715    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  58.21 
 
 		 847 aa  906    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  45.93 
 
 		 849 aa  721    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  58.32 
 
 		 847 aa  893    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  48.31 
 
 		 870 aa  624  1e-177  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  47.4 
 
 		 866 aa  612  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  49.05 
 
 		 837 aa  567  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  39.64 
 
 		 855 aa  544  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  45.82 
 
 		 843 aa  518  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  45.61 
 
 		 843 aa  513  1e-144  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  37.84 
 
 		 846 aa  332  2e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  29.56 
 
 		 858 aa  290  9e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  34.8 
 
 		 841 aa  270  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  34.79 
 
 		 842 aa  258  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  34.23 
 
 		 842 aa  248  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  34.23 
 
 		 842 aa  248  4e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  29.27 
 
 		 851 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  29.51 
 
 		 819 aa  237  7e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  27.92 
 
 		 849 aa  231  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  29.38 
 
 		 820 aa  228  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  27.73 
 
 		 849 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  25.21 
 
 		 817 aa  222  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  26.8 
 
 		 889 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  26.79 
 
 		 884 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  26.79 
 
 		 879 aa  220  7e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  27.92 
 
 		 850 aa  217  9e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  25.24 
 
 		 817 aa  216  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  27.39 
 
 		 889 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  25.84 
 
 		 817 aa  216  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  29.3 
 
 		 821 aa  204  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  28.2 
 
 		 858 aa  200  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  28.66 
 
 		 821 aa  197  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  27.1 
 
 		 887 aa  196  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  26.37 
 
 		 887 aa  196  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  28.16 
 
 		 857 aa  196  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  28.78 
 
 		 884 aa  193  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  23.74 
 
 		 865 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  28.34 
 
 		 821 aa  191  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  25.78 
 
 		 845 aa  191  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  27.78 
 
 		 857 aa  189  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  25.86 
 
 		 878 aa  188  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  26.97 
 
 		 850 aa  187  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  27.91 
 
 		 846 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  27.92 
 
 		 867 aa  184  8.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  28.68 
 
 		 868 aa  182  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  29.8 
 
 		 877 aa  178  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  27.5 
 
 		 804 aa  177  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  29.73 
 
 		 844 aa  174  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  28.82 
 
 		 855 aa  174  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  25.72 
 
 		 849 aa  171  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  26.67 
 
 		 800 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  29.1 
 
 		 793 aa  162  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  25.63 
 
 		 803 aa  155  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  26.57 
 
 		 855 aa  147  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  24.3 
 
 		 843 aa  138  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  32.76 
 
 		 820 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  32.53 
 
 		 408 aa  132  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  26.25 
 
 		 889 aa  129  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  28.05 
 
 		 849 aa  127  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  32.15 
 
 		 819 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  26.06 
 
 		 840 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  27.15 
 
 		 825 aa  124  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  29.57 
 
 		 802 aa  123  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  27.87 
 
 		 825 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  27.64 
 
 		 855 aa  121  6e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  31.88 
 
 		 819 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  27.16 
 
 		 841 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  25.93 
 
 		 852 aa  114  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  26.2 
 
 		 836 aa  113  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  24.52 
 
 		 842 aa  110  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  23.2 
 
 		 854 aa  110  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  30.92 
 
 		 820 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2956  putative ABC transport system permease protein  28.82 
 
 		 872 aa  107  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  26.42 
 
 		 848 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  25.08 
 
 		 847 aa  106  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1579  ABC-type transporter protein  23.24 
 
 		 813 aa  106  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15291  normal  0.104036 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  33.88 
 
 		 866 aa  106  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  24 
 
 		 859 aa  106  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2155  protein of unknown function DUF214  34.14 
 
 		 445 aa  106  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.755011  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01331  hypothetical protein  25.25 
 
 		 929 aa  105  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  28.44 
 
 		 853 aa  105  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  27.71 
 
 		 856 aa  105  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  24.2 
 
 		 834 aa  104  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  29.43 
 
 		 800 aa  103  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  26.47 
 
 		 849 aa  103  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  30 
 
 		 819 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  31.67 
 
 		 877 aa  102  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  26.33 
 
 		 836 aa  100  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  27.3 
 
 		 815 aa  100  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  26.96 
 
 		 861 aa  99.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  26.36 
 
 		 836 aa  99  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  32.02 
 
 		 795 aa  97.8  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  28.65 
 
 		 897 aa  96.7  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  28.39 
 
 		 826 aa  96.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  27.42 
 
 		 839 aa  95.9  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  28.4 
 
 		 821 aa  95.1  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  27.19 
 
 		 853 aa  93.2  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0310  hypothetical protein  27.05 
 
 		 753 aa  92  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>