More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2079 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  100 
 
 
896 aa  1808    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0540  hypothetical protein  44.93 
 
 
868 aa  729    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34537  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1535  protein of unknown function DUF214  27.53 
 
 
967 aa  310  5.9999999999999995e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.960064  normal  0.0795907 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  30.1 
 
 
833 aa  164  9e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1517  hypothetical protein  23.89 
 
 
829 aa  117  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.416257  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2149  protein of unknown function DUF214  26.3 
 
 
831 aa  107  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0558  protein of unknown function DUF214  25.34 
 
 
831 aa  95.1  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1244  hypothetical protein  20.6 
 
 
772 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  19.52 
 
 
835 aa  79.7  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  32.03 
 
 
848 aa  78.2  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  32.26 
 
 
853 aa  77.8  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  32.85 
 
 
838 aa  76.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  21.61 
 
 
855 aa  75.5  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  24.84 
 
 
855 aa  73.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  23.51 
 
 
871 aa  72  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2385  protein of unknown function DUF214  21.23 
 
 
466 aa  72  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  30 
 
 
878 aa  70.9  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  24.23 
 
 
841 aa  70.9  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  24.51 
 
 
843 aa  70.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  27.05 
 
 
421 aa  70.1  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  27.5 
 
 
861 aa  68.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  22.33 
 
 
397 aa  68.9  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  22.22 
 
 
852 aa  68.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  23.31 
 
 
859 aa  68.2  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  23.97 
 
 
880 aa  67.4  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  23.65 
 
 
857 aa  67  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0744  protein of unknown function DUF214  24.56 
 
 
811 aa  67.4  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  30.08 
 
 
856 aa  66.6  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  31.5 
 
 
851 aa  65.5  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.52 
 
 
809 aa  65.5  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  21.37 
 
 
857 aa  65.1  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  22.27 
 
 
407 aa  64.3  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  25.36 
 
 
419 aa  63.9  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  20.88 
 
 
834 aa  63.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  27.52 
 
 
397 aa  62.8  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  29.73 
 
 
408 aa  62  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  23.96 
 
 
873 aa  62  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1664  ABC transporter, permease protein, putative  29.87 
 
 
424 aa  61.6  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.45663 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  23.33 
 
 
930 aa  61.6  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  23.08 
 
 
845 aa  61.6  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  21.19 
 
 
387 aa  61.2  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  28.99 
 
 
413 aa  61.2  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  21.97 
 
 
863 aa  61.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  23.54 
 
 
413 aa  60.8  0.00000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3419  hypothetical protein  23.53 
 
 
821 aa  60.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319511  normal  0.0789128 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  32.74 
 
 
859 aa  60.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  33.83 
 
 
855 aa  60.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  27.86 
 
 
409 aa  60.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  29.79 
 
 
404 aa  60.8  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  26.28 
 
 
854 aa  60.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  21.12 
 
 
850 aa  60.1  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  22.11 
 
 
794 aa  60.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  21.27 
 
 
858 aa  59.7  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  24.39 
 
 
897 aa  60.1  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  24.03 
 
 
844 aa  59.7  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1075  hypothetical protein  28.76 
 
 
828 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.278561  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  23.86 
 
 
640 aa  59.3  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  30 
 
 
839 aa  59.3  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  24.27 
 
 
431 aa  59.3  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  23.79 
 
 
654 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.27 
 
 
419 aa  59.3  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  29.71 
 
 
452 aa  58.5  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0939  lipoprotein release system transmembrane protein  26.24 
 
 
396 aa  58.2  0.0000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.866637  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  26.42 
 
 
407 aa  58.5  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  21.41 
 
 
662 aa  58.5  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  26.39 
 
 
842 aa  58.2  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  26.49 
 
 
408 aa  58.2  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  23.96 
 
 
400 aa  57.8  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2282  ABC transporter, permease protein, putative  27.86 
 
 
418 aa  57.4  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0229478 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  25.55 
 
 
648 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  25.55 
 
 
648 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  25.55 
 
 
648 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  25.79 
 
 
404 aa  56.6  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  33.06 
 
 
400 aa  57  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  24.74 
 
 
467 aa  56.6  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1413  hypothetical protein  30.56 
 
 
926 aa  56.6  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.232958  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  27.89 
 
 
873 aa  57  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.55 
 
 
648 aa  57  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  24.1 
 
 
664 aa  57  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  24.26 
 
 
836 aa  57  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  32.26 
 
 
400 aa  56.6  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.55 
 
 
648 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.55 
 
 
648 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.55 
 
 
648 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  28.99 
 
 
1016 aa  56.2  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2927  protein of unknown function DUF214  49.06 
 
 
409 aa  56.2  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.58384  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  33.09 
 
 
406 aa  55.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  24.34 
 
 
643 aa  55.8  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.64 
 
 
413 aa  55.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.18 
 
 
413 aa  55.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  28.83 
 
 
457 aa  55.8  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  29.81 
 
 
885 aa  55.8  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  25.85 
 
 
861 aa  56.2  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  27.78 
 
 
406 aa  56.2  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  22.88 
 
 
391 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1691  protein of unknown function DUF214  24.34 
 
 
295 aa  55.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.132145  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  26.51 
 
 
410 aa  55.8  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  23.31 
 
 
383 aa  55.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  26.9 
 
 
396 aa  55.1  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  28.46 
 
 
395 aa  55.5  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>