More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1744 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  100 
 
 		 836 aa  1622    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  52.23 
 
 		 825 aa  721    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  49.29 
 
 		 839 aa  592  1e-168  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  41.97 
 
 		 841 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  39.42 
 
 		 855 aa  509  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  38.77 
 
 		 861 aa  474  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  38.93 
 
 		 838 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  34.61 
 
 		 843 aa  392  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  35.2 
 
 		 842 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  43.25 
 
 		 930 aa  365  1e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  36.32 
 
 		 848 aa  362  1e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  34.92 
 
 		 834 aa  345  2e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  37.25 
 
 		 849 aa  341  4e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  32.45 
 
 		 847 aa  340  8e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  36.11 
 
 		 849 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  34.03 
 
 		 852 aa  335  2e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  34.07 
 
 		 845 aa  330  5.0000000000000004e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  32.88 
 
 		 856 aa  313  6.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  32.11 
 
 		 854 aa  310  5e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  35.27 
 
 		 846 aa  304  6.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  36.9 
 
 		 828 aa  295  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  32.75 
 
 		 859 aa  286  1.0000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  32.25 
 
 		 873 aa  284  5.000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  29.99 
 
 		 853 aa  276  8e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  33.3 
 
 		 878 aa  271  5e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  33.88 
 
 		 806 aa  270  8e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  29.36 
 
 		 880 aa  267  7e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  33.7 
 
 		 853 aa  261  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  37.39 
 
 		 855 aa  259  1e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  31.71 
 
 		 871 aa  249  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  33.08 
 
 		 859 aa  249  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  27.81 
 
 		 897 aa  241  5.999999999999999e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  33.1 
 
 		 857 aa  239  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  31.82 
 
 		 861 aa  232  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  29.38 
 
 		 821 aa  226  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  28.85 
 
 		 855 aa  223  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  32.36 
 
 		 835 aa  220  7e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  32.69 
 
 		 846 aa  220  7e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  31.49 
 
 		 853 aa  215  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  31.16 
 
 		 866 aa  193  9e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  26.77 
 
 		 851 aa  162  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2238  protein of unknown function DUF214  27.81 
 
 		 822 aa  150  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249339  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21950  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  36.8 
 
 		 738 aa  146  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  25.91 
 
 		 850 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  32.81 
 
 		 857 aa  140  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  24.77 
 
 		 849 aa  138  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  25.07 
 
 		 870 aa  137  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  26.66 
 
 		 863 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  21.22 
 
 		 857 aa  135  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  23.97 
 
 		 850 aa  134  6.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  20.98 
 
 		 858 aa  126  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  25.12 
 
 		 855 aa  125  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  20.78 
 
 		 856 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  23.15 
 
 		 849 aa  113  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  24.08 
 
 		 855 aa  109  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  30.12 
 
 		 801 aa  107  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  26.77 
 
 		 841 aa  105  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  24.82 
 
 		 855 aa  103  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  24.11 
 
 		 858 aa  103  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  26.95 
 
 		 852 aa  99.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  24.09 
 
 		 866 aa  100  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  35.27 
 
 		 873 aa  98.6  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  24.14 
 
 		 854 aa  98.6  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  25.52 
 
 		 847 aa  95.9  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  26.7 
 
 		 839 aa  91.7  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  23.79 
 
 		 858 aa  91.3  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  26.52 
 
 		 828 aa  91.3  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  29.06 
 
 		 822 aa  90.9  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  27.44 
 
 		 874 aa  89  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  25.5 
 
 		 838 aa  88.6  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  20.06 
 
 		 850 aa  87.8  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  25.08 
 
 		 822 aa  87  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  24.35 
 
 		 807 aa  86.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  20.06 
 
 		 794 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  21.54 
 
 		 829 aa  85.5  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3051  ABC transporter, permease  21.54 
 
 		 829 aa  85.5  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  25.59 
 
 		 847 aa  85.1  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3582  protein of unknown function DUF214  34.06 
 
 		 410 aa  83.6  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  34.75 
 
 		 443 aa  84  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  27.9 
 
 		 841 aa  83.2  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  27.44 
 
 		 845 aa  83.2  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  27.24 
 
 		 843 aa  80.5  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  29.64 
 
 		 411 aa  80.5  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4065  protein of unknown function DUF214  32.86 
 
 		 488 aa  80.5  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  28.93 
 
 		 413 aa  79.7  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003048  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  23.53 
 
 		 400 aa  80.1  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  29.39 
 
 		 842 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  32.43 
 
 		 452 aa  78.6  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  29.39 
 
 		 842 aa  78.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  24.11 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  28.24 
 
 		 842 aa  77.4  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  25.36 
 
 		 413 aa  77  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  23.65 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  31.84 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  26.11 
 
 		 833 aa  75.1  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  25.26 
 
 		 843 aa  74.3  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2729  protein of unknown function DUF214  23.96 
 
 		 796 aa  74.3  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  24.42 
 
 		 386 aa  73.9  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1073  hypothetical protein  29.35 
 
 		 384 aa  73.6  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.418174 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.98 
 
 		 411 aa  73.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>