More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11005 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  44.44 
 
 
849 aa  656    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  100 
 
 
855 aa  1714    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  42.82 
 
 
870 aa  581  1e-164  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  43.7 
 
 
845 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  42.48 
 
 
866 aa  575  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  39.01 
 
 
850 aa  556  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  39.34 
 
 
847 aa  542  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  39.34 
 
 
847 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  39.64 
 
 
839 aa  513  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  40 
 
 
843 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  40.42 
 
 
837 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  38 
 
 
843 aa  430  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  34.24 
 
 
846 aa  320  5e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  26.3 
 
 
858 aa  245  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  26.22 
 
 
851 aa  241  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  28.75 
 
 
842 aa  240  9e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  26.46 
 
 
850 aa  239  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  28.31 
 
 
841 aa  237  6e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  28.75 
 
 
842 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  28.38 
 
 
842 aa  227  7e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  26.66 
 
 
858 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  27.4 
 
 
855 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  26.04 
 
 
849 aa  207  8e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  24.86 
 
 
889 aa  204  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  27.6 
 
 
821 aa  204  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  24.74 
 
 
889 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  24.83 
 
 
879 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  24.71 
 
 
849 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  27 
 
 
820 aa  201  6e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  26.42 
 
 
819 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  24.97 
 
 
884 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  24.23 
 
 
817 aa  198  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  26.93 
 
 
846 aa  197  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  23.69 
 
 
817 aa  195  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  24.6 
 
 
840 aa  195  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  24.5 
 
 
817 aa  194  5e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  26.37 
 
 
857 aa  192  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  26.42 
 
 
884 aa  189  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  27.5 
 
 
877 aa  188  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  27.37 
 
 
877 aa  187  6e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  27.57 
 
 
821 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  26.96 
 
 
844 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  24.39 
 
 
887 aa  183  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  23.92 
 
 
887 aa  179  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  24.12 
 
 
878 aa  178  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  24.28 
 
 
849 aa  177  8e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  24.47 
 
 
889 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  27.12 
 
 
835 aa  171  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  27.12 
 
 
835 aa  171  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  25.63 
 
 
868 aa  169  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  26.39 
 
 
857 aa  168  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  25.57 
 
 
855 aa  166  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  27.47 
 
 
821 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  25.5 
 
 
867 aa  165  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  27.15 
 
 
800 aa  162  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  24.45 
 
 
845 aa  161  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  23.82 
 
 
843 aa  158  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  25.53 
 
 
866 aa  156  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  21.59 
 
 
865 aa  153  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  25.58 
 
 
804 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  25.53 
 
 
848 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  24.77 
 
 
847 aa  148  5e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  22.83 
 
 
850 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  25.33 
 
 
853 aa  141  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  24.77 
 
 
855 aa  141  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  23.23 
 
 
842 aa  139  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  28.13 
 
 
820 aa  127  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  22.22 
 
 
803 aa  127  8.000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  25.33 
 
 
836 aa  125  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  23.12 
 
 
852 aa  124  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  25.19 
 
 
897 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  27.15 
 
 
834 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  25.19 
 
 
793 aa  120  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  28.13 
 
 
819 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  25.3 
 
 
853 aa  118  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  24.68 
 
 
841 aa  118  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  23.33 
 
 
856 aa  118  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  29.57 
 
 
408 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  25.33 
 
 
854 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  25.31 
 
 
859 aa  115  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  26.12 
 
 
825 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  27.09 
 
 
819 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  24.46 
 
 
861 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  24.59 
 
 
806 aa  108  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4468  protein of unknown function DUF214  24.43 
 
 
855 aa  108  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  25.71 
 
 
853 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  25 
 
 
836 aa  105  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  25 
 
 
836 aa  105  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  27.07 
 
 
819 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  26.52 
 
 
802 aa  103  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  26.14 
 
 
930 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  24.54 
 
 
853 aa  102  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1961  protein of unknown function DUF214  27.76 
 
 
845 aa  101  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  27.35 
 
 
800 aa  101  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  29.64 
 
 
820 aa  100  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  24.48 
 
 
825 aa  99.4  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  27.38 
 
 
846 aa  98.6  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  24.7 
 
 
845 aa  98.2  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  22.49 
 
 
854 aa  96.3  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0310  hypothetical protein  24.15 
 
 
753 aa  95.5  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>