More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0654 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 835 aa  1618    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 835 aa  1618    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  42.44 
 
 		 858 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  41.83 
 
 		 846 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  41.06 
 
 		 857 aa  490  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  41.03 
 
 		 855 aa  491  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  37.57 
 
 		 884 aa  398  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  38.01 
 
 		 857 aa  398  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  39.18 
 
 		 844 aa  387  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  40.82 
 
 		 853 aa  375  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  38.09 
 
 		 868 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  38.23 
 
 		 855 aa  360  4e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  36.96 
 
 		 867 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  37.88 
 
 		 877 aa  357  5e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  37.91 
 
 		 877 aa  355  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  35.38 
 
 		 866 aa  330  9e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  29.6 
 
 		 849 aa  249  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  27.91 
 
 		 858 aa  240  9e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  28.52 
 
 		 850 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  27.09 
 
 		 855 aa  226  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  27.53 
 
 		 870 aa  220  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  34.15 
 
 		 837 aa  213  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  31.68 
 
 		 842 aa  212  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  31.73 
 
 		 842 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  31.41 
 
 		 842 aa  203  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  30.1 
 
 		 843 aa  197  7e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  28.79 
 
 		 845 aa  196  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  38.73 
 
 		 408 aa  194  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  27.42 
 
 		 866 aa  192  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  26.2 
 
 		 847 aa  178  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  26.79 
 
 		 850 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  25.99 
 
 		 851 aa  170  9e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  26.59 
 
 		 847 aa  170  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2155  protein of unknown function DUF214  36.75 
 
 		 445 aa  169  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.755011  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  23.54 
 
 		 849 aa  140  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  23.87 
 
 		 849 aa  140  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  28.28 
 
 		 846 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  26.39 
 
 		 848 aa  128  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  25.95 
 
 		 847 aa  125  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  32.8 
 
 		 841 aa  119  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  23.97 
 
 		 855 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  24.92 
 
 		 842 aa  111  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  23.66 
 
 		 843 aa  111  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  34.88 
 
 		 843 aa  100  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  21.94 
 
 		 852 aa  96.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  21.88 
 
 		 817 aa  95.5  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  31.8 
 
 		 839 aa  95.1  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  24.83 
 
 		 836 aa  95.1  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  23.37 
 
 		 889 aa  94.4  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  26.42 
 
 		 819 aa  93.6  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  22.39 
 
 		 856 aa  92.8  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  25.04 
 
 		 825 aa  93.2  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  23.15 
 
 		 887 aa  92.8  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  25.29 
 
 		 821 aa  93.2  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  23.32 
 
 		 878 aa  92  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  23.56 
 
 		 879 aa  91.7  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  23.46 
 
 		 887 aa  90.1  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  23.42 
 
 		 889 aa  89  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  23.42 
 
 		 897 aa  89  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  26.56 
 
 		 930 aa  88.2  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  25.22 
 
 		 793 aa  87.4  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  24.48 
 
 		 834 aa  86.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  22.91 
 
 		 884 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  24.96 
 
 		 820 aa  85.1  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  23.68 
 
 		 853 aa  85.1  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  23.59 
 
 		 859 aa  84  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  22.6 
 
 		 855 aa  82.4  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  26.22 
 
 		 838 aa  82.4  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2259  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC, putative  29.08 
 
 		 416 aa  82  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  24.16 
 
 		 889 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  21.3 
 
 		 858 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  25.38 
 
 		 800 aa  80.1  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1814  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.13 
 
 		 416 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.109352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2285  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.13 
 
 		 416 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0114014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2395  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family protein  27.49 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  24.56 
 
 		 821 aa  78.2  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  21.97 
 
 		 817 aa  78.2  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  26.71 
 
 		 839 aa  77.8  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  23.73 
 
 		 806 aa  77.4  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2829  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.95 
 
 		 419 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.417689  normal  0.0183937 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  23.56 
 
 		 841 aa  77  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  26.17 
 
 		 850 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  20.41 
 
 		 817 aa  77.4  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  24.56 
 
 		 845 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1734  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.13 
 
 		 416 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00172788  normal  0.754695 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1579  ABC-type transporter protein  22.84 
 
 		 813 aa  75.9  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15291  normal  0.104036 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  20.92 
 
 		 880 aa  75.5  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  26.29 
 
 		 861 aa  74.7  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1678  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.27 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0156822  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  21.56 
 
 		 857 aa  74.3  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  22.53 
 
 		 865 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  25.93 
 
 		 855 aa  73.9  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  26.39 
 
 		 819 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  23.79 
 
 		 849 aa  72.4  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  25.03 
 
 		 802 aa  71.6  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  24.54 
 
 		 845 aa  71.6  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1904  hypothetical protein  28.14 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.745747  hitchhiker  0.00175073 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  22.42 
 
 		 873 aa  69.3  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2154  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.32 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97636  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  22.14 
 
 		 836 aa  68.6  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>