264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2759 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  56.37 
 
 		 855 aa  950    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  100 
 
 		 854 aa  1682    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  35.04 
 
 		 863 aa  405  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  33.95 
 
 		 852 aa  385  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  36.17 
 
 		 807 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  32.57 
 
 		 828 aa  296  9e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  34.22 
 
 		 822 aa  287  5.999999999999999e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  31.68 
 
 		 874 aa  269  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  30.94 
 
 		 838 aa  260  8e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  32.28 
 
 		 822 aa  249  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0269  hypothetical protein  32.08 
 
 		 823 aa  246  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  31.2 
 
 		 841 aa  206  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4404  protein of unknown function DUF214  31.62 
 
 		 822 aa  188  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  27.06 
 
 		 843 aa  163  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  27.93 
 
 		 847 aa  153  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  26.42 
 
 		 852 aa  147  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  27.76 
 
 		 848 aa  139  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  28.38 
 
 		 841 aa  135  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4607  protein of unknown function DUF214  28.66 
 
 		 852 aa  131  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.764847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  24.88 
 
 		 842 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2720  protein of unknown function DUF214  28.3 
 
 		 648 aa  128  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  25.06 
 
 		 845 aa  127  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  24.94 
 
 		 821 aa  120  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  25.33 
 
 		 856 aa  118  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4806  protein of unknown function DUF214  28.81 
 
 		 867 aa  118  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  25.95 
 
 		 834 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  24.52 
 
 		 853 aa  114  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7745  hypothetical protein  50.4 
 
 		 445 aa  110  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  25.8 
 
 		 855 aa  109  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  25.8 
 
 		 930 aa  109  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  25.33 
 
 		 855 aa  108  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  23.75 
 
 		 873 aa  104  6e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  25.03 
 
 		 859 aa  104  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  26.15 
 
 		 825 aa  100  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  25.22 
 
 		 855 aa  99  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  23.24 
 
 		 854 aa  95.1  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3508  protein of unknown function DUF214  33.06 
 
 		 838 aa  95.5  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  23.91 
 
 		 849 aa  91.7  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  26.1 
 
 		 806 aa  90.9  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1915  protein of unknown function DUF214  33.22 
 
 		 449 aa  90.1  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  24.94 
 
 		 839 aa  88.6  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  21.52 
 
 		 858 aa  87.8  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  27.74 
 
 		 871 aa  87  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  25.98 
 
 		 838 aa  87.4  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  25.57 
 
 		 866 aa  86.7  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  30.97 
 
 		 801 aa  85.1  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  27.61 
 
 		 855 aa  84.7  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  30.26 
 
 		 878 aa  83.6  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  22.13 
 
 		 857 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  24.03 
 
 		 836 aa  82  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  27.27 
 
 		 861 aa  80.9  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  28.81 
 
 		 859 aa  79.3  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  22.94 
 
 		 870 aa  78.6  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  24.77 
 
 		 835 aa  77.4  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  24.63 
 
 		 855 aa  75.5  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2456  protein of unknown function DUF214  27.45 
 
 		 627 aa  75.5  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0496014  hitchhiker  0.00000468222 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4658  protein of unknown function DUF214  27.67 
 
 		 638 aa  73.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1964  protein of unknown function DUF214  26.21 
 
 		 643 aa  71.6  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  19.73 
 
 		 856 aa  71.2  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  24.28 
 
 		 849 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  23.61 
 
 		 853 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  26.51 
 
 		 853 aa  69.3  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  30.28 
 
 		 846 aa  68.6  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  32.8 
 
 		 827 aa  67.8  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1171  hypothetical protein  25.06 
 
 		 404 aa  67.4  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.267769  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  28.35 
 
 		 873 aa  66.6  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  31.02 
 
 		 846 aa  65.9  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  24.18 
 
 		 897 aa  65.9  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  29.41 
 
 		 833 aa  64.7  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  28.37 
 
 		 640 aa  64.3  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.983976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  24.68 
 
 		 857 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  23.5 
 
 		 849 aa  63.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  22.48 
 
 		 850 aa  62.4  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  22.4 
 
 		 851 aa  62  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  25.07 
 
 		 880 aa  62  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1664  ABC transporter, permease protein, putative  28.06 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.45663 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  21.81 
 
 		 850 aa  61.6  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  24.5 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  26.44 
 
 		 857 aa  60.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0334  protein of unknown function DUF214  24.07 
 
 		 941 aa  58.9  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.530518  hitchhiker  0.0000549339 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  25.16 
 
 		 858 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  25.33 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.12 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  29.58 
 
 		 861 aa  57.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1518  permease, putative  22.92 
 
 		 403 aa  57  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000418137  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  22.25 
 
 		 413 aa  57.4  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  23.26 
 
 		 849 aa  56.6  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0906  hypothetical protein  23.53 
 
 		 362 aa  55.8  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.831415  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  24.51 
 
 		 849 aa  55.1  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0477  protein of unknown function DUF214  21.75 
 
 		 835 aa  55.5  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1904  hypothetical protein  28.44 
 
 		 416 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.745747  hitchhiker  0.00175073 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1172  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.71 
 
 		 416 aa  54.7  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0830739  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  23.95 
 
 		 376 aa  54.7  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  34.11 
 
 		 381 aa  54.3  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  21.91 
 
 		 850 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0349  protein of unknown function DUF214  22.89 
 
 		 400 aa  54.3  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  33.61 
 
 		 662 aa  53.9  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  23.95 
 
 		 393 aa  54.3  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  24.94 
 
 		 404 aa  53.5  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1747  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.45 
 
 		 414 aa  53.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.726619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>