89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0256 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  52.56 
 
 
800 aa  688    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  54.17 
 
 
802 aa  666    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1541  ABC transporter inner membrane protein  56.4 
 
 
795 aa  637    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  100 
 
 
793 aa  1536    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  54.86 
 
 
800 aa  660    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  56.05 
 
 
795 aa  631  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  49.33 
 
 
821 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0192  hypothetical protein  56.27 
 
 
795 aa  617  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431471  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  48.77 
 
 
821 aa  592  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  48.77 
 
 
820 aa  585  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  46.82 
 
 
819 aa  569  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  48.59 
 
 
821 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  45.12 
 
 
820 aa  561  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  47.12 
 
 
821 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  43.65 
 
 
825 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  44.6 
 
 
804 aa  511  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  43.87 
 
 
815 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  43.88 
 
 
826 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  44.35 
 
 
820 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  44.02 
 
 
819 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  43.65 
 
 
819 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  43.85 
 
 
819 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  29.5 
 
 
887 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  29.01 
 
 
865 aa  250  6e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  29.38 
 
 
887 aa  249  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  29.77 
 
 
878 aa  249  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  29.38 
 
 
889 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  29.64 
 
 
836 aa  243  7e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  27.77 
 
 
817 aa  243  7.999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  27.16 
 
 
817 aa  241  5e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  29.29 
 
 
836 aa  241  5e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  28.75 
 
 
897 aa  239  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  26.74 
 
 
836 aa  238  4e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  27.85 
 
 
889 aa  237  7e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  27.88 
 
 
884 aa  237  7e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  27.88 
 
 
879 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  27.03 
 
 
817 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  29.03 
 
 
849 aa  235  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  27.61 
 
 
889 aa  232  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  28.13 
 
 
840 aa  231  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  29.98 
 
 
845 aa  217  7e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  29.8 
 
 
850 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0310  hypothetical protein  29.23 
 
 
753 aa  201  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2956  putative ABC transport system permease protein  29.83 
 
 
872 aa  196  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  26.46 
 
 
803 aa  192  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  26.11 
 
 
849 aa  188  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  28.59 
 
 
866 aa  177  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  28.44 
 
 
845 aa  174  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  27.22 
 
 
847 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  28.74 
 
 
839 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  28.37 
 
 
870 aa  162  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  25.27 
 
 
855 aa  159  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  25.8 
 
 
850 aa  158  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  29.38 
 
 
837 aa  157  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  26.64 
 
 
847 aa  151  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1579  ABC-type transporter protein  23.77 
 
 
813 aa  140  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15291  normal  0.104036 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  31.03 
 
 
843 aa  135  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01331  hypothetical protein  25.78 
 
 
929 aa  131  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  23.8 
 
 
858 aa  121  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  31.23 
 
 
843 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  28.87 
 
 
841 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  27.34 
 
 
846 aa  106  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  25.86 
 
 
844 aa  92.4  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  23.48 
 
 
851 aa  92  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  32.49 
 
 
842 aa  87.4  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  24.63 
 
 
858 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  23.59 
 
 
855 aa  85.5  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  26 
 
 
857 aa  84.7  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  26.21 
 
 
884 aa  81.6  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  31.78 
 
 
842 aa  81.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  31.78 
 
 
842 aa  81.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  26.05 
 
 
877 aa  79  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  24.94 
 
 
846 aa  77  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  24.27 
 
 
850 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  25.95 
 
 
408 aa  76.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  23.95 
 
 
857 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  26.24 
 
 
853 aa  75.1  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  23.03 
 
 
867 aa  57.8  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  24.43 
 
 
866 aa  57  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  24.75 
 
 
855 aa  56.6  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  23.73 
 
 
849 aa  55.5  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  21.47 
 
 
855 aa  55.5  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  23.73 
 
 
849 aa  52.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  27.48 
 
 
877 aa  50.1  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  22.94 
 
 
841 aa  49.3  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2954  protein of unknown function DUF214  23.11 
 
 
803 aa  47.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584136 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  24.28 
 
 
848 aa  47  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  24.44 
 
 
854 aa  45.8  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  26.88 
 
 
827 aa  44.7  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.870248 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>