More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2954 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2954  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
803 aa  1634    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3764  protein of unknown function DUF214  44.41 
 
 
714 aa  640    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1760  protein of unknown function DUF214  53.42 
 
 
798 aa  858    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962231  normal  0.806233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4641  protein of unknown function DUF214  69.93 
 
 
836 aa  1133    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0388606  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0948  protein of unknown function DUF214  30.98 
 
 
797 aa  341  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  30.92 
 
 
793 aa  339  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4844  protein of unknown function DUF214  29 
 
 
793 aa  337  5e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357668  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5675  protein of unknown function DUF214  30.27 
 
 
789 aa  334  4e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1120  protein of unknown function DUF214  29.15 
 
 
811 aa  333  8e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00406203  normal  0.905875 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4615  protein of unknown function DUF214  29.48 
 
 
807 aa  332  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4639  protein of unknown function DUF214  30.1 
 
 
791 aa  328  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2744  protein of unknown function DUF214  30.13 
 
 
799 aa  326  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4368  protein of unknown function DUF214  30.77 
 
 
800 aa  325  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.129517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  28.17 
 
 
805 aa  323  9.000000000000001e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  30 
 
 
795 aa  323  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7257  protein of unknown function DUF214  29.88 
 
 
798 aa  321  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506744  normal  0.498638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1450  protein of unknown function DUF214  29.06 
 
 
789 aa  321  3.9999999999999996e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.264856  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0936  protein of unknown function DUF214  29.88 
 
 
793 aa  320  5e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146106  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4616  protein of unknown function DUF214  28.96 
 
 
807 aa  320  5e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.413807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4843  protein of unknown function DUF214  29.72 
 
 
786 aa  318  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.235798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0935  protein of unknown function DUF214  29.25 
 
 
785 aa  317  6e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4627  protein of unknown function DUF214  30.53 
 
 
795 aa  317  7e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689235 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1539  protein of unknown function DUF214  29.44 
 
 
804 aa  315  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4614  protein of unknown function DUF214  28.55 
 
 
801 aa  313  9e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.122129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0959  protein of unknown function DUF214  30.29 
 
 
780 aa  313  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000592859  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  29.87 
 
 
810 aa  311  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4595  protein of unknown function DUF214  29.98 
 
 
800 aa  312  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4847  protein of unknown function DUF214  30.21 
 
 
818 aa  311  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.119483  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4642  protein of unknown function DUF214  27.92 
 
 
801 aa  311  4e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000162597  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5545  protein of unknown function DUF214  29.32 
 
 
788 aa  310  5e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.366096  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  27.99 
 
 
802 aa  310  8e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0946  protein of unknown function DUF214  28.52 
 
 
811 aa  310  9e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0636154  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  28.87 
 
 
770 aa  309  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  29.45 
 
 
798 aa  307  5.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4859  protein of unknown function DUF214  28.3 
 
 
792 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0508357 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4861  protein of unknown function DUF214  29.18 
 
 
798 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1215  protein of unknown function DUF214  29.64 
 
 
791 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0957  protein of unknown function DUF214  28.78 
 
 
785 aa  303  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439448  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  28.05 
 
 
813 aa  302  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2206  protein of unknown function DUF214  28.86 
 
 
777 aa  302  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215529 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0928  protein of unknown function DUF214  30.23 
 
 
800 aa  302  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  29.35 
 
 
808 aa  301  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0931  protein of unknown function DUF214  29.08 
 
 
804 aa  301  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0929  protein of unknown function DUF214  29.23 
 
 
791 aa  300  5e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  29.14 
 
 
792 aa  299  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1753  protein of unknown function DUF214  28.12 
 
 
801 aa  297  5e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  27.6 
 
 
806 aa  297  6e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2853  protein of unknown function DUF214  28.12 
 
 
792 aa  296  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0317184  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3637  protein of unknown function DUF214  26.95 
 
 
834 aa  296  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000286021  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3433  protein of unknown function DUF214  29.03 
 
 
809 aa  296  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560491  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4622  protein of unknown function DUF214  29.57 
 
 
802 aa  294  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.498775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  28.21 
 
 
795 aa  293  9e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4624  protein of unknown function DUF214  27.29 
 
 
811 aa  293  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0927  protein of unknown function DUF214  29.68 
 
 
797 aa  292  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0932  protein of unknown function DUF214  28.07 
 
 
816 aa  291  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  26.89 
 
 
784 aa  288  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4850  protein of unknown function DUF214  28.08 
 
 
791 aa  288  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0898255  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6082  protein of unknown function DUF214  29.07 
 
 
802 aa  289  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165381  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4610  protein of unknown function DUF214  28.48 
 
 
798 aa  288  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.22275 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  28.29 
 
 
816 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1806  protein of unknown function DUF214  28.75 
 
 
790 aa  283  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0944  protein of unknown function DUF214  27.84 
 
 
803 aa  282  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.74129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1804  protein of unknown function DUF214  27.84 
 
 
802 aa  282  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  28.47 
 
 
804 aa  281  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  26.74 
 
 
805 aa  281  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2089  protein of unknown function DUF214  27.85 
 
 
794 aa  280  7e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2178  protein of unknown function DUF214  27.25 
 
 
790 aa  279  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.424889 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0958  protein of unknown function DUF214  29.8 
 
 
797 aa  279  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00075656  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3658  protein of unknown function DUF214  28.96 
 
 
803 aa  280  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0492574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4121  protein of unknown function DUF214  26.95 
 
 
789 aa  279  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0606813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3701  protein of unknown function DUF214  29.55 
 
 
814 aa  279  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000785399  unclonable  0.0000000000000250396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2156  protein of unknown function DUF214  29.1 
 
 
797 aa  278  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.777664  normal  0.702076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4630  protein of unknown function DUF214  27.35 
 
 
816 aa  278  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0603  protein of unknown function DUF214  26.93 
 
 
809 aa  278  4e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.237353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4494  protein of unknown function DUF214  27.39 
 
 
784 aa  277  5e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0599884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3271  protein of unknown function DUF214  27.9 
 
 
795 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  0.0322761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  27.6 
 
 
788 aa  273  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4619  protein of unknown function DUF214  26.7 
 
 
817 aa  270  7e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4700  ABC transporter, permease protein  26.36 
 
 
836 aa  266  8.999999999999999e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4858  protein of unknown function DUF214  28.43 
 
 
809 aa  266  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0512952 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0943  protein of unknown function DUF214  27.94 
 
 
802 aa  265  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0658  protein of unknown function DUF214  28.21 
 
 
793 aa  265  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442095  normal  0.737711 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5431  protein of unknown function DUF214  26.47 
 
 
800 aa  265  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5137  protein of unknown function DUF214  29.02 
 
 
792 aa  265  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.11243 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1651  protein of unknown function DUF214  26.56 
 
 
800 aa  265  4e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.9714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4618  protein of unknown function DUF214  26.9 
 
 
808 aa  261  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.154299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2084  protein of unknown function DUF214  27.11 
 
 
801 aa  261  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.326443  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0925  protein of unknown function DUF214  28.32 
 
 
794 aa  255  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1102  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4621  protein of unknown function DUF214  28.35 
 
 
791 aa  254  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0330  acetylornithine deacetylase ArgE  26.89 
 
 
835 aa  254  6e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.277971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4598  protein of unknown function DUF214  26.25 
 
 
784 aa  252  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665219  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0472  hypothetical protein  27.05 
 
 
807 aa  249  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3774  protein of unknown function DUF214  25.9 
 
 
791 aa  248  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779669  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  25.47 
 
 
805 aa  246  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0960  protein of unknown function DUF214  26.37 
 
 
803 aa  246  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000834077  normal  0.437277 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3610  protein of unknown function DUF214  27.07 
 
 
789 aa  238  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.251487  hitchhiker  0.000460877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4899  protein of unknown function DUF214  24.55 
 
 
802 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000216897  normal  0.089059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4607  protein of unknown function DUF214  25.86 
 
 
811 aa  234  6e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.727239 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3505  ABC transporter, permease protein  25.03 
 
 
804 aa  231  5e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.084112  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0473  hypothetical protein  24.65 
 
 
807 aa  228  4e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>