More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6082 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4615  protein of unknown function DUF214  43.21 
 
 
807 aa  636    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  43.63 
 
 
813 aa  689    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6082  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
802 aa  1647    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165381  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  44.53 
 
 
810 aa  699    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1120  protein of unknown function DUF214  41.54 
 
 
811 aa  639    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00406203  normal  0.905875 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1539  protein of unknown function DUF214  40.41 
 
 
804 aa  582  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4614  protein of unknown function DUF214  40.61 
 
 
801 aa  574  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.122129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  39.61 
 
 
793 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  38.7 
 
 
805 aa  549  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5675  protein of unknown function DUF214  38.52 
 
 
789 aa  551  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5545  protein of unknown function DUF214  39.56 
 
 
788 aa  546  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.366096  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  38.59 
 
 
792 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4595  protein of unknown function DUF214  38.14 
 
 
800 aa  537  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  38.49 
 
 
770 aa  531  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4627  protein of unknown function DUF214  38.67 
 
 
795 aa  528  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0931  protein of unknown function DUF214  38.1 
 
 
804 aa  526  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  37.57 
 
 
805 aa  519  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  37.9 
 
 
795 aa  518  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  36.16 
 
 
795 aa  518  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3433  protein of unknown function DUF214  36.55 
 
 
809 aa  511  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560491  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2206  protein of unknown function DUF214  36.5 
 
 
777 aa  509  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215529 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0935  protein of unknown function DUF214  38.49 
 
 
785 aa  508  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1450  protein of unknown function DUF214  35.71 
 
 
789 aa  499  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.264856  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0936  protein of unknown function DUF214  36.69 
 
 
793 aa  499  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146106  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  35.88 
 
 
788 aa  494  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4847  protein of unknown function DUF214  36.17 
 
 
818 aa  490  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.119483  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  36.2 
 
 
816 aa  491  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0958  protein of unknown function DUF214  35.99 
 
 
797 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00075656  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4843  protein of unknown function DUF214  36.67 
 
 
786 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.235798 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1806  protein of unknown function DUF214  34.03 
 
 
790 aa  479  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4622  protein of unknown function DUF214  35.96 
 
 
802 aa  474  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.498775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2156  protein of unknown function DUF214  35.61 
 
 
797 aa  472  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.777664  normal  0.702076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3271  protein of unknown function DUF214  34.18 
 
 
795 aa  466  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  0.0322761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4844  protein of unknown function DUF214  36.2 
 
 
793 aa  467  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357668  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  35.98 
 
 
784 aa  467  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1753  protein of unknown function DUF214  36.08 
 
 
801 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  34.69 
 
 
805 aa  461  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  34.07 
 
 
798 aa  460  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2853  protein of unknown function DUF214  34.65 
 
 
792 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0317184  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2744  protein of unknown function DUF214  35.76 
 
 
799 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4850  protein of unknown function DUF214  35.5 
 
 
791 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0898255  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2089  protein of unknown function DUF214  33.66 
 
 
794 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4630  protein of unknown function DUF214  35.45 
 
 
816 aa  450  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0948  protein of unknown function DUF214  34.57 
 
 
797 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0925  protein of unknown function DUF214  33.62 
 
 
794 aa  449  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1102  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0927  protein of unknown function DUF214  34.06 
 
 
797 aa  445  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4861  protein of unknown function DUF214  34.67 
 
 
798 aa  443  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3610  protein of unknown function DUF214  35.7 
 
 
789 aa  442  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.251487  hitchhiker  0.000460877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2084  protein of unknown function DUF214  33.82 
 
 
801 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.326443  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1804  protein of unknown function DUF214  33.37 
 
 
802 aa  440  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1215  protein of unknown function DUF214  33.21 
 
 
791 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0957  protein of unknown function DUF214  34.69 
 
 
785 aa  438  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439448  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4598  protein of unknown function DUF214  34.64 
 
 
784 aa  439  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665219  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5137  protein of unknown function DUF214  34.63 
 
 
792 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.11243 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0658  protein of unknown function DUF214  33.62 
 
 
793 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442095  normal  0.737711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4621  protein of unknown function DUF214  34.02 
 
 
791 aa  429  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0929  protein of unknown function DUF214  33.82 
 
 
791 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4610  protein of unknown function DUF214  35.37 
 
 
798 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.22275 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4858  protein of unknown function DUF214  33.41 
 
 
809 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0512952 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  32.45 
 
 
806 aa  423  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3658  protein of unknown function DUF214  33.94 
 
 
803 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0492574 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  32.09 
 
 
802 aa  419  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  33.13 
 
 
804 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0960  protein of unknown function DUF214  32.73 
 
 
803 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000834077  normal  0.437277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3637  protein of unknown function DUF214  33.14 
 
 
834 aa  416  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000286021  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0603  protein of unknown function DUF214  33.13 
 
 
809 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.237353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4368  protein of unknown function DUF214  31.56 
 
 
800 aa  412  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.129517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  31.96 
 
 
808 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0944  protein of unknown function DUF214  34.83 
 
 
803 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.74129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4616  protein of unknown function DUF214  31.9 
 
 
807 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.413807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0946  protein of unknown function DUF214  32.31 
 
 
811 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0636154  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0959  protein of unknown function DUF214  33.9 
 
 
780 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000592859  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0932  protein of unknown function DUF214  32.42 
 
 
816 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4624  protein of unknown function DUF214  33.41 
 
 
811 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4619  protein of unknown function DUF214  33.22 
 
 
817 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2464  protein of unknown function DUF214  32.93 
 
 
792 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427191  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3701  protein of unknown function DUF214  33.57 
 
 
814 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000785399  unclonable  0.0000000000000250396 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4859  protein of unknown function DUF214  31.74 
 
 
792 aa  386  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0508357 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7257  protein of unknown function DUF214  32.65 
 
 
798 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506744  normal  0.498638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3774  protein of unknown function DUF214  30.62 
 
 
791 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779669  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4494  protein of unknown function DUF214  31.17 
 
 
784 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0599884 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4700  ABC transporter, permease protein  33.41 
 
 
836 aa  379  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2178  protein of unknown function DUF214  30.9 
 
 
790 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.424889 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0928  protein of unknown function DUF214  32.1 
 
 
800 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4899  protein of unknown function DUF214  31.18 
 
 
802 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000216897  normal  0.089059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4642  protein of unknown function DUF214  30.91 
 
 
801 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000162597  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1651  protein of unknown function DUF214  29.57 
 
 
800 aa  365  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.9714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5431  protein of unknown function DUF214  29.15 
 
 
800 aa  364  4e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0943  protein of unknown function DUF214  29.84 
 
 
802 aa  362  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0330  acetylornithine deacetylase ArgE  31.38 
 
 
835 aa  361  3e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.277971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4618  protein of unknown function DUF214  30.59 
 
 
808 aa  360  5e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.154299 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4121  protein of unknown function DUF214  30.87 
 
 
789 aa  359  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0606813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4607  protein of unknown function DUF214  32.43 
 
 
811 aa  352  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.727239 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5424  protein of unknown function DUF214  29.53 
 
 
803 aa  347  4e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00458607  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3505  ABC transporter, permease protein  31.13 
 
 
804 aa  346  1e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.084112  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0472  hypothetical protein  28.74 
 
 
807 aa  334  4e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1329  hypothetical protein  28.42 
 
 
809 aa  328  2.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0473  hypothetical protein  28.86 
 
 
807 aa  323  6e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0955  protein of unknown function DUF214  29.69 
 
 
799 aa  310  6.999999999999999e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2599  protein of unknown function DUF214  29.21 
 
 
812 aa  301  4e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>