More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4494 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4494  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
784 aa  1612    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0599884 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4616  protein of unknown function DUF214  37.53 
 
 
807 aa  558  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.413807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  36.93 
 
 
802 aa  550  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4368  protein of unknown function DUF214  38.18 
 
 
800 aa  537  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.129517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0603  protein of unknown function DUF214  37.5 
 
 
809 aa  524  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.237353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4619  protein of unknown function DUF214  37.39 
 
 
817 aa  515  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4610  protein of unknown function DUF214  37.22 
 
 
798 aa  506  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.22275 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7257  protein of unknown function DUF214  36.44 
 
 
798 aa  501  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506744  normal  0.498638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0946  protein of unknown function DUF214  37.3 
 
 
811 aa  498  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0636154  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  36.69 
 
 
793 aa  498  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2178  protein of unknown function DUF214  35.38 
 
 
790 aa  477  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.424889 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4614  protein of unknown function DUF214  34.56 
 
 
801 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.122129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1539  protein of unknown function DUF214  35.11 
 
 
804 aa  467  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3774  protein of unknown function DUF214  35.74 
 
 
791 aa  466  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779669  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4642  protein of unknown function DUF214  34.49 
 
 
801 aa  465  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000162597  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4595  protein of unknown function DUF214  34.81 
 
 
800 aa  463  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0928  protein of unknown function DUF214  34.62 
 
 
800 aa  459  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5431  protein of unknown function DUF214  34.1 
 
 
800 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2206  protein of unknown function DUF214  34.02 
 
 
777 aa  449  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4121  protein of unknown function DUF214  34.74 
 
 
789 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0606813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4615  protein of unknown function DUF214  34.76 
 
 
807 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1120  protein of unknown function DUF214  33.66 
 
 
811 aa  440  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00406203  normal  0.905875 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  34.57 
 
 
792 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4627  protein of unknown function DUF214  32.46 
 
 
795 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689235 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5675  protein of unknown function DUF214  34.33 
 
 
789 aa  439  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0958  protein of unknown function DUF214  32.71 
 
 
797 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00075656  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  32.56 
 
 
806 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  33 
 
 
770 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4859  protein of unknown function DUF214  33.17 
 
 
792 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0508357 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5545  protein of unknown function DUF214  33.92 
 
 
788 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.366096  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  34.1 
 
 
805 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1651  protein of unknown function DUF214  33.17 
 
 
800 aa  419  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.9714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0935  protein of unknown function DUF214  33.42 
 
 
785 aa  416  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  32.81 
 
 
813 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4847  protein of unknown function DUF214  33.41 
 
 
818 aa  411  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.119483  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0932  protein of unknown function DUF214  32.85 
 
 
816 aa  411  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2084  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
801 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.326443  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  32.35 
 
 
805 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  32.71 
 
 
795 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
810 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  32.39 
 
 
795 aa  399  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3433  protein of unknown function DUF214  33.41 
 
 
809 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560491  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  30.37 
 
 
805 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4861  protein of unknown function DUF214  31.81 
 
 
798 aa  396  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1450  protein of unknown function DUF214  32.09 
 
 
789 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.264856  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  33.09 
 
 
798 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  31.01 
 
 
804 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4843  protein of unknown function DUF214  32.13 
 
 
786 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.235798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4598  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
784 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665219  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0929  protein of unknown function DUF214  32.18 
 
 
791 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  30.67 
 
 
808 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0936  protein of unknown function DUF214  32.14 
 
 
793 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146106  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0931  protein of unknown function DUF214  32.76 
 
 
804 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3658  protein of unknown function DUF214  31.52 
 
 
803 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0492574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2156  protein of unknown function DUF214  32.56 
 
 
797 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.777664  normal  0.702076 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4844  protein of unknown function DUF214  32.35 
 
 
793 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357668  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  30.63 
 
 
784 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1215  protein of unknown function DUF214  32.09 
 
 
791 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1753  protein of unknown function DUF214  32.36 
 
 
801 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0944  protein of unknown function DUF214  31.2 
 
 
803 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.74129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4624  protein of unknown function DUF214  30.5 
 
 
811 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0948  protein of unknown function DUF214  31.26 
 
 
797 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  29.37 
 
 
816 aa  365  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0959  protein of unknown function DUF214  30.38 
 
 
780 aa  365  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000592859  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4622  protein of unknown function DUF214  31.94 
 
 
802 aa  364  4e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.498775 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3271  protein of unknown function DUF214  30.39 
 
 
795 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  0.0322761 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3701  protein of unknown function DUF214  31.98 
 
 
814 aa  363  6e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000785399  unclonable  0.0000000000000250396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0927  protein of unknown function DUF214  30.9 
 
 
797 aa  361  3e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2853  protein of unknown function DUF214  31.21 
 
 
792 aa  360  8e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0317184  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  31.72 
 
 
788 aa  359  8e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6082  protein of unknown function DUF214  31.3 
 
 
802 aa  359  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165381  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1806  protein of unknown function DUF214  29.46 
 
 
790 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4630  protein of unknown function DUF214  31.97 
 
 
816 aa  358  2.9999999999999997e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2089  protein of unknown function DUF214  28.93 
 
 
794 aa  357  5.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0960  protein of unknown function DUF214  29.89 
 
 
803 aa  348  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000834077  normal  0.437277 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0658  protein of unknown function DUF214  31 
 
 
793 aa  348  3e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442095  normal  0.737711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0957  protein of unknown function DUF214  29.18 
 
 
785 aa  347  4e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439448  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4607  protein of unknown function DUF214  30.79 
 
 
811 aa  346  8.999999999999999e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.727239 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4858  protein of unknown function DUF214  30.88 
 
 
809 aa  345  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0512952 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0943  protein of unknown function DUF214  31.3 
 
 
802 aa  345  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3637  protein of unknown function DUF214  29.1 
 
 
834 aa  344  5e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000286021  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0925  protein of unknown function DUF214  29.99 
 
 
794 aa  343  5.999999999999999e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1102  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1804  protein of unknown function DUF214  31.06 
 
 
802 aa  343  9e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4618  protein of unknown function DUF214  28.54 
 
 
808 aa  335  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.154299 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4850  protein of unknown function DUF214  29.52 
 
 
791 aa  332  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0898255  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2744  protein of unknown function DUF214  30.46 
 
 
799 aa  330  7e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4621  protein of unknown function DUF214  28.02 
 
 
791 aa  324  5e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0330  acetylornithine deacetylase ArgE  29.11 
 
 
835 aa  322  1.9999999999999998e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.277971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3610  protein of unknown function DUF214  29.48 
 
 
789 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.251487  hitchhiker  0.000460877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5137  protein of unknown function DUF214  31.15 
 
 
792 aa  319  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.11243 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2464  protein of unknown function DUF214  30.49 
 
 
792 aa  319  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427191  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4700  ABC transporter, permease protein  29.28 
 
 
836 aa  309  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4899  protein of unknown function DUF214  28.5 
 
 
802 aa  303  9e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000216897  normal  0.089059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4639  protein of unknown function DUF214  28.59 
 
 
791 aa  302  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3505  ABC transporter, permease protein  29.04 
 
 
804 aa  288  4e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.084112  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5424  protein of unknown function DUF214  27.45 
 
 
803 aa  281  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00458607  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0472  hypothetical protein  27.35 
 
 
807 aa  278  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2598  protein of unknown function DUF214  29.23 
 
 
813 aa  274  4.0000000000000004e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1760  protein of unknown function DUF214  28.25 
 
 
798 aa  271  5e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962231  normal  0.806233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3764  protein of unknown function DUF214  29.23 
 
 
714 aa  268  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>