More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4700 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4700  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 836 aa  1712    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0330  acetylornithine deacetylase ArgE  55.74 
 
 		 835 aa  964    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.277971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1120  protein of unknown function DUF214  33.25 
 
 		 811 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00406203  normal  0.905875 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  32.78 
 
 		 793 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  34.68 
 
 		 792 aa  423  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 813 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4614  protein of unknown function DUF214  35.02 
 
 		 801 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.122129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  31.92 
 
 		 810 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4615  protein of unknown function DUF214  33.68 
 
 		 807 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4595  protein of unknown function DUF214  32.44 
 
 		 800 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0958  protein of unknown function DUF214  32.35 
 
 		 797 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00075656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  31.97 
 
 		 805 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4847  protein of unknown function DUF214  32.48 
 
 		 818 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.119483  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5675  protein of unknown function DUF214  32.98 
 
 		 789 aa  399  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  32.43 
 
 		 805 aa  399  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2206  protein of unknown function DUF214  31.64 
 
 		 777 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1539  protein of unknown function DUF214  32.71 
 
 		 804 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0931  protein of unknown function DUF214  31.84 
 
 		 804 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0936  protein of unknown function DUF214  32.44 
 
 		 793 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5545  protein of unknown function DUF214  31.67 
 
 		 788 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.366096  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4844  protein of unknown function DUF214  31.13 
 
 		 793 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357668  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6082  protein of unknown function DUF214  33.64 
 
 		 802 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4627  protein of unknown function DUF214  30.85 
 
 		 795 aa  355  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.689235 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  29.71 
 
 		 788 aa  354  4e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3433  protein of unknown function DUF214  30.52 
 
 		 809 aa  351  3e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0948  protein of unknown function DUF214  29.8 
 
 		 797 aa  350  5e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1450  protein of unknown function DUF214  30.21 
 
 		 789 aa  350  6e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.264856  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4616  protein of unknown function DUF214  30.53 
 
 		 807 aa  350  9e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.413807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0935  protein of unknown function DUF214  31.24 
 
 		 785 aa  348  4e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2599  protein of unknown function DUF214  29.63 
 
 		 812 aa  347  7e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2598  protein of unknown function DUF214  30.4 
 
 		 813 aa  345  2e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  30.65 
 
 		 795 aa  345  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4843  protein of unknown function DUF214  31.86 
 
 		 786 aa  340  8e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.235798 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  31.07 
 
 		 798 aa  335  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4622  protein of unknown function DUF214  30.29 
 
 		 802 aa  335  3e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.498775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  29.47 
 
 		 802 aa  334  4e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1215  protein of unknown function DUF214  30.63 
 
 		 791 aa  333  6e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7257  protein of unknown function DUF214  30.09 
 
 		 798 aa  332  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506744  normal  0.498638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  30.34 
 
 		 770 aa  330  6e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0603  protein of unknown function DUF214  30.05 
 
 		 809 aa  326  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.237353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  29.24 
 
 		 816 aa  325  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1753  protein of unknown function DUF214  29.53 
 
 		 801 aa  325  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4610  protein of unknown function DUF214  29.82 
 
 		 798 aa  324  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22275 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4494  protein of unknown function DUF214  29.48 
 
 		 784 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0599884 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  29.78 
 
 		 795 aa  322  3e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  27.08 
 
 		 806 aa  320  9e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4861  protein of unknown function DUF214  29.73 
 
 		 798 aa  319  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4624  protein of unknown function DUF214  29.41 
 
 		 811 aa  319  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  29.69 
 
 		 784 aa  316  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3637  protein of unknown function DUF214  29.34 
 
 		 834 aa  315  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000286021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0658  protein of unknown function DUF214  29.03 
 
 		 793 aa  313  5.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442095  normal  0.737711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2178  protein of unknown function DUF214  28.91 
 
 		 790 aa  313  6.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.424889 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3505  ABC transporter, permease protein  28.86 
 
 		 804 aa  313  1e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.084112  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2744  protein of unknown function DUF214  28.42 
 
 		 799 aa  312  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4618  protein of unknown function DUF214  29.58 
 
 		 808 aa  311  4e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.154299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4598  protein of unknown function DUF214  29.85 
 
 		 784 aa  311  4e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2853  protein of unknown function DUF214  29.95 
 
 		 792 aa  310  8e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0317184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0929  protein of unknown function DUF214  28.11 
 
 		 791 aa  309  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4368  protein of unknown function DUF214  28.47 
 
 		 800 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.129517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4619  protein of unknown function DUF214  28.7 
 
 		 817 aa  308  4.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3774  protein of unknown function DUF214  27.83 
 
 		 791 aa  307  4.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4850  protein of unknown function DUF214  29.05 
 
 		 791 aa  307  5.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0898255  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  27.99 
 
 		 804 aa  307  5.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2084  protein of unknown function DUF214  29.31 
 
 		 801 aa  306  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.326443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4630  protein of unknown function DUF214  30.07 
 
 		 816 aa  306  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1804  protein of unknown function DUF214  29.05 
 
 		 802 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0928  protein of unknown function DUF214  29.69 
 
 		 800 aa  303  7.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0957  protein of unknown function DUF214  29.59 
 
 		 785 aa  303  7.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2089  protein of unknown function DUF214  28.34 
 
 		 794 aa  303  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0925  protein of unknown function DUF214  29.24 
 
 		 794 aa  301  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1102  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2156  protein of unknown function DUF214  30.48 
 
 		 797 aa  301  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.777664  normal  0.702076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3271  protein of unknown function DUF214  28.74 
 
 		 795 aa  300  5e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  0.0322761 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  27.89 
 
 		 805 aa  300  6e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1806  protein of unknown function DUF214  28.79 
 
 		 790 aa  299  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4858  protein of unknown function DUF214  28.6 
 
 		 809 aa  298  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0512952 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3701  protein of unknown function DUF214  30.85 
 
 		 814 aa  298  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000785399  unclonable  0.0000000000000250396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0927  protein of unknown function DUF214  28.24 
 
 		 797 aa  298  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0960  protein of unknown function DUF214  26.4 
 
 		 803 aa  297  5e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000834077  normal  0.437277 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3658  protein of unknown function DUF214  28.52 
 
 		 803 aa  296  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0492574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0946  protein of unknown function DUF214  27.26 
 
 		 811 aa  295  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0636154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4642  protein of unknown function DUF214  28.65 
 
 		 801 aa  294  5e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000162597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3610  protein of unknown function DUF214  29.26 
 
 		 789 aa  293  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.251487  hitchhiker  0.000460877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4621  protein of unknown function DUF214  28.72 
 
 		 791 aa  292  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4607  protein of unknown function DUF214  27.33 
 
 		 811 aa  291  5.0000000000000004e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.727239 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0944  protein of unknown function DUF214  30.46 
 
 		 803 aa  290  7e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.74129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4859  protein of unknown function DUF214  27.56 
 
 		 792 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0508357 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0932  protein of unknown function DUF214  27.69 
 
 		 816 aa  285  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3765  protein of unknown function DUF214  28.64 
 
 		 801 aa  285  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.709243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1651  protein of unknown function DUF214  26.84 
 
 		 800 aa  284  4.0000000000000003e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.9714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  26.92 
 
 		 808 aa  282  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0959  protein of unknown function DUF214  28.79 
 
 		 780 aa  281  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000592859  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5137  protein of unknown function DUF214  27.95 
 
 		 792 aa  273  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11243 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4121  protein of unknown function DUF214  28.71 
 
 		 789 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0606813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0943  protein of unknown function DUF214  26.17 
 
 		 802 aa  268  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1760  protein of unknown function DUF214  26.17 
 
 		 798 aa  266  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962231  normal  0.806233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2464  protein of unknown function DUF214  28.3 
 
 		 792 aa  264  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4899  protein of unknown function DUF214  26.09 
 
 		 802 aa  263  8e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000216897  normal  0.089059 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5424  protein of unknown function DUF214  29.49 
 
 		 803 aa  263  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00458607  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2954  protein of unknown function DUF214  26.73 
 
 		 803 aa  262  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4639  protein of unknown function DUF214  27 
 
 		 791 aa  251  6e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>