More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3610 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  51.08 
 
 
784 aa  815    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2853  protein of unknown function DUF214  50 
 
 
792 aa  785    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0317184  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3610  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
789 aa  1604    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.251487  hitchhiker  0.000460877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0936  protein of unknown function DUF214  42.23 
 
 
793 aa  597  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146106  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0935  protein of unknown function DUF214  40.81 
 
 
785 aa  588  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0929  protein of unknown function DUF214  40.65 
 
 
791 aa  584  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0959  protein of unknown function DUF214  41.44 
 
 
780 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000592859  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1806  protein of unknown function DUF214  40.5 
 
 
790 aa  580  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0925  protein of unknown function DUF214  41.15 
 
 
794 aa  582  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1102  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4621  protein of unknown function DUF214  40.2 
 
 
791 aa  566  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2089  protein of unknown function DUF214  38.63 
 
 
794 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0927  protein of unknown function DUF214  41.02 
 
 
797 aa  562  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1215  protein of unknown function DUF214  40.2 
 
 
791 aa  560  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4850  protein of unknown function DUF214  39.07 
 
 
791 aa  551  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0898255  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3271  protein of unknown function DUF214  39.62 
 
 
795 aa  552  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  0.0322761 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  38.34 
 
 
770 aa  548  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4622  protein of unknown function DUF214  42.24 
 
 
802 aa  542  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.498775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1450  protein of unknown function DUF214  39.5 
 
 
789 aa  542  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.264856  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4858  protein of unknown function DUF214  38.75 
 
 
809 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0512952 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  37.28 
 
 
795 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  39.47 
 
 
788 aa  534  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5137  protein of unknown function DUF214  38.61 
 
 
792 aa  532  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.11243 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0658  protein of unknown function DUF214  38.1 
 
 
793 aa  529  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442095  normal  0.737711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  38.5 
 
 
813 aa  526  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1804  protein of unknown function DUF214  37.95 
 
 
802 aa  524  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4843  protein of unknown function DUF214  38.24 
 
 
786 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.235798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  38.01 
 
 
795 aa  506  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0931  protein of unknown function DUF214  36.42 
 
 
804 aa  493  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4615  protein of unknown function DUF214  37.96 
 
 
807 aa  493  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2156  protein of unknown function DUF214  37.34 
 
 
797 aa  495  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.777664  normal  0.702076 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1120  protein of unknown function DUF214  36.98 
 
 
811 aa  487  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00406203  normal  0.905875 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0957  protein of unknown function DUF214  37.78 
 
 
785 aa  486  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439448  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5545  protein of unknown function DUF214  36.34 
 
 
788 aa  486  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.366096  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  37.14 
 
 
792 aa  482  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4595  protein of unknown function DUF214  37.35 
 
 
800 aa  482  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5675  protein of unknown function DUF214  36.22 
 
 
789 aa  478  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  35.28 
 
 
810 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1539  protein of unknown function DUF214  35.1 
 
 
804 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0958  protein of unknown function DUF214  36.53 
 
 
797 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00075656  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  36.56 
 
 
798 aa  468  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4614  protein of unknown function DUF214  35.02 
 
 
801 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.122129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4847  protein of unknown function DUF214  37.36 
 
 
818 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.119483  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  36.74 
 
 
793 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5424  protein of unknown function DUF214  35.82 
 
 
803 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00458607  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3433  protein of unknown function DUF214  33.74 
 
 
809 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560491  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4627  protein of unknown function DUF214  34.85 
 
 
795 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689235 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6082  protein of unknown function DUF214  35.7 
 
 
802 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165381  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4844  protein of unknown function DUF214  33.94 
 
 
793 aa  432  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357668  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  35 
 
 
805 aa  435  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4624  protein of unknown function DUF214  35.54 
 
 
811 aa  428  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  34.8 
 
 
805 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2206  protein of unknown function DUF214  34.18 
 
 
777 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215529 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4630  protein of unknown function DUF214  33.98 
 
 
816 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0944  protein of unknown function DUF214  34.75 
 
 
803 aa  419  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.74129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4861  protein of unknown function DUF214  34.68 
 
 
798 aa  416  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0960  protein of unknown function DUF214  34.43 
 
 
803 aa  412  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000834077  normal  0.437277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  33.5 
 
 
806 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0948  protein of unknown function DUF214  33.82 
 
 
797 aa  408  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  33.01 
 
 
805 aa  409  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1753  protein of unknown function DUF214  34.8 
 
 
801 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4368  protein of unknown function DUF214  33.05 
 
 
800 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.129517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2464  protein of unknown function DUF214  33.46 
 
 
792 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427191  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  33.17 
 
 
816 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4598  protein of unknown function DUF214  33.21 
 
 
784 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665219  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2084  protein of unknown function DUF214  33.09 
 
 
801 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.326443  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4610  protein of unknown function DUF214  33.62 
 
 
798 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.22275 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3637  protein of unknown function DUF214  32.38 
 
 
834 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000286021  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2744  protein of unknown function DUF214  33.74 
 
 
799 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  30.89 
 
 
802 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0928  protein of unknown function DUF214  32.72 
 
 
800 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  32.08 
 
 
808 aa  383  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  32.4 
 
 
804 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4616  protein of unknown function DUF214  32 
 
 
807 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.413807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4859  protein of unknown function DUF214  31.86 
 
 
792 aa  379  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0508357 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7257  protein of unknown function DUF214  32.76 
 
 
798 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506744  normal  0.498638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2178  protein of unknown function DUF214  31.68 
 
 
790 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.424889 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0932  protein of unknown function DUF214  32.77 
 
 
816 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3774  protein of unknown function DUF214  31.47 
 
 
791 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779669  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0946  protein of unknown function DUF214  32.17 
 
 
811 aa  357  3.9999999999999996e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0636154  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4619  protein of unknown function DUF214  31.89 
 
 
817 aa  355  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3658  protein of unknown function DUF214  31.53 
 
 
803 aa  348  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0492574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0603  protein of unknown function DUF214  32.05 
 
 
809 aa  347  6e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.237353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5431  protein of unknown function DUF214  30.87 
 
 
800 aa  336  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4618  protein of unknown function DUF214  30.61 
 
 
808 aa  335  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.154299 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4494  protein of unknown function DUF214  29.18 
 
 
784 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0599884 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3701  protein of unknown function DUF214  30.94 
 
 
814 aa  326  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000785399  unclonable  0.0000000000000250396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4642  protein of unknown function DUF214  30.5 
 
 
801 aa  326  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000162597  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4899  protein of unknown function DUF214  28.59 
 
 
802 aa  325  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000216897  normal  0.089059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4121  protein of unknown function DUF214  29.45 
 
 
789 aa  316  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0606813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4607  protein of unknown function DUF214  30.62 
 
 
811 aa  310  5e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.727239 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0943  protein of unknown function DUF214  29.67 
 
 
802 aa  308  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4639  protein of unknown function DUF214  30.35 
 
 
791 aa  305  3.0000000000000004e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4700  ABC transporter, permease protein  29.91 
 
 
836 aa  303  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3505  ABC transporter, permease protein  27.7 
 
 
804 aa  301  4e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.084112  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0473  hypothetical protein  28.11 
 
 
807 aa  298  4e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0330  acetylornithine deacetylase ArgE  29.95 
 
 
835 aa  293  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.277971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1651  protein of unknown function DUF214  27.12 
 
 
800 aa  288  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.9714 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0472  hypothetical protein  27.36 
 
 
807 aa  288  2.9999999999999996e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1329  hypothetical protein  26.21 
 
 
809 aa  280  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2599  protein of unknown function DUF214  28.95 
 
 
812 aa  270  8.999999999999999e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>