More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4899 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4899  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
802 aa  1642    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000216897  normal  0.089059 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4844  protein of unknown function DUF214  34.04 
 
 
793 aa  514  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357668  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1753  protein of unknown function DUF214  36.72 
 
 
801 aa  508  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0948  protein of unknown function DUF214  35.12 
 
 
797 aa  492  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2744  protein of unknown function DUF214  35.16 
 
 
799 aa  468  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4624  protein of unknown function DUF214  33.09 
 
 
811 aa  469  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4595  protein of unknown function DUF214  32.89 
 
 
800 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1120  protein of unknown function DUF214  33.14 
 
 
811 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00406203  normal  0.905875 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0960  protein of unknown function DUF214  30.99 
 
 
803 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000834077  normal  0.437277 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  32.14 
 
 
798 aa  389  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0935  protein of unknown function DUF214  31.87 
 
 
785 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  31.47 
 
 
793 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  29.87 
 
 
808 aa  386  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4614  protein of unknown function DUF214  31.55 
 
 
801 aa  383  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.122129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0931  protein of unknown function DUF214  31.61 
 
 
804 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  32.26 
 
 
813 aa  383  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  28.73 
 
 
805 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  31.62 
 
 
810 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1450  protein of unknown function DUF214  31.92 
 
 
789 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.264856  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2206  protein of unknown function DUF214  31.98 
 
 
777 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215529 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  30.34 
 
 
806 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  32.46 
 
 
795 aa  379  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1539  protein of unknown function DUF214  31.53 
 
 
804 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0936  protein of unknown function DUF214  30.82 
 
 
793 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146106  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  30.42 
 
 
804 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0958  protein of unknown function DUF214  29.43 
 
 
797 aa  368  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00075656  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  30.36 
 
 
792 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  31.2 
 
 
795 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5545  protein of unknown function DUF214  30.12 
 
 
788 aa  365  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.366096  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4616  protein of unknown function DUF214  30.64 
 
 
807 aa  365  3e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.413807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4843  protein of unknown function DUF214  30.58 
 
 
786 aa  363  5.0000000000000005e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.235798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4627  protein of unknown function DUF214  30.72 
 
 
795 aa  362  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689235 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  30.4 
 
 
784 aa  359  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5675  protein of unknown function DUF214  30.82 
 
 
789 aa  357  5e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4615  protein of unknown function DUF214  30.65 
 
 
807 aa  353  7e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2156  protein of unknown function DUF214  31.36 
 
 
797 aa  350  5e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.777664  normal  0.702076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6082  protein of unknown function DUF214  31.06 
 
 
802 aa  349  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165381  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4861  protein of unknown function DUF214  29.83 
 
 
798 aa  349  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4847  protein of unknown function DUF214  30.48 
 
 
818 aa  348  3e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.119483  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  29.99 
 
 
788 aa  347  6e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0959  protein of unknown function DUF214  31.33 
 
 
780 aa  347  6e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000592859  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2084  protein of unknown function DUF214  30.27 
 
 
801 aa  346  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.326443  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  29.37 
 
 
770 aa  344  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  30.8 
 
 
805 aa  343  5e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4598  protein of unknown function DUF214  29.52 
 
 
784 aa  343  8e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665219  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0957  protein of unknown function DUF214  28.69 
 
 
785 aa  342  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439448  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4368  protein of unknown function DUF214  28.89 
 
 
800 aa  339  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.129517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2089  protein of unknown function DUF214  29.75 
 
 
794 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  28.18 
 
 
816 aa  334  5e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3637  protein of unknown function DUF214  27.38 
 
 
834 aa  332  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000286021  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3658  protein of unknown function DUF214  29.04 
 
 
803 aa  331  3e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0492574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  28.89 
 
 
805 aa  330  6e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4622  protein of unknown function DUF214  29.5 
 
 
802 aa  326  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.498775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4630  protein of unknown function DUF214  29.61 
 
 
816 aa  325  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  28 
 
 
802 aa  323  8e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3701  protein of unknown function DUF214  29.03 
 
 
814 aa  321  3e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000785399  unclonable  0.0000000000000250396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4618  protein of unknown function DUF214  28.14 
 
 
808 aa  317  8e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.154299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0928  protein of unknown function DUF214  30.5 
 
 
800 aa  316  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2853  protein of unknown function DUF214  27.7 
 
 
792 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0317184  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0603  protein of unknown function DUF214  29.36 
 
 
809 aa  313  9e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.237353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4610  protein of unknown function DUF214  29.65 
 
 
798 aa  312  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.22275 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0943  protein of unknown function DUF214  28.64 
 
 
802 aa  311  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3271  protein of unknown function DUF214  28.69 
 
 
795 aa  310  5.9999999999999995e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  0.0322761 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4619  protein of unknown function DUF214  29.81 
 
 
817 aa  310  8e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3433  protein of unknown function DUF214  27.02 
 
 
809 aa  308  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560491  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0925  protein of unknown function DUF214  30.25 
 
 
794 aa  307  4.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1102  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0929  protein of unknown function DUF214  28.89 
 
 
791 aa  306  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0932  protein of unknown function DUF214  27.81 
 
 
816 aa  306  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4858  protein of unknown function DUF214  29.07 
 
 
809 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0512952 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1215  protein of unknown function DUF214  27.16 
 
 
791 aa  305  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2464  protein of unknown function DUF214  29.56 
 
 
792 aa  303  6.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427191  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0946  protein of unknown function DUF214  27.18 
 
 
811 aa  302  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0636154  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4621  protein of unknown function DUF214  29.21 
 
 
791 aa  301  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0944  protein of unknown function DUF214  27.78 
 
 
803 aa  302  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.74129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1804  protein of unknown function DUF214  28.87 
 
 
802 aa  301  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1806  protein of unknown function DUF214  29.36 
 
 
790 aa  300  6e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4850  protein of unknown function DUF214  28.95 
 
 
791 aa  300  9e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0898255  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3774  protein of unknown function DUF214  27.49 
 
 
791 aa  293  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779669  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5431  protein of unknown function DUF214  28.37 
 
 
800 aa  292  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3610  protein of unknown function DUF214  28.59 
 
 
789 aa  292  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.251487  hitchhiker  0.000460877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4494  protein of unknown function DUF214  28.5 
 
 
784 aa  292  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0599884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7257  protein of unknown function DUF214  27.33 
 
 
798 aa  288  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506744  normal  0.498638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4642  protein of unknown function DUF214  27.71 
 
 
801 aa  288  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000162597  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4607  protein of unknown function DUF214  30.07 
 
 
811 aa  283  7.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.727239 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0927  protein of unknown function DUF214  27.99 
 
 
797 aa  283  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4121  protein of unknown function DUF214  27.7 
 
 
789 aa  279  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0606813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4859  protein of unknown function DUF214  28.02 
 
 
792 aa  278  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0508357 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0658  protein of unknown function DUF214  27.51 
 
 
793 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442095  normal  0.737711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5137  protein of unknown function DUF214  27.65 
 
 
792 aa  270  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.11243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2178  protein of unknown function DUF214  25.6 
 
 
790 aa  268  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.424889 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5424  protein of unknown function DUF214  27.98 
 
 
803 aa  266  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00458607  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3505  ABC transporter, permease protein  25.89 
 
 
804 aa  257  7e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.084112  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1651  protein of unknown function DUF214  24.49 
 
 
800 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.9714 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0472  hypothetical protein  24.76 
 
 
807 aa  255  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1329  hypothetical protein  26.02 
 
 
809 aa  255  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1760  protein of unknown function DUF214  26.19 
 
 
798 aa  251  5e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962231  normal  0.806233 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0330  acetylornithine deacetylase ArgE  27.52 
 
 
835 aa  250  7e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.277971 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4700  ABC transporter, permease protein  26.09 
 
 
836 aa  250  9e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0955  protein of unknown function DUF214  24.07 
 
 
799 aa  239  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3764  protein of unknown function DUF214  26.11 
 
 
714 aa  229  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>