More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2978 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1450  protein of unknown function DUF214  49.18 
 
 
789 aa  771    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.264856  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  45.89 
 
 
770 aa  674    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4622  protein of unknown function DUF214  56.29 
 
 
802 aa  877    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.498775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2156  protein of unknown function DUF214  45.22 
 
 
797 aa  676    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.777664  normal  0.702076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0936  protein of unknown function DUF214  51.89 
 
 
793 aa  815    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146106  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  45.4 
 
 
795 aa  696    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4843  protein of unknown function DUF214  47.92 
 
 
786 aa  738    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.235798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0935  protein of unknown function DUF214  49.87 
 
 
785 aa  753    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
788 aa  1618    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0931  protein of unknown function DUF214  41.26 
 
 
804 aa  602  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5545  protein of unknown function DUF214  41 
 
 
788 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.366096  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  39.37 
 
 
784 aa  569  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3271  protein of unknown function DUF214  38.22 
 
 
795 aa  556  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  0.0322761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2089  protein of unknown function DUF214  37.72 
 
 
794 aa  557  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  39.83 
 
 
810 aa  550  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  38.63 
 
 
805 aa  547  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0929  protein of unknown function DUF214  38.09 
 
 
791 aa  546  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1215  protein of unknown function DUF214  37.52 
 
 
791 aa  548  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5675  protein of unknown function DUF214  39.17 
 
 
789 aa  544  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4615  protein of unknown function DUF214  40.51 
 
 
807 aa  543  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0927  protein of unknown function DUF214  39.38 
 
 
797 aa  541  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  39.17 
 
 
805 aa  535  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0925  protein of unknown function DUF214  38.38 
 
 
794 aa  535  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1102  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2853  protein of unknown function DUF214  37.5 
 
 
792 aa  532  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0317184  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2464  protein of unknown function DUF214  38.28 
 
 
792 aa  527  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427191  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5137  protein of unknown function DUF214  38.05 
 
 
792 aa  527  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.11243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  38.16 
 
 
813 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1120  protein of unknown function DUF214  38.62 
 
 
811 aa  523  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00406203  normal  0.905875 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  38.31 
 
 
795 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4614  protein of unknown function DUF214  38.11 
 
 
801 aa  514  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.122129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0959  protein of unknown function DUF214  38.04 
 
 
780 aa  512  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000592859  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0658  protein of unknown function DUF214  38.28 
 
 
793 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442095  normal  0.737711 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1804  protein of unknown function DUF214  35.72 
 
 
802 aa  512  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3610  protein of unknown function DUF214  39.47 
 
 
789 aa  511  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.251487  hitchhiker  0.000460877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0957  protein of unknown function DUF214  37.97 
 
 
785 aa  509  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439448  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  37.48 
 
 
792 aa  509  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1806  protein of unknown function DUF214  36.17 
 
 
790 aa  507  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4621  protein of unknown function DUF214  37.58 
 
 
791 aa  505  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4595  protein of unknown function DUF214  38.68 
 
 
800 aa  505  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4850  protein of unknown function DUF214  37.26 
 
 
791 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0898255  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1539  protein of unknown function DUF214  38.87 
 
 
804 aa  499  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4858  protein of unknown function DUF214  35.26 
 
 
809 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0512952 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4847  protein of unknown function DUF214  38.53 
 
 
818 aa  497  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.119483  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  37.08 
 
 
793 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4627  protein of unknown function DUF214  38.07 
 
 
795 aa  486  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689235 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  37.5 
 
 
798 aa  486  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0958  protein of unknown function DUF214  36.12 
 
 
797 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00075656  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4861  protein of unknown function DUF214  36.45 
 
 
798 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6082  protein of unknown function DUF214  35.88 
 
 
802 aa  463  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165381  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2206  protein of unknown function DUF214  35.92 
 
 
777 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215529 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0948  protein of unknown function DUF214  34.96 
 
 
797 aa  456  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3433  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
809 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560491  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4630  protein of unknown function DUF214  36.39 
 
 
816 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4844  protein of unknown function DUF214  35.27 
 
 
793 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357668  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2744  protein of unknown function DUF214  33.17 
 
 
799 aa  439  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1753  protein of unknown function DUF214  34.43 
 
 
801 aa  441  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  34.07 
 
 
805 aa  439  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  34.27 
 
 
816 aa  435  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4598  protein of unknown function DUF214  34.58 
 
 
784 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665219  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4616  protein of unknown function DUF214  33.98 
 
 
807 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.413807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2084  protein of unknown function DUF214  33.54 
 
 
801 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.326443  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5424  protein of unknown function DUF214  33.66 
 
 
803 aa  425  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00458607  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0946  protein of unknown function DUF214  34.54 
 
 
811 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0636154  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0944  protein of unknown function DUF214  34.87 
 
 
803 aa  413  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.74129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4610  protein of unknown function DUF214  34.44 
 
 
798 aa  416  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.22275 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0960  protein of unknown function DUF214  33.78 
 
 
803 aa  415  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000834077  normal  0.437277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  33.7 
 
 
806 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  31.28 
 
 
802 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3658  protein of unknown function DUF214  32.92 
 
 
803 aa  403  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0492574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0928  protein of unknown function DUF214  34.15 
 
 
800 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4624  protein of unknown function DUF214  32.97 
 
 
811 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0603  protein of unknown function DUF214  32.56 
 
 
809 aa  389  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.237353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4859  protein of unknown function DUF214  31.64 
 
 
792 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0508357 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7257  protein of unknown function DUF214  33.13 
 
 
798 aa  386  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506744  normal  0.498638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0932  protein of unknown function DUF214  31.8 
 
 
816 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  31.95 
 
 
808 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4619  protein of unknown function DUF214  32.65 
 
 
817 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4368  protein of unknown function DUF214  30.77 
 
 
800 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.129517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3637  protein of unknown function DUF214  31.05 
 
 
834 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000286021  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3774  protein of unknown function DUF214  31.26 
 
 
791 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779669  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2178  protein of unknown function DUF214  31.99 
 
 
790 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.424889 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  32.64 
 
 
804 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3701  protein of unknown function DUF214  31.62 
 
 
814 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000785399  unclonable  0.0000000000000250396 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3505  ABC transporter, permease protein  30.39 
 
 
804 aa  366  1e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.084112  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4494  protein of unknown function DUF214  31.47 
 
 
784 aa  349  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0599884 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4899  protein of unknown function DUF214  29.99 
 
 
802 aa  347  6e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000216897  normal  0.089059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4642  protein of unknown function DUF214  30.45 
 
 
801 aa  340  4e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000162597  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4700  ABC transporter, permease protein  29.51 
 
 
836 aa  340  5.9999999999999996e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4618  protein of unknown function DUF214  28.5 
 
 
808 aa  336  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.154299 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5431  protein of unknown function DUF214  30.24 
 
 
800 aa  336  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4607  protein of unknown function DUF214  31.02 
 
 
811 aa  335  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.727239 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1329  hypothetical protein  28.59 
 
 
809 aa  329  1.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0472  hypothetical protein  27.47 
 
 
807 aa  317  4e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0330  acetylornithine deacetylase ArgE  28.89 
 
 
835 aa  312  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.277971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4121  protein of unknown function DUF214  29.19 
 
 
789 aa  312  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0606813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1651  protein of unknown function DUF214  26.84 
 
 
800 aa  310  5e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.9714 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2599  protein of unknown function DUF214  29.27 
 
 
812 aa  306  1.0000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0473  hypothetical protein  27.28 
 
 
807 aa  305  3.0000000000000004e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0943  protein of unknown function DUF214  29.27 
 
 
802 aa  300  5e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1760  protein of unknown function DUF214  29.07 
 
 
798 aa  298  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962231  normal  0.806233 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>