More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2853 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  52.65 
 
 
784 aa  855    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3610  protein of unknown function DUF214  50 
 
 
789 aa  753    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.251487  hitchhiker  0.000460877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2853  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
792 aa  1626    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0317184  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0925  protein of unknown function DUF214  42.59 
 
 
794 aa  637    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1102  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0929  protein of unknown function DUF214  41.05 
 
 
791 aa  632  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2089  protein of unknown function DUF214  41.45 
 
 
794 aa  631  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0927  protein of unknown function DUF214  43.46 
 
 
797 aa  622  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4621  protein of unknown function DUF214  41.35 
 
 
791 aa  613  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0935  protein of unknown function DUF214  41.18 
 
 
785 aa  611  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3271  protein of unknown function DUF214  41.65 
 
 
795 aa  608  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  0.0322761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4850  protein of unknown function DUF214  41.1 
 
 
791 aa  593  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0898255  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5137  protein of unknown function DUF214  42.3 
 
 
792 aa  589  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.11243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0936  protein of unknown function DUF214  41.35 
 
 
793 aa  588  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146106  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1806  protein of unknown function DUF214  39.95 
 
 
790 aa  591  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1804  protein of unknown function DUF214  39.78 
 
 
802 aa  585  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4858  protein of unknown function DUF214  38.42 
 
 
809 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0512952 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1215  protein of unknown function DUF214  39.38 
 
 
791 aa  568  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0658  protein of unknown function DUF214  39.17 
 
 
793 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442095  normal  0.737711 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1450  protein of unknown function DUF214  39.05 
 
 
789 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.264856  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  39.41 
 
 
795 aa  565  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  38.92 
 
 
770 aa  558  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0959  protein of unknown function DUF214  39.6 
 
 
780 aa  558  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000592859  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4622  protein of unknown function DUF214  38.99 
 
 
802 aa  537  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.498775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5545  protein of unknown function DUF214  36.78 
 
 
788 aa  534  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.366096  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  37.5 
 
 
788 aa  532  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4843  protein of unknown function DUF214  36.9 
 
 
786 aa  524  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.235798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  37.37 
 
 
813 aa  518  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4615  protein of unknown function DUF214  38.51 
 
 
807 aa  514  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5675  protein of unknown function DUF214  35.53 
 
 
789 aa  514  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1539  protein of unknown function DUF214  37.41 
 
 
804 aa  507  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5424  protein of unknown function DUF214  38 
 
 
803 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00458607  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1120  protein of unknown function DUF214  36.53 
 
 
811 aa  496  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00406203  normal  0.905875 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  37.64 
 
 
792 aa  496  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4614  protein of unknown function DUF214  35.68 
 
 
801 aa  493  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.122129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2156  protein of unknown function DUF214  37.07 
 
 
797 aa  490  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.777664  normal  0.702076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  36.92 
 
 
805 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0931  protein of unknown function DUF214  35.79 
 
 
804 aa  485  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  34.54 
 
 
810 aa  479  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2206  protein of unknown function DUF214  37.19 
 
 
777 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  36.62 
 
 
793 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4595  protein of unknown function DUF214  36.05 
 
 
800 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0957  protein of unknown function DUF214  36.53 
 
 
785 aa  476  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439448  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  34.57 
 
 
795 aa  469  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  33.98 
 
 
805 aa  461  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4627  protein of unknown function DUF214  35.55 
 
 
795 aa  461  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689235 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3433  protein of unknown function DUF214  34.61 
 
 
809 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560491  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4847  protein of unknown function DUF214  36.68 
 
 
818 aa  459  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.119483  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0948  protein of unknown function DUF214  35.99 
 
 
797 aa  453  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2744  protein of unknown function DUF214  36.54 
 
 
799 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  34.79 
 
 
805 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0958  protein of unknown function DUF214  35.48 
 
 
797 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00075656  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4861  protein of unknown function DUF214  36.11 
 
 
798 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  33.83 
 
 
806 aa  433  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4844  protein of unknown function DUF214  34.15 
 
 
793 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357668  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1753  protein of unknown function DUF214  35.6 
 
 
801 aa  436  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0960  protein of unknown function DUF214  34.5 
 
 
803 aa  429  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000834077  normal  0.437277 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  33.54 
 
 
798 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2464  protein of unknown function DUF214  34.24 
 
 
792 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427191  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6082  protein of unknown function DUF214  34.28 
 
 
802 aa  423  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165381  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  34.11 
 
 
804 aa  426  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  33.45 
 
 
816 aa  411  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2084  protein of unknown function DUF214  31.79 
 
 
801 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.326443  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  31.71 
 
 
802 aa  409  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  32.44 
 
 
808 aa  405  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4630  protein of unknown function DUF214  32.17 
 
 
816 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0944  protein of unknown function DUF214  33.74 
 
 
803 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.74129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4624  protein of unknown function DUF214  34.09 
 
 
811 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4616  protein of unknown function DUF214  32.05 
 
 
807 aa  399  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.413807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3637  protein of unknown function DUF214  30.91 
 
 
834 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000286021  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4368  protein of unknown function DUF214  32.25 
 
 
800 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.129517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0928  protein of unknown function DUF214  34.79 
 
 
800 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4610  protein of unknown function DUF214  33.01 
 
 
798 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.22275 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4619  protein of unknown function DUF214  33.09 
 
 
817 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0946  protein of unknown function DUF214  32.62 
 
 
811 aa  383  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0636154  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4598  protein of unknown function DUF214  30.7 
 
 
784 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665219  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0932  protein of unknown function DUF214  32.01 
 
 
816 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3701  protein of unknown function DUF214  31.53 
 
 
814 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000785399  unclonable  0.0000000000000250396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3658  protein of unknown function DUF214  30.85 
 
 
803 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0492574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7257  protein of unknown function DUF214  30.84 
 
 
798 aa  364  4e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506744  normal  0.498638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2178  protein of unknown function DUF214  30.99 
 
 
790 aa  360  8e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.424889 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3774  protein of unknown function DUF214  31.81 
 
 
791 aa  352  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779669  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4859  protein of unknown function DUF214  30.51 
 
 
792 aa  352  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0508357 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4494  protein of unknown function DUF214  30.97 
 
 
784 aa  347  7e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0599884 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4618  protein of unknown function DUF214  29.41 
 
 
808 aa  346  8.999999999999999e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.154299 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0603  protein of unknown function DUF214  31.34 
 
 
809 aa  342  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.237353 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0472  hypothetical protein  29.43 
 
 
807 aa  326  1e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4642  protein of unknown function DUF214  28.9 
 
 
801 aa  324  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000162597  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1651  protein of unknown function DUF214  27.24 
 
 
800 aa  320  7e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.9714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4121  protein of unknown function DUF214  30.01 
 
 
789 aa  318  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0606813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5431  protein of unknown function DUF214  28.28 
 
 
800 aa  316  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4899  protein of unknown function DUF214  27.7 
 
 
802 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000216897  normal  0.089059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0943  protein of unknown function DUF214  29.53 
 
 
802 aa  311  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0473  hypothetical protein  28.83 
 
 
807 aa  311  2.9999999999999997e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4607  protein of unknown function DUF214  29.55 
 
 
811 aa  310  5.9999999999999995e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.727239 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2599  protein of unknown function DUF214  27.33 
 
 
812 aa  300  7e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4700  ABC transporter, permease protein  29.87 
 
 
836 aa  296  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4639  protein of unknown function DUF214  29.45 
 
 
791 aa  294  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0330  acetylornithine deacetylase ArgE  29.41 
 
 
835 aa  291  4e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.277971 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1329  hypothetical protein  27.62 
 
 
809 aa  285  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0955  protein of unknown function DUF214  27.5 
 
 
799 aa  283  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>