144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0685 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  50.62 
 
 		 819 aa  636    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  49.7 
 
 		 825 aa  691    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  62.68 
 
 		 820 aa  952    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  51.17 
 
 		 815 aa  646    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  66.26 
 
 		 821 aa  935    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  67.24 
 
 		 821 aa  964    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  66.87 
 
 		 821 aa  965    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  64.88 
 
 		 819 aa  978    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  65.41 
 
 		 821 aa  978    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  100 
 
 		 820 aa  1593    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  50.99 
 
 		 819 aa  647    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  50.37 
 
 		 820 aa  641    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  49.94 
 
 		 826 aa  633  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  46.86 
 
 		 800 aa  625  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  50.8 
 
 		 819 aa  621  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  48.95 
 
 		 802 aa  597  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  52.88 
 
 		 795 aa  597  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  51.04 
 
 		 800 aa  592  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  48.77 
 
 		 793 aa  586  1e-166  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1541  ABC transporter inner membrane protein  51.47 
 
 		 795 aa  559  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0192  hypothetical protein  51.77 
 
 		 795 aa  548  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431471  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  42.05 
 
 		 804 aa  462  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  32.15 
 
 		 817 aa  333  9e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  29.72 
 
 		 817 aa  319  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  29.84 
 
 		 817 aa  314  4.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  30.37 
 
 		 836 aa  311  2e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  30.35 
 
 		 836 aa  274  4.0000000000000004e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  29.07 
 
 		 840 aa  265  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  28.8 
 
 		 884 aa  264  6e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  28.44 
 
 		 889 aa  263  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  29.78 
 
 		 836 aa  263  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  28.71 
 
 		 889 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  29.87 
 
 		 887 aa  260  8e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  28.32 
 
 		 879 aa  258  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  29.51 
 
 		 887 aa  256  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  29.86 
 
 		 889 aa  246  9e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  26.68 
 
 		 865 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  30 
 
 		 850 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  30 
 
 		 845 aa  241  5.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  28.09 
 
 		 897 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  27.32 
 
 		 849 aa  234  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  28.69 
 
 		 878 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  28.8 
 
 		 849 aa  231  5e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  30.38 
 
 		 839 aa  228  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  27.34 
 
 		 847 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  27 
 
 		 855 aa  214  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  27.11 
 
 		 850 aa  213  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  25.69 
 
 		 803 aa  211  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  26.8 
 
 		 847 aa  209  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  30.21 
 
 		 845 aa  203  9e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  29.86 
 
 		 837 aa  202  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  27.66 
 
 		 870 aa  200  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  27.63 
 
 		 866 aa  196  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0310  hypothetical protein  29.99 
 
 		 753 aa  190  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  29.89 
 
 		 843 aa  186  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1579  ABC-type transporter protein  25.51 
 
 		 813 aa  181  7e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15291  normal  0.104036 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  30.47 
 
 		 843 aa  165  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01331  hypothetical protein  26.47 
 
 		 929 aa  129  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  24.57 
 
 		 858 aa  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2956  putative ABC transport system permease protein  29.11 
 
 		 872 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  23.37 
 
 		 851 aa  115  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  32.3 
 
 		 846 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  23.41 
 
 		 855 aa  110  9.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  24.6 
 
 		 850 aa  105  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  24.64 
 
 		 858 aa  104  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  33.75 
 
 		 842 aa  97.8  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  25.18 
 
 		 846 aa  95.9  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  24.94 
 
 		 855 aa  95.1  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  33.03 
 
 		 842 aa  88.2  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  24.86 
 
 		 857 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  24.82 
 
 		 867 aa  85.5  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  24.87 
 
 		 844 aa  82.8  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  24.61 
 
 		 857 aa  80.1  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  24.49 
 
 		 853 aa  77.4  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  26.43 
 
 		 877 aa  73.2  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  29.12 
 
 		 842 aa  72.4  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  25.71 
 
 		 877 aa  71.6  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  24.49 
 
 		 843 aa  69.7  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  32.02 
 
 		 841 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  22.89 
 
 		 849 aa  67.4  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  24.58 
 
 		 884 aa  65.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  23.12 
 
 		 849 aa  63.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  24.48 
 
 		 847 aa  63.2  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  30.16 
 
 		 852 aa  62.4  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  26.01 
 
 		 835 aa  61.2  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  26.01 
 
 		 835 aa  61.2  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  30.61 
 
 		 834 aa  60.1  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  24.65 
 
 		 866 aa  60.1  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  24.3 
 
 		 841 aa  58.9  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  21.99 
 
 		 855 aa  58.2  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  26.6 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  24.16 
 
 		 848 aa  56.2  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  26.76 
 
 		 821 aa  55.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003992  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  23.26 
 
 		 374 aa  54.3  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  24.13 
 
 		 854 aa  53.5  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  25.73 
 
 		 827 aa  51.6  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.870248 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01112  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  29.07 
 
 		 399 aa  50.8  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.822017  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2531  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  29.07 
 
 		 399 aa  50.8  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000306464  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1496  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolC  29.07 
 
 		 399 aa  50.8  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000126096  normal  0.823464 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2010  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolC  29.07 
 
 		 399 aa  50.8  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366068  normal  0.0307144 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>