80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0310 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0310  hypothetical protein  100 
 
 
753 aa  1464    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  28.72 
 
 
800 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  29.77 
 
 
820 aa  192  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  28.62 
 
 
821 aa  190  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  27.7 
 
 
821 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  30.44 
 
 
820 aa  187  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  28.79 
 
 
793 aa  184  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  30.41 
 
 
802 aa  179  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  30.12 
 
 
819 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  29.78 
 
 
804 aa  174  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  30.17 
 
 
819 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  29.5 
 
 
819 aa  154  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  26.33 
 
 
825 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  22.92 
 
 
817 aa  125  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  26.87 
 
 
836 aa  125  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  32.36 
 
 
820 aa  124  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  25.04 
 
 
817 aa  122  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  26.33 
 
 
836 aa  119  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  30.84 
 
 
821 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  30.28 
 
 
800 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  22.73 
 
 
836 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  28.9 
 
 
821 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  24.77 
 
 
865 aa  114  9e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  26.14 
 
 
889 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1541  ABC transporter inner membrane protein  30.77 
 
 
795 aa  112  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  33.64 
 
 
819 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  25.03 
 
 
884 aa  111  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  29.5 
 
 
815 aa  110  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  25 
 
 
866 aa  109  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  26.78 
 
 
887 aa  108  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  25.4 
 
 
879 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0192  hypothetical protein  30.86 
 
 
795 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431471  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  24.92 
 
 
855 aa  108  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  25.67 
 
 
840 aa  108  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  24.85 
 
 
889 aa  107  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  25.45 
 
 
889 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  26.43 
 
 
817 aa  107  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  24.29 
 
 
850 aa  105  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  29.48 
 
 
837 aa  100  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  25.13 
 
 
887 aa  100  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  29.52 
 
 
843 aa  99.8  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  27.08 
 
 
839 aa  97.8  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2956  putative ABC transport system permease protein  26.69 
 
 
872 aa  96.3  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  24.75 
 
 
897 aa  96.3  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  29.91 
 
 
826 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1579  ABC-type transporter protein  21.69 
 
 
813 aa  95.1  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15291  normal  0.104036 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  26.97 
 
 
878 aa  94.4  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  25.49 
 
 
849 aa  93.2  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  22.73 
 
 
847 aa  90.9  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  23.99 
 
 
870 aa  90.1  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  21.8 
 
 
849 aa  90.1  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  23.69 
 
 
845 aa  89.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01331  hypothetical protein  21.04 
 
 
929 aa  87.8  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  21.15 
 
 
803 aa  85.5  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  23.99 
 
 
847 aa  77.8  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  28.79 
 
 
842 aa  77.4  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  24.51 
 
 
850 aa  76.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  23.57 
 
 
858 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  27.2 
 
 
843 aa  72  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  25.32 
 
 
848 aa  70.1  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  21.31 
 
 
851 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  27.52 
 
 
842 aa  70.1  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  27.96 
 
 
842 aa  68.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  25.5 
 
 
845 aa  66.2  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  29.72 
 
 
795 aa  63.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  22.91 
 
 
855 aa  62.4  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  22.76 
 
 
858 aa  58.9  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  24.11 
 
 
408 aa  57  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  22.47 
 
 
852 aa  50.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  27.18 
 
 
843 aa  48.9  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  22.25 
 
 
835 aa  47  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  22.25 
 
 
835 aa  47  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  23.98 
 
 
841 aa  47.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  32.19 
 
 
835 aa  47  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  27.32 
 
 
788 aa  46.6  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  32.87 
 
 
846 aa  46.2  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  23.01 
 
 
854 aa  46.6  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2307  hypothetical protein  32 
 
 
656 aa  45.8  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00102704  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  23.63 
 
 
846 aa  45.8  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  24.22 
 
 
844 aa  45.4  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>