107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02648 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  69.28 
 
 		 836 aa  1171    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  100 
 
 		 817 aa  1666    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  56.3 
 
 		 817 aa  942    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  91.06 
 
 		 817 aa  1533    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  29.4 
 
 		 819 aa  293  9e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  29.51 
 
 		 820 aa  290  8e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  28.34 
 
 		 889 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  28.38 
 
 		 879 aa  282  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  28.27 
 
 		 889 aa  280  8e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  28.65 
 
 		 840 aa  279  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  28.1 
 
 		 884 aa  278  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  27.9 
 
 		 865 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  28.72 
 
 		 849 aa  267  7e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  29.55 
 
 		 825 aa  264  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  29.84 
 
 		 820 aa  261  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  28.26 
 
 		 897 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  27.71 
 
 		 878 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  30.08 
 
 		 815 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  28.69 
 
 		 821 aa  254  6e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  29.98 
 
 		 821 aa  252  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  28.15 
 
 		 821 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  28.97 
 
 		 887 aa  251  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  26.73 
 
 		 836 aa  249  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  27.95 
 
 		 887 aa  248  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  26.96 
 
 		 836 aa  247  6.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  28.38 
 
 		 800 aa  244  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  28.98 
 
 		 845 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  27.71 
 
 		 889 aa  238  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  29.44 
 
 		 850 aa  238  4e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  28.23 
 
 		 850 aa  233  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  25.65 
 
 		 849 aa  228  5.0000000000000005e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  29.07 
 
 		 800 aa  223  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  30.33 
 
 		 802 aa  216  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  29.18 
 
 		 804 aa  211  6e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  24.39 
 
 		 803 aa  207  8e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  25.67 
 
 		 847 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  27.16 
 
 		 793 aa  195  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  26.24 
 
 		 837 aa  190  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  25.96 
 
 		 847 aa  185  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1541  ABC transporter inner membrane protein  30.37 
 
 		 795 aa  184  6e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1579  ABC-type transporter protein  24.03 
 
 		 813 aa  181  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15291  normal  0.104036 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  24.62 
 
 		 855 aa  181  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0192  hypothetical protein  30.37 
 
 		 795 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431471  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  24.67 
 
 		 866 aa  160  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  24.79 
 
 		 870 aa  157  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  35.5 
 
 		 826 aa  146  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  30.93 
 
 		 821 aa  145  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  26.11 
 
 		 843 aa  139  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  29.33 
 
 		 846 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2956  putative ABC transport system permease protein  29.72 
 
 		 872 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  29.89 
 
 		 819 aa  128  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  29.44 
 
 		 819 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  21.87 
 
 		 858 aa  124  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  30.08 
 
 		 820 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  30.33 
 
 		 819 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  32.96 
 
 		 795 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  26.14 
 
 		 841 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  25.36 
 
 		 842 aa  111  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  22.98 
 
 		 857 aa  111  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  25.57 
 
 		 842 aa  107  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01331  hypothetical protein  23.99 
 
 		 929 aa  107  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  25.57 
 
 		 842 aa  107  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  22.76 
 
 		 846 aa  106  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  25.85 
 
 		 843 aa  105  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  22.54 
 
 		 857 aa  100  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  21.05 
 
 		 858 aa  99.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0310  hypothetical protein  25.96 
 
 		 753 aa  95.9  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  22.61 
 
 		 855 aa  95.5  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  21.22 
 
 		 884 aa  92.4  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  30.64 
 
 		 845 aa  90.1  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  26.57 
 
 		 839 aa  85.9  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  25.81 
 
 		 408 aa  79.7  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  22.04 
 
 		 868 aa  72.4  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  22.06 
 
 		 844 aa  70.5  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  20.09 
 
 		 851 aa  65.9  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  24.01 
 
 		 855 aa  63.9  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  22.29 
 
 		 877 aa  63.5  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  22.43 
 
 		 852 aa  60.8  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  24.11 
 
 		 853 aa  59.3  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  32.43 
 
 		 867 aa  58.2  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  22.29 
 
 		 866 aa  56.6  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0386  hypothetical protein  22.34 
 
 		 422 aa  55.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.574376  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  21.39 
 
 		 839 aa  55.5  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  20.59 
 
 		 861 aa  54.7  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  21.43 
 
 		 387 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  22.65 
 
 		 835 aa  52.4  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  22.65 
 
 		 835 aa  52.4  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  23.65 
 
 		 877 aa  52  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  20.07 
 
 		 854 aa  50.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0770  hypothetical protein  25.68 
 
 		 425 aa  49.3  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.534854  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  21.14 
 
 		 825 aa  48.9  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  20.74 
 
 		 841 aa  48.5  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  20.28 
 
 		 855 aa  48.1  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2748  protein of unknown function DUF214  26.34 
 
 		 786 aa  47.8  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.076782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  20.68 
 
 		 858 aa  47.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0199  hypothetical protein  22.06 
 
 		 851 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.61 
 
 		 420 aa  47.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1776  hypothetical protein  22.55 
 
 		 383 aa  47  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  20.29 
 
 		 842 aa  47.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  20.98 
 
 		 857 aa  47.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>