105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04771 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  43.86 
 
 		 865 aa  655    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  42.61 
 
 		 879 aa  647    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  47.01 
 
 		 850 aa  677    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  42.73 
 
 		 889 aa  653    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  100 
 
 		 836 aa  1686    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  46.54 
 
 		 849 aa  674    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  44.9 
 
 		 845 aa  642    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  41.92 
 
 		 889 aa  639    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  48.39 
 
 		 840 aa  704    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  42.15 
 
 		 884 aa  642    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  96.05 
 
 		 836 aa  1554    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  43.32 
 
 		 897 aa  626  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  43.07 
 
 		 887 aa  627  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  42.12 
 
 		 887 aa  626  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  43.15 
 
 		 878 aa  626  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  43.22 
 
 		 889 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  28.3 
 
 		 817 aa  303  9e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  30.39 
 
 		 819 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  28.42 
 
 		 836 aa  273  7e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  30.22 
 
 		 820 aa  272  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  26.64 
 
 		 817 aa  268  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  26.35 
 
 		 817 aa  265  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  30.42 
 
 		 821 aa  260  9e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2956  putative ABC transport system permease protein  39.9 
 
 		 872 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  30.29 
 
 		 821 aa  249  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  29.64 
 
 		 821 aa  240  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  29.16 
 
 		 821 aa  239  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  29.6 
 
 		 820 aa  233  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  29.73 
 
 		 800 aa  231  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  29.98 
 
 		 793 aa  214  4.9999999999999996e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  29.08 
 
 		 800 aa  212  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  27.59 
 
 		 850 aa  202  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  30.93 
 
 		 802 aa  201  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1579  ABC-type transporter protein  26.63 
 
 		 813 aa  199  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15291  normal  0.104036 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  25.69 
 
 		 803 aa  187  6e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  24.85 
 
 		 847 aa  174  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  24.83 
 
 		 855 aa  171  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  25.75 
 
 		 847 aa  171  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  33.78 
 
 		 820 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  26.27 
 
 		 870 aa  153  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  32.84 
 
 		 825 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  25.21 
 
 		 866 aa  148  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  33.24 
 
 		 819 aa  147  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  33.79 
 
 		 819 aa  146  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  32.63 
 
 		 819 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  35.99 
 
 		 826 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  32.84 
 
 		 815 aa  127  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  30.99 
 
 		 843 aa  125  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0310  hypothetical protein  27.4 
 
 		 753 aa  122  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01331  hypothetical protein  25 
 
 		 929 aa  121  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  28.61 
 
 		 837 aa  120  9e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  30.59 
 
 		 804 aa  120  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  27.09 
 
 		 849 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1541  ABC transporter inner membrane protein  31.13 
 
 		 795 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0192  hypothetical protein  31.52 
 
 		 795 aa  111  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431471  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  27.37 
 
 		 846 aa  110  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  31.13 
 
 		 795 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  22.79 
 
 		 857 aa  100  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  29.04 
 
 		 843 aa  99  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  26.06 
 
 		 839 aa  98.6  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  27.15 
 
 		 845 aa  97.4  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  27.81 
 
 		 842 aa  90.9  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  21.38 
 
 		 858 aa  89.7  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  23.26 
 
 		 855 aa  89.4  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  22.2 
 
 		 855 aa  87.8  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  27.71 
 
 		 842 aa  83.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  20.24 
 
 		 851 aa  83.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  27.71 
 
 		 842 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  26.65 
 
 		 841 aa  82.4  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  22.25 
 
 		 884 aa  82.4  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  22.54 
 
 		 858 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  20.78 
 
 		 850 aa  74.3  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  21.23 
 
 		 867 aa  73.9  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  21.04 
 
 		 866 aa  70.9  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  22.66 
 
 		 844 aa  64.7  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  24.2 
 
 		 848 aa  63.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  22.43 
 
 		 849 aa  59.7  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  22.81 
 
 		 408 aa  60.1  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  22.73 
 
 		 868 aa  58.2  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  25.43 
 
 		 845 aa  57  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  23 
 
 		 847 aa  56.6  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  23.1 
 
 		 853 aa  56.6  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  22.69 
 
 		 849 aa  56.6  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  23.91 
 
 		 855 aa  55.5  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  25.24 
 
 		 877 aa  55.1  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  23.66 
 
 		 877 aa  53.9  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  21.9 
 
 		 857 aa  52  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0795  ABC transporter, permease protein  23.76 
 
 		 422 aa  50.8  0.00009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.372785  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  20.68 
 
 		 843 aa  50.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  31.34 
 
 		 413 aa  49.7  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.09 
 
 		 817 aa  49.3  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  21.63 
 
 		 861 aa  48.5  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  24.18 
 
 		 857 aa  48.1  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  20.89 
 
 		 846 aa  47.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  21.41 
 
 		 835 aa  47.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  21.41 
 
 		 835 aa  47.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  21.65 
 
 		 834 aa  47.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  28.68 
 
 		 423 aa  46.2  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3649  protein of unknown function DUF214  21.59 
 
 		 839 aa  46.2  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0664  cell division protein FtsZ  26.14 
 
 		 387 aa  45.4  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000217072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>