More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3628 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  76.44 
 
 		 857 aa  1221    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  58.61 
 
 		 855 aa  924    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  100 
 
 		 858 aa  1670    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  77.78 
 
 		 846 aa  1220    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  46.16 
 
 		 844 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  42.11 
 
 		 884 aa  517  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  43.29 
 
 		 857 aa  513  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  44.36 
 
 		 868 aa  511  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  43.5 
 
 		 877 aa  479  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  43.61 
 
 		 877 aa  475  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  42.58 
 
 		 867 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  43.33 
 
 		 853 aa  459  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  42.82 
 
 		 866 aa  458  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  43.16 
 
 		 855 aa  456  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  42.08 
 
 		 835 aa  457  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  42.08 
 
 		 835 aa  457  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  44.74 
 
 		 408 aa  253  8.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  28.24 
 
 		 850 aa  231  6e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  32.53 
 
 		 842 aa  230  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  26.93 
 
 		 849 aa  224  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  32.4 
 
 		 841 aa  223  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  26.41 
 
 		 870 aa  215  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  27.31 
 
 		 847 aa  211  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  32.04 
 
 		 842 aa  210  7e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  30.42 
 
 		 837 aa  210  8e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  30.94 
 
 		 842 aa  208  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  26.66 
 
 		 855 aa  206  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  29.74 
 
 		 843 aa  203  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  27.64 
 
 		 847 aa  203  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2155  protein of unknown function DUF214  40.11 
 
 		 445 aa  200  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.755011  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  26.13 
 
 		 866 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  26.76 
 
 		 858 aa  184  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  27.99 
 
 		 839 aa  169  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  24.97 
 
 		 851 aa  141  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  25.06 
 
 		 850 aa  139  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  34.21 
 
 		 843 aa  127  8.000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  30.21 
 
 		 845 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  25.38 
 
 		 855 aa  109  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  24.82 
 
 		 847 aa  109  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  25.74 
 
 		 853 aa  108  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  28.1 
 
 		 846 aa  107  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  27.76 
 
 		 849 aa  105  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  25.43 
 
 		 848 aa  105  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  22.46 
 
 		 817 aa  104  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  26.49 
 
 		 819 aa  103  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  21.29 
 
 		 817 aa  98.2  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  21.79 
 
 		 836 aa  97.8  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  25.9 
 
 		 821 aa  97.8  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  26.8 
 
 		 849 aa  97.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  22.68 
 
 		 855 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  26.25 
 
 		 863 aa  94  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  24.56 
 
 		 887 aa  92.8  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  21.63 
 
 		 817 aa  92  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  23.08 
 
 		 850 aa  91.7  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  23.13 
 
 		 843 aa  90.5  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  25 
 
 		 887 aa  89.4  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  29.11 
 
 		 819 aa  87.8  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  27.37 
 
 		 859 aa  87  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  22.42 
 
 		 879 aa  87  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  35.71 
 
 		 871 aa  87.4  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  22.41 
 
 		 845 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  23.68 
 
 		 840 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  25.23 
 
 		 820 aa  86.3  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  22.49 
 
 		 889 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  24.6 
 
 		 889 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  22.84 
 
 		 889 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  24.63 
 
 		 821 aa  85.1  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  29.38 
 
 		 819 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  23.87 
 
 		 842 aa  82.4  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  22.13 
 
 		 884 aa  81.3  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  25.83 
 
 		 855 aa  80.9  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  23.15 
 
 		 834 aa  80.5  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  22.32 
 
 		 897 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  27.18 
 
 		 855 aa  79.3  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  29.3 
 
 		 853 aa  79  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  22.73 
 
 		 878 aa  78.2  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  31.76 
 
 		 852 aa  77.4  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  26.24 
 
 		 845 aa  76.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  22.76 
 
 		 800 aa  75.5  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  26.83 
 
 		 827 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5621  protein of unknown function DUF214  25.42 
 
 		 843 aa  72.8  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.458246  normal  0.150773 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  29.57 
 
 		 820 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  26.42 
 
 		 853 aa  72.4  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  27.61 
 
 		 821 aa  71.6  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0348  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.51 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  24.73 
 
 		 854 aa  71.2  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  25.53 
 
 		 826 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  23.19 
 
 		 880 aa  69.7  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0384  lipoprotein releasing system transmembrane protein  25.25 
 
 		 413 aa  70.1  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1252  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.63 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.368874  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  26.38 
 
 		 806 aa  68.6  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4731  protein of unknown function DUF214  27.87 
 
 		 842 aa  68.6  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  24.55 
 
 		 835 aa  68.2  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1372  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.71 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  28.91 
 
 		 856 aa  67.8  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2669  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.63 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  22.99 
 
 		 836 aa  67.4  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  25.68 
 
 		 878 aa  67.4  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2196  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.06 
 
 		 426 aa  67  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00714902  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3743  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.87 
 
 		 410 aa  67.4  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14534  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>